Как отрастить волосы: проверенные способы
Какая женщина хоть раз в жизни не мечтала о красивых длинных волосах? Вряд ли такая найдется. Как бы ни была красива короткая стрижка или прическа на волосы средней длины, иногда хочется стать обладательницей шелковистой и длинной шевелюры, которая приводила бы в восторг всех окружающих и вызывала бы зависть у других женщин.
Необходимость отрастить волосы быстро возникает в нескольких случаях:
- Когда просто захотелось для разнообразия походить с длинными волосами.
- Когда в парикмахерской вам сотворили совсем не то, чего вы хотели. Или не в парикмахерской, а если, например, вы сами ошиблись во время окрашивания. Этот вариант наиболее печален, т.к. ситуацию нужно спасать быстро. Ну кому же захочется ходить с зеленой шевелюрой?
В Сети представлено огромное количество методов, которые могут помочь отрастить волосы быстро. Там есть и натуральные средства, и дорогие салонные, и аппаратные.
Средство номер один: маска из горчицы
Пожалуй, один из самых распространенных рецептов, который обещает просто бешеный рост волос. Существуют разные его вариации. Основа — это горчичный порошок, который необходимо минут на 10-15 залить горячей водой. Консистенция должна быть как у сметаны. Далее можно добавить масло, яичный желток, витамины в ампулах и т.п. А можно и ничего не добавлять. И намазать смесь по проборам на всю кожу головы. Важно наносить смесь только на кожу, а всю длину волос лучше смазать маслом, т.к. горчица сушит волосы. Через минут 10-15 (в зависимости от качества горчичного порошка) у вас начнет печь кожа головы.
Некоторые советуют стоически терпеть, кто-то в ужасе бежит смывать чудо-смесь. Я могу сказать следующее: если вы чувствуете приятное тепло и небольшое жжение, можно минут 15 потерпеть — ничего страшного не случится, и волосы не вылезут.
Наоборот, кровь поступит к волосистой части головы и рост волос несколько ускорится. Если же жжение просто невыносимое, конечно нужно смыть смесь и в следующий раз брать меньше горчицы. Иначе можно пересушить кожу головы и даже получить мини-ожог. Делать такие маски нужно раз в неделю регулярно. На какой результат можно рассчитывать? Примерно +30% от привычной скорости роста волос. Да-да, именно так. Конечно, приятно верить обещаниям, что у вас тут же вырастет 5 см волос, но давайте быть реалистами. 5 см волос в месяц — это уже серьезная проблема, если волосы у вас растут со скоростью в 1,5-2 см в месяц. Но на дополнительный сантиметр в месяц рассчитывать можете. А это, ни много ни мало, плюс 12 см за год.
Средство номер два: никотиновая кислота
Никотинка тоже невероятно популярна в Интернете. О ней отзыв не написал только ленивый. Причем, кому-то она очень ускоряет рост волос, а кому-то «приносит» перхоть. Тут все индивидуально, имеет смысл попробовать. Рост волос она действительно может ускорить, так же, как и другие средства — плюс 30-40%.
Применение никотинки для роста волос: открываете ампулу (предварительно обмотайте ее салфеткой, чтобы не пораниться стеклом) и наносите ее содержимое по проборам на всю волосистую часть головы.
Это можно делать с помощью шприца без иголки. Не переживайте, если на какой-то участок никотиновая кислота не попала — средство все равно будет равномерно распределено благодаря движению крови. И ни в коем случае не хватайте вторую ампулу — у вас может начаться сильное головокружение. Не переусердствуйте.
Наносить никотинку имеет смысл только на чистые волосы (кожу головы, если точнее). Она имеет специфический запах, но за несколько применений вы привыкнете. Что касается периодичности использования — применяйте ее каждый раз после того, как помоете и высушите волосы. Если не хотите использовать ее перед выходом, делайте это, когда придете домой – так и запах не помешает, и эффект будет. Втирать никотинку для роста волос нужно минут 5 легкими массажными движениями. Эффект заметите уже через месяц. Ну а если из-за применения никотиновой кислоты для роста волос у вас начнет чесаться кожа головы и появится перхоть, значит, вам данный метод не подходит. Но не отчаивайтесь, т.к. есть в нашем арсенале еще много действенных средств.
Средство номер три: массаж головы
Да, такое, казалось бы, простое средство может ускорить рост волос. Опять же, за счет того, что во время массажа кровь будет приливать к голове, а вместе с кровью ведь разносятся питательные вещества, которые так необходимы вашим волосяным луковичкам. Не ленитесь, массаж не займет у вас больше 15 минут в день. Смотрите фильм — помассируйте кожу головы, это и приятно, и полезно.
Средство номер четыре: Дарсонваль
Тоже хороший и, главное, зарекомендовавший себя способ. Дарсонваль — это аппарат, который генерирует ток, который, в свою очередь, стимулирует рост волос. Мы не будем подробно останавливаться на конструкции аппарата, при желании, ее можно найти в Интернете. Дарсонваль применяют не только для волос, поэтому к нему есть несколько насадок: для кожи, для различных полостей и, собственно, гребешок (который нам и нужен). Пользоваться Дарсонвалем просто, нужно всего 10 минут времени каждый день или через день. Необходимо расчесываться насадкой-гребешком, отрегулировав силу тока. Эффект будет заметен уже через месяц в виде выросшего «ежика», ускорения роста волос и уменьшения их выпадения.
Конечно, у Дарсонваля, как и у любого другого прибора, есть противопоказания. Поэтому перед тем, как приступить к применению, обязательно ознакомьтесь с ними и проконсультируйтесь с врачом. И, конечно же, необязательно сразу же бежать и покупать прибор — вполне можно сначала сходить на несколько сеансов дарсонвализации в поликлинику или косметологический кабинет, чтобы понять, нравится ли вам эта процедура и эффективна ли она для вас.
Средство номер пять: солевой пилинг кожи головы
Этот способ хорош и сам по себе, и как вспомогательное средство во время применения других методов ускорения роста волос. На коже головы, точно так же, как и на коже тела или лица, со временем скапливается большое количество ороговевших частичек, мертвых клеток, а также кожного жира. И эти скопления затрудняют рост новых волос. Поэтому очень важно периодически скрабировать кожу головы, а соль — это отличное средство для скрабирования. Стоит взять мелкую соль, т.к. крупная поцарапает вам кожу. Нанести соль по проборам и помассировать кожу минут 10. Важно, чтобы движения были плавными — не нужно тереть голову, как будто вы хотите снять скальп. Через 10 минут смойте соль теплой водой.
Сбалансированное питание и витамины
Этому пункту мы не будем присваивать какой-либо номер, т.к. его важно соблюдать постоянно. Питайтесь правильно. Для этого лучше всего подойдет растительная пища. Она обеспечит ваш организм всеми необходимыми питательными веществами. Если в организме не хватает строительного материала, то скорость роста волос будет оставлять желать лучшего. Что же касается приема специальных витаминных комплексов — в этом вопросе посоветуйтесь с врачом. В любом случае, лучше всего усваиваются витамины, которые поступают с пищей. Поэтому питайтесь правильно, обеспечивая свой организм всеми необходимыми веществами, применяйте некоторые из вышеперечисленных способов ускорения роста волос, и уже через несколько месяцев вы увидите результаты своих трудов.
Никотиновая кислота для волос 5 мл 10 шт.
Краткое описание
Внешний вид: прозрачная бесцветная жидкость, без запаха. Никотиновая кислота является витамином, необходимым организму для окислительных реакций, метаболизма, транспортировки водорода, тканевого дыхания, биосинтеза и глипогенолиза. При нанесении на кожу головы никотиновая кислота (витамин РР) расширяет периферические кровеносные сосуды, усиливая кровообращение, улучшает транспортировку кислорода и полезных микроэлементов, усиливает в тканях процессы обмена веществ, что препятствует выпадению волос и стимулирует их ускоренный рост.
- пробуждает спящие волосяные луковицы и способствует росту волос, стимулируя микроциркуляцию;
- восстанавливает и регенерирует поврежденные луковицы;
- предотвращает выпадение волос, укрепляя корни и противодействуя уплотнению коллагена вокруг корня волоса;
- способствует выработке меланина — пигмента, который делает локоны блестящими, сохраняет их цвет, предотвращает преждевременное появление седины.
Показания
Восстанавливает поврежденные волосяные луковицы , укрепляет корни, стимулирует рост волос
Способ применения и дозировка
Тюбик-капельницу вскройте непосредственно перед применением. Содержимое тюбик-капельницы нанесите на кожу головы, равномерно распределяя средство по всей поверхности кожи головы массирующими движениями непосредственно после мытья. Не смывайте нанесенное средство. Легкое покалывание и покраснение кожи головы после нанесения средства обусловлено усилением микроциркуляции и является нормальным. Применяйте средство 1 раз в 3 дня. Рекомендуемый курс — 14 процедур. Курс можно повторять раз в 3 месяца. Раствор должен быть использован сразу после вскрытия тюбик-капельницы. После однократного применения вскрытую неиспользованную «Никотиновую кислоту для волос» необходимо утилизировать.
Противопоказания
Нет данных о противопоказаниях.
Особые указания
Перед применением небольшое количество средства нанесите на локтевой сгиб для выявления индивидуальной непереносимости.
Состав
Состав: вода очищенная, никотиновая кислота 10 мг/мл, натрия гидрокарбонат. Форма выпуска По 2, 5, 10 мл в тюбик-капельницы с клапаном. 10 тюбик-капельниц по 2 мл или 5, 10 тюбик-капельниц по 5, 10 мл с инструкцией по применению помещают в пачку из картона.
Условия хранения
class=»h4-mobile»>Витамины в дерматологии. Обзорная статья — ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Минздрава России
К витаминам относят группу органических соединений, имеющихся в малых количествах в клетках и катализирующих различные химические реакции. Известно, что практически все гиповитаминозы сопровождаются теми или иными изменениями кожи и ее придатков. В дерматовенерологии витамины и их различные комплексы используются для неспецифической иммуномодулирующей терапии, которая изменяет взаимоотношения организма с этиопатогенетическими факторами и лекарственными препаратами, применяющимися для лечения данного заболевания.
Витамины подразделяют на два класса:
- водорастворимые: тиамин, рибофлавин, никотиновая кислота, пантотеновая кислота, пиридоксин, фолиевая кислота, кобаламин, аскорбиновая кислота, биотин,
- жирорастворимые: ретинол, кальциферол, токоферол, филлохинон.
Водорастворимые витамины
Тиамин (витамин В1) контролирует важнейшие процессы энергообразования и биосинтеза веществ живой клетки. Этот витамин участвует в обмене углеводов, нуклеиновых кислот, белков, липидов. Действие тиамина характеризуют как гипосенсибилизирующее, обезболивающее, противозудное, противовоспалительное; он стимулирует детоксикационную функцию печени, оказывает благоприятное влияние на состояние центральной нервной системы. Тиамин стимулирует меланогенез, а также синтез элементов соединительной ткани. Сообщается об изменении при дефиците в организме тиамина перекисного окисления липидов; в частности, установлено повышение проницаемости лизосомальных и плазматических мембран лейкоцитов. Существуют наблюдения об участии тиамина в иммунологических реакциях. Действие этого витамина реализуется путем активации биосинтеза нуклеиновых кислот и белков, лежащего в основе пролиферации как тимоцитов, так и костномозговых клеток. При дефиците тиамина угнетается как клеточный, так и гуморальный иммунитет.
Тиамин рекомендуют при экземе, псориазе, красной волчанке, при заболеваниях с фотосенсибилизацией — фотодерматозах: порфириновой болезни, красной волчанке, пеллагре; а также нейродермите, почесухе, хронической крапивнице, кожном зуде, себорее, красном плоском лишае, при вовлечении в патологический процесс периферической нервной системы у больных с опоясывающим лишаем, лепрой, а также в комплексном лечении витилиго, круговидного и себорейного выпадения волос, ознобления, хейлитов, обыкновенных угрей, пиодермии, кандидоза.
С другой стороны, врач-дерматолог в своей практике может столкнуться и с отрицательными эффектами витамина В1, обусловленными аллергическими реакциями: крапивницей, кожным зудом, отеком Квинке, эритродермией. Проявлением повышенной чувствительности к тиамину в условиях его производства является и контактный дерматит.
Рибофлавин (витамин В2) участвует в процессах энергетического обмена. Он входит в состав ферментов тканевого дыхания, оказывает влияние на обмен нуклеиновых кислот, белков, углеводов, липидов. Этот витамин оказывает благоприятное влияние на процессы роста, регенерации и трофики тканей, тесно связан с обменом ряда других витаминов, стимулирует фагоцитоз, меланогенез.
При недостаточности в организме рибофлавина плохо заживают раны и трофические язвы.
Препараты рибофлавина эффективны в комплексе с другими средствами при хейлитах, ангулярном и афтозном стоматите, глоссите, при трещинах губ, себорейном дерматите, алопеции, розацеа, фотодерматозах, псориазе, экземе, нейродермите, почесухе, обыкновенных угрях, стрептодермии. Витамин В2 показан при длительном применении антибиотиков, сульфаниламидов, гормонов, противомалярийных препаратов, которые нередко применяются в дерматологии. Стимулирующее влияние рибофлавина при трофических нарушениях в тканях, а также его участие в процессе регенерации позволяют использовать этот витамин для лечения ожогов.
Никотиновая кислота (витамин РР или В3) входит в состав ферментов окислительно-восстановительных реакций, влияет на обмен углеводов, липидов, белков, снижает содержание глюкозы в крови, улучшает функциональное состояние ЦНС, печени и желудка, участвует в репаративных процессах кожи.
При недостатке никотиновой кислоты развивается пеллагра (итал. pelle — кожа, agro — шероховатый). Основные проявления пеллагры — фотодерматит и воспалительные поражения слизистой оболочки полости рта и языка. Дерматит располагается преимущественно на открытых участках. Эритематозный в остром периоде, он сопровождается зудом или жжением. Затем в течение 2 — 3 недель он становится сухим и чешуйчатым, кожа утолщается. Воротник Касаля — термин, используемый для описания резко очерченных кожных поражений, которые образуются вокруг шеи, напоминая ожерелье. Кожные поражения возникают также на участках костных выступов и на лице. Кожные симптомы пеллагры при добавлении в рацион никотиновой кислоты быстро исчезают по центробежному типу. Снижение содержания в организме никотиновой кислоты установлено при псориазе, экземе, фотодерматозах.
Благодаря сосудорасширяющему действию никотиновой кислоты ее с успехом используют для лечения озноблений, хронического атрофического акродермита, болезни Рейно и склеродермии, а вследствие благоприятного влияния на состояние нервной системы и функцию печени — для лечения экземы, нейродермита, почесухи, красного плоского лишая, псориаза. Фотодесенсибилизирующее действие витамина РР позволяет применять его при фотодерматозах, а благоприятное влияние на функциональное состояние пищеварительного тракта — при красных угрях. Благодаря способности этого витамина предупреждать и уменьшать токсические явления его рекомендуют назначать при длительном приеме высоких доз антибиотиков, сульфаниламидов, антималярийных препаратов, а также в сочетании с другими лекарственными средствами — при хейлитах, стоматитах. Применение никотиновой кислоты дает хороший эффект при вяло заживающих ранах и язвах. Никотиновую кислоту назначают для получения феномена воспламенения при диагностике сифилитической розеолы и лепрозной эритемы.
Больным, страдающим аллергическими дерматозами, в период резко выраженного аллергического состояния (аллергический дерматит, экзема, крапивница) препарат назначать не следует. Из побочных явлений отмечают покраснение кожи лица и верхней половины туловища, повышение температуры кожи, иногда зуд и уртикарные элементы.
Пантотеновая кислота (витамин В5). Установлено, что пантотеновая кислота принимает участие в обмене углеводов, жиров, белков, участвует в окислительно-восстановительных процессах, в меланогенезе.
Пантотеновая кислота используется в дерматологической практике как дерматопротектор, т. к. обладает регенерирующим и противовоспалительным действием. Применяется в лечении атопического дерматита, экземы, трофических язв, ожогов, герпеса, алопеции и дерматозов различной этиологии.
Пиридоксин (витамин В6)катализирует процессы, регулирующие обмен нуклеиновых кислот, белков, жиров, углеводов.
Дефицит пиридоксина приводит к развитию анемии, функциональных изменений в ЦНС, себорейного дерматита, глоссита, хейлита, выпадению волос.
Витамин В6 применяют для лечения дерматозов, при которых определяется значительный недостаток пиридоксина в организме, — себорее, стоматитах, псориазе, склеродермии, опоясывающем лишае, фотодерматозах, атопическом дерматите.
Препарат показан больным, страдающим нейродермитом, экземой. Пиридоксин предупреждает и уменьшает токсические явления у лиц, длительно принимающих высокие дозы антибиотиков, противомалярийных и противотуберкулезных препаратов.
Установлен положительный клинический эффект у пациентов с обыкновенными угрями, для лечения которых применяли косметический крем, содержащий 0,5% пиридоксальфосфата.
Использование препарата в дерматологической практике при псориазе, экземе, нейродермите связано с его способностью стимулировать обменные процессы в коже и слизистых оболочках. У больных псориазом применение пиридоксальфосфата патогенетически обосновано дефицитом пиридоксина и нарушением обмена триптофана на уровне В6-зависимого фермента.
Возможны аллергические реакции на пиридоксин — кожный зуд, крапивница, токсикодермии.
Фолиевая кислота (витамин В9). Фолиевая кислота играет важную роль в обмене серина, глицина, гистидина, биосинтезе молекул ДНК и РНК. Существенное значение имеет она и для нормального течения процессов роста, развития, пролиферации тканей, меланогенеза.
Назначение фолиевой кислоты сопровождается клиническим эффектом при псориазе, солнечной крапивнице, почесухе, поздней кожной порфирии, розацеа, хейлитах, гиперкератозах, герпетиформном дерматите, пиодермии, акне, лучевых поражениях кожи, а также при продолжительном применении цитостатиков, антибиотиков, сульфаниламидов. Так, сочетание метотрексата с фолиевой кислотой при лечении больных псориазом существенно снижает частоту развития таких серьезных побочных эффектов, как анемия, лейкопения, тромбоцитопения.
Фолиевую кислоту относят к витаминам, для которых характерна выраженная токсичность, так как даже однократное введение ее человеку в дозе более 100 мг вызывает симптомы, напоминающие отравление гистамином — резкое покраснение лица, зудящая пятнисто-папулезная сыпь и др. Положительные в ряде случаев кожные пробы свидетельствуют об аллергической природе таких явлений.
Кобаламин (витамин B12). Установлена способность кобаламина повышать неспецифическую сопротивляемость к бактериальным инфекциям. Одной из основ механизма иммуномодулирующего действия этого витамина считают его воздействие на обмен нуклеиновых кислот и белков.
Витамин В12 с успехом применяется при псориазе, фотодерматозах, герпетиформном дерматите, нейродермите.
При введении кобаламина возможны аллергические реакции в виде крапивницы и отека Квинке. Сочетанное применение кобаламина с тиамином чаще вызывает развитие аллергических реакций, чем раздельное. При выраженном гиперергическом состоянии в периоде обострения экземы и нейродермита назначение кобаламина способно усиливать аллергическую реактивность, поэтому в острой стадии дерматозов следует избегать применения этого витамина. Аналогичная тактика целесообразна при прогрессирующей стадии псориаза, псориатической эритродермии и артропатической его форме.
Аскорбиновая кислота (витамин С) участвует в образовании соединительной ткани, обмене белков, углеводов, липидов, синтезе гормонов коры надпочечников, нуклеиновых кислот, благоприятно влияет на регенеративные процессы, регулирует пигментный обмен в коже, стимулирует антитоксическую функцию печени, деятельность желез внутренней секреции, способствует адаптационным способностям организма. Препараты аскорбиновой кислоты характеризуются антитоксическим, гипосенсибилизирующим, противовоспалительным, антигиалуронидазным действием. In vitro выявлена бактериостатическая и бактерицидная роль витамина С по отношению к стафилококку и стрептококку.
Дефицит витамина С приводит к нарушению Т-системы иммунитета и менее значительным отклонениям гуморального иммунитета. Широко известен факт меланодермии при С-авитаминозе. Нарушение синтеза коллагена при авитаминозе выражается в плохом заживлении ран.
Положительное действие аскорбиновой кислоты отмечено при воспалительных, дегенеративных и других патологических процессах кожи. Назначение аскорбиновой кислоты целесообразно при токсикодермиях, аллергических дерматитах, экземе, нейродермите, почесухе, хронической крапивнице, красном плоском лишае, фотодерматозах, васкулитах, пузырчатке, стоматитах, глосситах, хроническом атрофическом акродерматите, хронической пиодермии, обыкновенных угрях, круговидном облысении, микозах стоп, а также при продолжительном применении кортикостероидных препаратов и антималярийных средств. В терапии заболеваний, проявляющихся сосудистой патологией кожи, эффективность возрастает при сочетании аскорбиновой кислоты и рутина.
Биотин (витамин Н) — это органическая кислота, которая участвует в многочисленных реакциях карбоксилирования. Дефицит биотина сопровождается алопецией, сухостью, чешуйчатостью кожи (себорея), гиперестезией кожи, отечностью и атрофией сосочков языка.
Применяется в лечении атопического дерматита, псориаза, экземы, алопеции, себореи. Хороший клинический эффект получен при лечении высокими дозами биотина acne vulgaris.
Жирорастворимые витамины
Витамин А (ретинол). По многообразию реакций, в которых участвует ретинол, он стоит на первом месте среди витаминов. Ретинол влияет на процессы размножения и роста, окислительно-восстановительные процессы, обмен белков, углеводов, липидов, синтез кортикостероидов и половых гормонов, нуклеиновых кислот. Ретинол участвует в регенерации эпителиальных тканей, регулирует процессы кератогенеза. Установлена такая важная функция ретинола, как поддержание стабильности плазматических и субклеточных мембран. В то же время гипервитаминоз ретинола приводит к сдвигам в активности фосфолипаз, играющих важную роль в изменениях состава биомембран. Установлены антиоксидантные свойства ретинола. Отмечают способности витамина оказывать иммуномодулирующее действие. Этот витамин вызывает относительное и абсолютное увеличение содержание В-лимфоцитов в периферической крови. При дефиците ретинола угнетается антителоообразование. Известна способность этого витамина снимать иммунодепрессивное влияние глюкокортикоидов.
Дефицит ретинола в организме закономерно проявляется нарушением процессов ороговения кожи и слизистых оболочек, особенно полости рта; отмечаются ломкость ногтей, выпадение волос, фринодерма (греч. Phrynos — жаба) — фолликулярный кератоз, при котором участки ороговения окружены зоной депигментации на коже верхних отделов рук и ног. Затем он переходит на туловище, спину, живот и шею. Поражения на лице могут напоминать комедоны при воспалении сальных желез волосяных фолликулов.
Благоприятное влияние ретинола при воспалительных, дегенеративных и других патологических процессах кожи служит основанием для широкого его использования в дерматологической практике. Этот витамин эффективен при заболеваниях, сопровождающихся гипертрофией рогового слоя эпидермиса (все формы ихтиоза, фолликулярный кератоз, гиперкератозы ладоней и подошв). Его применяют при лечении дерматозов, для которых характерны нарушения процессов кератинизации (псориаз), секреторной функции сальных желез (себорея, себорейное облысение, обыкновенные угри), при поражении слизистых оболочек (лейкоплакии), дистрофии ногтей, нарушениях роста волос (сухость и повышенная ломкость, монилетрикс (лат. monile ожерелье + греч. thrix волос; — наследственная дистрофия волос, проявляющаяся чередованием веретенообразных утолщений стержня волоса с участками истончения, сухостью, ломкостью и выпадением волос. В комплексе с другими средствами ретинол оказывается полезным в лечении экземы, хронической язвенной пиодермии, трофических язв, болезни Рейно. С учетом выраженных антиоксидантных свойств ретинола успешно используется его комбинация с токоферола ацетатом и 0,5 % селеновой мазью при лечении псориаза и облысения.
Гипервитаминозы А также характеризуются дерматологическими проявлениями: сыпью, зудом, пигментацией, желтым окрашиванием кожи ладоней и стоп, замедлением заживления ран, выпадением волос. На коже могут наблюдаться себорейные высыпания, кровоточивость слизистых оболочек рта.
Ретиноиды, будучи синтетическими производными витамина А, значительно расширили терапевтические возможности при целом ряде дерматозов, в том числе тяжелых и резистентных к другим лечебным средствам. Синтетические производные ретинола — ароматические ретиноиды — в сотни раз менее токсичны своего естественного предшественника, поэтому их можно употреблять в клинике в достаточно массивных дозах в течение длительного времени. Применение в клинической практике нашли этретинат (тигазон) и 13-цис-ретиноевая кислота (изотретиоин).
Влияние ретиноидов характеризуется удивительным многообразием биологических эффектов. В практическом отношении наиболее значимым является их противоопухолевое и иммуностимулирующее действие; при назначении этих препаратов у больных существенно возрастает общее количество лимфоцитов в крови и количество Т-клеток.
В лечении различных форм угревой сыпи применяется изотретиноин (коммерческое название препарата — «роаккутан»), обладающий себостатическим эффектом (угнетает секрецию сальных желез). Из побочных явлений в период приема максимальных доз роаккутана в части случаев наблюдают повышенную сухость кожи, особенно вокруг рта, слизистых оболочек полости рта, а также дерматит кожи лица, мокнутие, зуд, обратимую алопецию.
Другой ретиноид, тигазон, благодаря своему антипролиферативному эффекту, оказался эффективным при лечении псориаза. Эффективность лечения существенно возрастает при сочетании этретината с фотохимиотерапией. Такой комплексный подход авторы рекомендуют при лечении больных распространенным, часто рецидивирующим псориазом.
Существуют данные о благоприятном клиническом результате применения тигазона при лечении больных красным плоским лишаем слизистой оболочки полости рта, подострой красной волчанкой, гиперкератотической экземой кистей и стоп, ладонно-подошвенным гиперкератозом, пустулезом ладоней и подошв, ихтиозом различных форм.
Из наиболее часто встречающихся осложнений приема тигазона отмечены сухость слизистых оболочек, зуд, выпадение волос, обильное шелушение ладоней и подошв.
Кальциферол (витамин D). Большую роль в продукции витамина D играет кожа, где он может активно синтезироваться кератиноцитами, фибробластами и макрофагами под действием УФ-лучей.
Действие витамина реализуется путем регуляции фосфорно-кальциевого обмена; он оказывает также регулирующее влияние на состояние вегетативной нервной и сосудистой систем, усиливает пото- и салоотделение, улучшает рост волос, нормализует водный обмен в коже. Во многих тканях есть рецепторы к кальцитриолу, поэтому у него предполагается наличие разнообразных функций, пока еще не изученных. Так, в последнее время установлено его активное влияние на клеточную дифференцировку в нормальных и опухолевых тканях.
Благодаря широкому спектру биохимической активности кальциферолов их используют при лечении туберкулезной волчанки, скрофулодермы, хромомикоза. В литературе описан случай, когда назначение витамина D по поводу старческого остеопороза привело к регрессу сопутствующего псориаза у больной, что послужило основанием для использования витамина D в лечении данного заболевания.
Кальциферол может вызывать острое отравление с явлениями геморрагического васкулита. При продолжительном приеме высоких доз витамина могут отмечаться гнойничковая и угревидная сыпь, общая потливость. Эти явления уменьшаются при комплексном использовании кальциферола с ретинолом, тиамином и аскорбиновой кислотой.
Токоферол (витамин Е) оказывает влияние на обмен белков, углеводов, нуклеиновых кислот и стероидов, способствует накоплению ретинола и других жирорастворимых витаминов в организме, проявляет противовоспалительное и антитромботическое действие, понижает проницаемость сосудистой стенки, выполняет роль антиоксиданта. Защита липидов от перекисного окисления — одна из наиболее изученных функций витамина Е. Так как ненасыщенные липиды являются компонентом биологических мембран, эта функция токоферола очень важна для поддержания структурной целостности и функциональной активности липопротеиновых мембран клеток и субклеточных структур. Иммуностимулирующие свойства токоферола реализуются торможением деятельности Т-супрессоров. При этом витамин Е значительно повышает активность натуральных киллеров.
Назначение витамина Е показано при ихтиозе, дерматомиозите, склеродермии, болезни Рейно, фотодерматозах, псориазе, язвенном стоматите, плохо заживающих язвах голеней, рентгеновских язвах, обыкновенных угрях, себорее, гнездном выпадении волос, а также при дерматозах, связанных с нарушением функций половых желез. Установлены хорошие клинические результаты при сочетанном назначении токоферола ацетата, ретинола и 0,5% мази селенита натрия больным, страдающим псориазом и круговидным облысением.
Витамин Е используют в дерматологии также наружно — в виде масляного концентрата, либо мази, содержащей 3 % токоферола ацетата.
Витамин К (филлохинон) участвует в свертывании крови, усиливает противовоспалительное действие стероидных гормонов, оказывает влияние на регенерацию тканей, повышает устойчивость к инфекциям, обладает болеутоляющим действием. Недостаточность витамина К приводит к развитию геморрагического синдрома.
Назначение витамина К показано при ожогах и отморожениях, лучевых поражениях, дерматозах с геморрагическим компонентом, при язвенных стоматитах, гингивитах, дерматомиозите.
Витаминоподобные соединения
Липоевая кислота (витамин F) входит в полиферментный комплекс, участвующий в декарбоксилировании пировиноградной кислоты, проявляет выраженное гепатотропное и слабое гипогликемическое действие, активирует потребление глюкозы и пирувата тканями, уменьшает содержание холестерина и общих липидов в сыворотке крови, стимулирует фосфорилирование и биосинтез белка в печени.
Установлена эффективность липоевой кислоты при псориазе, дерматозах, сопровождающихся нарушениями функции печени и липидного обмена.
При длительном применении липоевой кислоты возможны кожные аллергические реакции.
Пангамат кальция (витамин B15) оказывает влияние на липидный и углеводный обмен, повышает активность ферментов дыхательной цепи, в связи с чем заметно повышается усвоение кислорода тканями. Вследствие липотропного влияния витамина уменьшается общее содержание липидов в печени, а также холестерина, усиливается продукция глюкокортикоидов, наблюдается детоксицирующее действие.
Пангамат кальция успешно применяют при псориазе, почесухе, кожном зуде, токсикодермиях, а также для улучшения переносимости кортикостероидных и сульфаниламидных препаратов.
Рутин (витамин Р). К группе витамина Р относят ряд веществ — биофлавоноидов, обладающих способностью уменьшать проницаемость и ломкость капилляров.
Физиологическое действие витамина реализуется через эндокринные железы, посредством влияния на ферментные системы, участвующие в тканевом дыхании. Препараты витамина Р проявляют противогистаминное действие, антиоксидантные свойства. Рутин регулирует свободно-радикальный гомеостаз по нескольким механизмам. Во-первых, он нейтрализует наиболее опасные радикалы (пероксинитрит и гидроксил), во-вторых, контролирует продукцию клетками физиологически важных радикалов (супероксидов). Кроме того, рутин стимулирует выделение оксида азота, основного стимулятора расслабления мускулатуры сосудистой стенки.
При недостаточности витамина Р в организме отмечают характерные изменения в виде мелких внутрикожных кровоизлияний (петехии), которые возникают спонтанно, особенно на участках давления, и исчезают после назначения биофлавоноидов.
Применение витамина Р целесообразно при повышенной проницаемости кровеносных сосудов и их ломкости (геморрагический диатез, капилляротоксикоз). Эффективность витамина Р отмечена при токсикодермиях, аллергических дерматитах, экземе, крапивнице, васкулитах, экссудативной форме псориаза, эритродермиях, дерматозе Дюринга, лучевых дерматитах.
Одновременно с витамином Р целесообразно назначать аскорбиновую кислоту.
Метилметионинсульфония хлорид (витамин U),являясь донатором метильных групп, участвует в биотрансформации различных ксенобиотиков, а также метилировании гистамина, чем обеспечивает антигистаминный эффект. При изучении аутофлоры у работников, занятых в производстве метилметионинсульфония хлорида, было установлено значительное повышение числа микробов, увеличение числа гемолитических форм микроорганизмов, дрожжеподобных грибов. Такие изменения расценены как доказательство возможности неспецифического воздействия продуктов производства витамина на общую реактивность организма.
Витамин U оказался в известной мере эффективным средством в комплексном лечении больных псориазом, в особенности пациентов с сопутствующими заболеваниями желудочно-кишечного тракта.
Материал подготовлен врачом-дерматокосметологом Лышканец С.Н
Никотиновая кислота для волос: для роста, питания и укрепления волос, отвыпадения и перхоти. Преимущества и вред использовалия никотинки
Услышав словосочетание «никотиновая кислота», мы, как правило, сразу вспоминаем о сигаретах. На самом деле никакого отношения к табачным изделиям эта кислота не имеет. Она является витамином, который в последнее время все чаще используется женщинами, мечтающими о красоте своих локонов.
Никотиновая кислота выпускается в ампулах и представляет собой витамин РР (никотинамид или ниацинамид). В одной коробке содержится 10 ампул. Ее применяют в домашних средствах по уходу за волосами, например в масках, скрабах, шампунях.
Эффект от использования никотиновой кислоты следующий:
- ускорение роста шевелюры,
- питание и укрепление волос;
- избавление от перхоти;
- предотвращение преждевременной седины;
- прекращение выпадения волос;
Действие
Попадая на кожу, никотиновая кислота усиливает приток крови к волосяным фолликулам, в результате чего волосы получают дополнительное питание, увлажняются, усиливается их рост. Также увеличивается выработка пигмента, цвет прядей становится более глубоким и насыщенным.
Основные преимущества
К главным достоинствам никотиновой кислоты можно отнести то, что она:
- не сушит кожу;
- проста в нанесении;
- может использоваться как самостоятельно, так и в комплексе с другими полезными для волос средствами, например отварами трав.
Правила использования
Чтобы результат от никотиновой кислоты был наиболее заметен, следует запомнить некоторые рекомендации касательно ее применения.
- Для извлечения кислоты из ампул потребуется шприц с иглой. Потом иглу можно снять и выдавить содержимое шприца по пробору головы. Кончиками пальцев распределить кислоту по всей голове.
- Средство следует наносить на немного влажные волосы. Так при расчесывании витамин РР лучше распространится по всей поверхности кожи головы.
- Наносить никотиновую кислоту на волосы нужно в следующем порядке: сначала лобная часть и макушка, затем боковые части головы, височные части, затылок.
[adsence]
Вред
Чтобы никотиновая кислота принесла волосам пользу, а не вред, ознакомьтесь с некоторыми предостережениями по поводу ее использования.
- Людям с повышенным давлением лечение волос никотинкой не подойдет. Ее применение может вызвать головную боль.
- Поскольку средство способствует расширению кровеносных сосудов, оно противопоказано при кровоизлияниях и кровотечениях, которые может усилить.
- В сутки можно втирать не больше одной ампулы никотиновой кислоты, этого будет вполне достаточно. Кровь разнесет ее по всей поверхности головы.
- В случае возникновения аллергии при следующем применении кислоты попробуйте разводить ее пополам с водой. Если реакция слишком сильная, от использования никотиновой кислоты следует отказаться.
Применение
Для усиления роста волос
- Волосы вымойте и чуть подсушите.
- Вотрите одну или две ампулы никотиновой кислоты (в зависимости от длины волос) в кожу головы.
- Смывать кислоту не надо, просто высушите волосы обычным способом.
- Делайте такие процедуры каждый день в течение месяца.
Для питания шевелюры
- Разведите 1 ампулу никотиновой кислоты в 50 мл сока алоэ.
- Полученным средством смажьте волосы.
- Держите в течение двух часов, потом смойте обычным способом.
- Повторяйте такие процедуры в течение недели, после чего сделайте месячный перерыв.
После такого ухода ваши волосы станут блестящими и шелковистыми, а на ощупь – гладкими и живыми. А чтобы проверить, насколько эффективна эта кислота для роста волос, сфотографируйте вашу шевелюру в начале использования препарата и после. Результат вас приятно удивит!
: Домашний уход :: «ЖИВИ!
С ниацином, как еще называют никотиновую кислоту, делают домашние процедуры для укрепления волос и стимуляции их роста — массажи, маски, скрабы, добавляют ее и в косметику.
Надо сказать, что изначально никотиновая кислота предназначена не для косметического ухода. Это вещество (представитель группы витаминов В) прописывают для специфического лечения авитаминоза. Ольга Молчанова, заведующий отделением дерматологии, врач-дерматовенеролог, трихолог, к. м. н., Клинико-диагностического центра МЕДСИ на Белорусской. — В организме никотиновая кислота в малых количествах синтезируется в кишечнике с помощью бактериальной флоры и витаминов В6, В2 из триптофана, а также поступает с белковыми и растительными продуктами (мясо, морепродукты и рыба, орехи, грибы, некоторые сухофрукты). Основная польза ниацина для кожи и волос заключается в улучшении кровообращения и > функции крови — доставки кислорода и питательных веществ для роста и развития клеток>>. Стимулируя кровообращение, мы улучшаем питание клеток кожи и волосяных фолликул. За счет этого формируются здоровые и крепкие стержни волос. Они меньше выпадают.
На фото: Ольга Молчанова, заведующая отделением дерматологии, врач-дерматовенеролог, трихолог, к. м. н., Клинико-диагностического центра МЕДСИ на Белорусской.
Как использовать никотиновую кислоту для ухода за волосами
Ниацин выпускают в виде таблеток и раствора для инъекций. >.
Никотиновая кислота: противопоказания
Решив подлечить волосы с помощью никотиновой кислоты, имейте в виду, что она небезопасна. При использовании препарата из-за интенсивного местнораздражающего действия может появиться стойкое покраснение кожи с зудом и жжением. Почувствовав дискомфорт, откажитесь от дальнейшего применения никотиновой кислоты. С ниацином следует быть осторожным людям с жирной кожей головы. Это вещество может усилить активность сальных желез.
Рецепты для ухода за волосами с никотиновой кислотой
Вот самые эффективные и безопасные способы использования никотиновой кислоты для домашнего ухода за волосами
Вместо ампульной косметики для волос
Этот способ работает по аналогии с использованием ампульной косметики, только в кожу головы втираете никотиновую кислоту. Для 1 процедуры вам понадобятся 1-2 ампулы никотиновой кислоты. Используйте средство полностью — остатки средства для дальнейшего использования хранить не следует. Перед нанесением никотиновой кислоты голову желательно вымыть.
- Вотрите никотиновую кислоту в кожу головы массажными движениями, разделив волосы на секции.
- Оберните голову на 20-30 минут махровым полотенцем — тепло усилит эффективность процедуры.
- Мыть голову после процедуры не нужно. Сделайте курс из 25-30 процедур.
Маски для волос с никотиновой кислотой
Рекомендуется проводить курсом — 5-6 масок с интервалом в три дня.
Маска для стимулирования роста волос
Смешайте 1 ампулу никотиновой кислоты, 1 ст.л. сока алоэ вера, 15-20 капель настойки красного перца, 1/4 стакана оливкового масла. Полученную смесь вотрите массажными движениями в чистую кожу головы. Оберните голову целлофаном, затем махровым полотенцем. Оставьте на волосах на 20-30 минут, затем тщательно промойте волосы.
Маска от выпадения волос
Смешайте 2 ампулы никотиновой кислоты, 1 мл витамина А, 1/5 ст репейного масла, 20 капель витамина Е. Полученную смесь нанесите массажными движениями на кожу головы и волосы. Покройте голову целлофаном и махровым полотенцем. Через 20-30 минут тщательно промойте волосы с шампунем.
Питательная маска для сухих и поврежденных волос
Смешайте 1 ампулу никотиновой кислоты, 30 мл меда, 40 мл оливкового масла, 1 желток. Полученную смесь вотрите массажными движениями в чистую кожу головы. Оберните голову целлофаном, затем махровым полотенцем. Оставьте на волосах час, затем тщательно промойте волосы.
Скраб для кожи головыСмешайте 1 ст.л. морской соли, 1 ампулу никотиновой кислоты, 3 капли эфирного масла (кедра, бергамота, шалфея, можжевельника). Полученную смесь нанесите на кожу головы массажными движениями, оставьте для воздействия на 5-7 минут, затем тщательно промойте волосы с шампунем .
Еще больше полезной информации о том, как укрепить волосы и оздоровить кожу головы вы найдете здесь и здесь.
Маски для роста и укрепления волос с никотиновой кислотой
Применение никотиновой кислоты для улучшения роста волос, ослабленных стрессами и авитаминозом, может стать чудодейственным средством, если знать, как правильно ее использовать. И цена никотинки намного меньше, чем стоимость салонного ухода.
Что такое никотиновая кислота
Несмотря на название, к табаку и вредным привычкам она отношения не имеет. Это лекарственный препарат, являющийся одной из форм витамина В (PP), его также можно встретить под названием ниацин и никотинамид .
В медицине раствор никотиновой кислоты используют для лечения заболеваний, связанных с нарушением обмена веществ и острым недостатком витаминов. Они и бывают главными причинами проблем с волосами.
Ниацин существует в виде белесых мелких крупинок, хорошо растворимых в горячей воде. Но чаще витамин PP встречается в виде раствора в ампулах или в таблетках.
Колют ее, как правило, внутривенно, так как внутримышечное введение очень болезненно. Сосудорасширяющие свойства никотиновой кислоты используются также при физиотерапевтическом лечении волос электрофорезом.
В чем польза для волос
Волосы – это лакмусовая бумажка, отражающая состояние организма. Они первыми проявляют негативные изменения, происходящие в нем: становятся тоньше, медленнее растут, тускнеют, начинают выпадать.
Если нет более серьезных причин, то часто это происходит из-за дефицита витамина В. Ведь именно он влияет на кератиновый белок – главную составляющую волоса.
Ускорение роста волос
При нанесении никотиновой кислоты на кожу головы, она дает согревающий эффект. «Задремавшие» из-за стресса или диеты волосяные луковицы можно отлично простимулировать.
Витамин PP активизирует кровоснабжение сосудов кожи головы, что дает фолликулам дополнительную энергию для более быстрого роста волос. В результате состояние волос улучшается, они становятся более упругими, толстыми и лучше держат форму.
Лечение облысения
Сосудорасширяющее свойство никотиновой кислоты помогает при лечении выпадения волос. Восстановление волос происходит благодаря усилению кровотока в коже, насыщению кислородом и витаминами волосяных луковиц.
Противопоказания и вред
Витамин PP легко купить в аптеке без рецепта. Но не стоит самостоятельно назначать курс уколов для улучшения состояния волос. Так можно скорее навредить, чем получить пользу для шевелюры. Его не стоит использовать если у вас имеется:
- Повышенная чувствительность к витамину;
- Язвенные болезни органов пищеварения;
- Высокое артериальное давление и атеросклероз;
- Заболевания почек и печени.
Относительными противопоказаниями являются беременность и кормление грудью.
Но и у здоровых людей могут возникнуть побочные эффекты даже при наружном использовании средства:
- Заметное покраснение кожи головы, шеи, плеч с ощущением ожога;
- Головокружение, связанное с понижением давления из-за сосудорасширяющего эффекта применения препарата;
- Расстройства желудка и кишечника.
Способы применения никотиновой кислоты в домашних условиях
Ниацин может использоваться в чистом виде или для приготовления масок, шампуней и эликсиров.
Жирные волосы перед процедурой лучше вымыть, чтобы облегчить проникновение в их структуру. При сухих волосах не стоит наносить чистый раствор на всю длину, он сделает их еще более слабыми и тонкими. В этом случае лучше сочетать ее с другими ингредиентами.
Правила использования
Учитывая противопоказания и побочные эффекты от применения никотиновой кислоты, а также ее свойства и особенности воздействия на волосы и кожу, желательно придерживаться некоторых рекомендаций:
- Для нанесения на волосы используется раствор, а не таблетки;
- Сначала стоит попробовать средство на руке и подождать некоторое время. Если нет негативной реакции, можно пользоваться средством;
- Не следует пугаться легкого покалывания на коже, это нормальная реакция, означающая, что никотиноамид работает. Если же чувствуется сильное жжение, лучше смыть средство с помощью шампуня;
- Для 1 процедуры достаточно использовать 2 ампулы. Большее количество может дать обратный эффект;
- Если негативная реакция возникла после нескольких сеансов в виде появления или усиления перхоти, стоит поискать другое средство для волос.
Как втирать в кожу головы
- Вскрыть 2 ампулы и вылить в пластиковую или стеклянную посуду.
- Чистые и чуть влажные волосы разделяют с помощью расчески с острым концом. Массажными движениями втирают в кожу лба, затем в боковые части и в последнюю очередь затылок.
- Наносят средство в полиэтиленовых перчатках или чистой кистью для окрашивания. Раствор не вытирают полотенцем и не смывают водой. Он не имеет запаха, не меняет цвет волос, так что можно спокойно выходить «в люди».
Чтобы увидеть эффективность никотиновой кислоты для роста волос достаточно применять ее в течение месяца. Если есть необходимость в повторении курса лечения, то лучше провести его через 10-20 дней.
Таблетки и инъекции
Такие процедуры обязательно должны быть согласованы с врачом. Так как, если проблемы с волосами вызваны другими причинами, вместо толстой косы можно получить гипервитаминоз и множество иных неприятностей со здоровьем.
- Ниацин участвуют в окислительных процессах организма. Поэтому прием таблеток оказывает положительное влияние на рост и качество волос. Курс — 15 дней по 2 таблетки в сутки с водой или молоком. Перед приемом следует обязательно поесть.
- Внутривенные инъекции никотиновой кислоты способствуют укреплению и быстрому росту волос.
- Делать уколы в голову не стоит. Такие «инъекции красоты» могут спровоцировать жесточайший приступ аллергии, гипертонический криз или инсульт.
- Уколы или таблетки лучше сочетать с наружным применением раствора, так эффективность процедуры будет выше.
Маски для роста и укрепления волос с никотиновой кислотой
Самый простой рецепт маски – добавить витамин PP в шампунь, 1 ампулу на одну порцию для мытья голову. Шампунь следует подержать на голове 5-7 минут, затем смыть.
Никотинку полезно добавлять в отвары ромашки, сок алоэ и имбиря. Маски с никотиновой кислотой делают каждый день в течение месяца, не забывая наблюдать за реакцией кожи. Волосы при этом должны быть чистыми и чуть влажными.
Для сухих волос
- 1 ампула витамина PP;
- 1 капсулу витамина Е;
- 2 ст. л. льняного масла;
- 1 ст. л. аптечной настойки элеутерококка.
Маска наносится на корни и всю длину волос. Достаточно подержать ее 1 час, чтобы почувствовать эффект. В результате волосы становятся упругими, но послушными и быстрее растут. Средство смывается горячей водой.
Для всех типов волос
С прополисом и алоэ
По 2 чайные ложки:
- никотиновой кислоты;
- сока алоэ;
- настойки прополиса.
Ингредиенты маски смешиваются и наносятся на волосы и кожу головы на 40 минут. Через пару минут появится ощущение приятного покалывания и тепла. Маска хорошо помогает при выпадении волос.
С яйцом и медом
- 1 сырого желтка;
- 1 ч. л. меда;
- ½ ч. л. витамина Е;
- 2 ст. л. оливкового масла
- 1 ампулы никотинки.
Маску нужно втереть к кожу головы и нанести по всей длине волос. Спустя 1 час следует смыть средство шампунем. Витамин Е и оливковое масло сохраняют нужное количество влаги. Мед тонизирует кожу, укрепляет волосы и насыщает микроэлементами.
Для тонких волос
- 1 упаковка бесцветной хны;
- ½ ст. л. дрожжей;
- 1 ампула никотиновой кислоты;
- несколько капель масла лимонной вербены.
Хну заваривают кипятком и остужают до 40 градусов. Дрожжи разводят водой. Объединив ингредиенты, добавляют масло и витамин PP. Держать маску нужно 1 час, замотав голову пленкой и платком, смывать шампунем.
Маска с никотиновой кислотой останавливает выпадение и ускоряет рост волос. Бесцветная хна делает локоны толще и жестче, благодаря чему они становятся объемнее. Дрожжи восстанавливают структуру каждого волоска. Масло лимонной вербены увлажняет.
Где купить
Для ухода за волосами применяется 1%-й раствор витамина PP. Обычная фасовка — 10 ампул по 1 мл. Для разовой процедуры хватит 1-2 штук.
Польза никотинки уже проверены многими женщинами. Ничто не мешает сочетать препарат с другими полезными составляющими. Ведь каждая из нас знает, что любят ее волосы.
С заботой о Вас наши любимые девочки!
Rinail.ru
Никотиновая кислота для волос: отзывы и правила применения
Витамины для волос можно не только пить курсом или получать из пищи. Например, витамин РР или В3 (никотиновая кислота), часто используется в качестве внешней терапии.
Никотиновая кислота для роста волос продается в любой аптеке в виде ампул. Вы можете добавлять жидкость одной ампулы в бальзам, маску или шампунь, но такой вид терапии будет малоэффективным. Дело в том, что «никотинка» быстро испаряется, поэтому она может даже не «дойти» до кожи головы, особенно, если вы используете ее в составе бальзама, который в принципе не наносится на корни волос. Поэтому никотиновую кислоту для роста волос стоит использовать другим образом.
Instagram: @gigiadid
Зачем использовать никотиновую кислоту для волос
При недостатке витамина В3 в нашем организме замедляются окислительно-восстановительные реакции, из-за чего все питательные и полезные вещества плохо впитываются. В медицине никотиновую кислоту прописывают для лечения заболеваний, связанных с нарушением обмена веществ, а также острым авитаминозом. Именно эти состояния и являются главными виновниками замедления роста волос. Вот, почему «никотинка» так эффективна для решения этой проблемы.
Показания для использования никотиновой кислоты следующие:
1. Тонкие и редкие локоны: никотиновая кислота расширяет капилляры, улучшая кровообращение. Таким образом, она активирует «спящие» фолликулы и стимулирует рост новых волосков.
2. Чрезмерная жирность волос: витамин В3 по консистенции напоминает обычную воду, но, впитываясь в кожу головы, она помогает регулировать сальные железы. При регулярном использовании кожа будет жирнеть реже.
3. Тусклость и ломкость волос: ниацин (никотиновая кислота) «запечатывает» чешуйки волос и делая их более гладкими. На волосах образуется тонкая защитная пленка, которая делает локоны более плотными и блестящими.
Instagram: @rosiehw
Как использовать никотиновую кислоту для роста волос
Самый эффективный способ использования витамина В3 — нанесение витамина в чистом виде на очищенную кожу головы. Для этого тебе нужно 2 ампулы на один сеанс. Помойте голову, просушите волосы процентов на 70. Сделайте центральный пробор. Обмокните пальцы в «никотинку» и массирующими движениями втирайте в кожу головы. Затем сделайте пробор на 1 см дальше и проделайте то же самое. И так по всему периметру головы.
Курс терапии с витамином В3 расчитан на 15 применения через день или два. Отзывы о применении никотиновой кислоты для роста волос говорят о том, что за месяц локоны должны стать длиннее на 2-3 см, при нормальном росте в 1-1,5 см. После курса терапии стоит сделать перерыв на месяц, потом можно повторить при желании.
Будьте аккуратны: не рекомендуется сушить волосы феном в течение 30 минут после нанесения витамина. Также не нужно наносить ниацин на волосы после использования фена: локоны должны «остыть», чтобы никотиновая кислота не испарилась с кожи.
Instagram: @mirandakerr
По материалам cosmo.com.ua
Никотиновая кислота: простой и безопасный способ увеличить выработку гормона роста
Рисунок 1 — Структура никотиновой кислоты
Гормон роста (GH), кажется, подвергается большой критике в субкультуре бодибилдинга; люди либо любят это, либо ненавидят. Вместо того, чтобы баловаться дебатами о пользе / использовании GH в отношении спортивных результатов, я считаю более благоразумным изучить корреляцию между обычным B-витамином ниацином (витамин B3) и секрецией гормона роста in vivo.
Прежде чем углубиться в подробности этой статьи, имейте в виду, что ниацин в дозах, предложенных в исследованиях, включенных в настоящий документ, нельзя получить только из пищевых источников. Людям потребуется токсичное количество говядины (> 15 фунтов в день) для достижения номинального количества ниацина, которое усиливает высвобождение гормона роста. Так что нет, вы не можете просто есть продукты, богатые ниацином, чтобы достичь эффекта, наблюдаемого в этих исследованиях.
Исследование, проведенное Stokes et. соавторы обнаружили, что субъекты, которые принимали значительно большие болюсы (примерно от 1000 до 3000 мг) из ниацина ( никотиновая кислота), демонстрировали «усиленное» высвобождение гормона роста с некоторой задержкой (т.е.е. примерно через 5 часов после приема дозы). [1]
На рисунке выше вы можете увидеть экспоненциальное увеличение уровней GH, которое произошло в группе, получавшей ниацин, по сравнению с контрольной группой (которая не принимала дополнительный ниацин). Имейте в виду, что в этом исследовании изучались люди, которые завершили спринтерские интервалы на велосипедах. Таким образом, был сделан вывод, что ниацин оказывает стимулирующее действие на высвобождение гормона роста, которое мы обычно достигаем при соответствующих анаэробных упражнениях высокой интенсивности.
Также обратите внимание, насколько значительным было увеличение GH. Во время пикового интервала времени (300 минут после лечения) у лиц, получавших ниацин, наблюдалось на 600-1500% большее увеличение GH по сравнению с контрольной группой. Фактически, эти уровни были большими секрециями, чем мы обычно достигаем во время самой глубокой фазы сна, которая в противном случае является самым большим естественным эндогенным выбросом GH, который мы когда-либо вызывали.
Таким образом, мы можем экстраполировать из этого исследования открытие, что ниацин все еще может быть полезен для людей даже без упражнений, поскольку он будет стимулировать значительную секрецию GH даже при отсутствии упражнений.
Это означает, что при правильном выборе времени и включении в ваш тренировочный / кардио режим, ниацин может предоставить простой, безопасный и законный способ естественным образом воспользоваться преимуществами собственной секреции GH вашего тела.
Польза ниацина для похудания и наращивания мышечной массы
Многие люди будут утверждать, что GH в физиологических диапазонах бесполезен, но я не могу согласиться с такой позицией. GH является мощным антикатаболическим гормоном у людей и служит косвенным посредником в смеси анаболических гормонов.[2] Гормон роста также оказался полезным средством для сжигания жира, особенно у людей, страдающих натощак, поскольку он оказывает прямое воздействие на различные пептиды кишечника, такие как лептин и грелин. [3] Кроме того, GH способствует более глубокому и более спокойному сну, что необходимо как бодибилдерам, так и любителям тренажерного зала.
Более того, эндогенные уровни GH, достигнутые после приема ниацина, довольно значительны. Я осторожно отношусь к описанию этих уровней как «фармакологических», потому что я не хочу, чтобы люди думали, что прием ниацина вызовет те же эффекты, что и прием экзогенного гормона роста (потому что, честно говоря, не многое может воспроизвести сам пептид).
Вывод из включенных здесь исследований, однако, заключается в том, что мы все еще можем воспользоваться этим дополнительным «преимуществом» от простой, безопасной и легальной безрецептурной добавки, которая представляет собой ниацин / никотиновую кислоту (витамин B3). Имейте в виду, что никотиновая кислота — это не то же самое, что ниацинамид или гексаникотинат инозита! Вам нужна добавка в чистом виде ниацина (кислотная форма), а не в форме, связанной с амидом или инозитом.
Рекомендуемое использование ниацина
Для людей, которые соблюдают периодическое голодание (или тренируются голодным):
Принимайте 1–3 г (начните с нижнего предела и увеличивайте при необходимости) примерно 3-4 часа (180–240 минут до тренировки).
Причина такой разницы во времени между приемом ниацина и физическими упражнениями заключается в том, что GH является гормоном с замедленным действием по своим липолитическим и антикатаболическим эффектам. [4] Оптимально, если вы хотите повысить уровень гормона роста на ранней стадии или даже до того, как начать тренировку, и дать своему организму 20-30 минут, чтобы ослабить его реакцию.
–Кроме того, этот вариант должен предоставить тренирующимся натощак максимальную выгоду от их собственной секреции GH и предоставить достаточно времени для тренировки, а затем нарастить уровень инсулина в посттренировочной фазе (который по большей части является антагонистом GH).
Для учеников, которые тренируются в сытом состоянии (особенно после инсулиногенной / углеводной еды):
Принимайте ниацин (в тех же дозах, что и выше) примерно через 1,5–2 часа после последнего приема пищи перед тренировкой. Гипотеза для этого дозирования заключается в том, что он должен найти золотую середину между возвращением инсулина к исходным уровням и тем, чтобы позволить GH проявить свои эффекты как раз вовремя, чтобы вы могли тренироваться или делать кардио.
ПРИМЕЧАНИЕ: Если вы придерживаетесь низкоуглеводной диеты / кето диеты, вы можете следовать протоколу, аналогичному протоколу группы натощак, поскольку ваш уровень инсулина должен быть относительно статичным в течение дня.
В дни, не связанные с тренировками и / или перед сном:
Учитывая данные / результаты, обсуждаемые здесь, возможно, одним из самых разумных периодов приема ниацина будет 60-90 минут перед сном. Постулат здесь состоит в том, что вы можете получить значительно «избыточную» (кто-нибудь преувеличивает?) Эндогенную секрецию гормона роста во время сна с дополнительным эффектом ниацина.
Как избежать приливов ниацина:
Большинство читателей, вероятно, знают, что никотиновая кислота может вызывать побочный эффект, известный как покраснение.Это вызывает ощущение зуда и тепла в коже, что немного похоже на «покалывание» бета-аланином, но вызывает большее раздражение. Чтобы избежать промывки ниацином, лучше всего принимать ниацин во время еды или после нее. или начинать с низкой дозы — например, 100 мг — и постепенно увеличивать ее до целевой дозы с шагом от 50 до 100 мг на каждый прием пищи. день.
Другой вариант — принять 325 мг аспирина примерно за 30 минут до запланированной дозы ниацина.
Заключение
Плюс к добавкам ниацина (никотиновой кислоты) в том, что они легко доступны, дешевы, безопасны и на самом деле имеют убедительные клинические доказательства, подтверждающие это.Существует множество других преимуществ ниацина для здоровья, которые не были рассмотрены в этой статье, например, оптимизация профилей холестерина и улучшение когнитивных функций.
Эта статья никоим образом не предлагает вам обозначить ниацин как «чудо-пилюлю», но, тем не менее, он очень эффективен, особенно для увеличения секреции эндогенного гормона роста.
Ссылки:
1.Stokes, K.A., Tyler, C., & Gilbert, K.L. (2008). Реакция гормона роста на повторяющиеся спринтерские упражнения с подавлением липолиза и без него у мужчин. Журнал прикладной физиологии, 104 (3), 724-728.
2. Дэниел-младший, В. А., Эйнсли-Грин, А., Захманн, М., и Прадер, А. (1976). Взаимосвязь терапевтических эффектов гормона роста и тестостерона на рост при гипопитуитаризме. Журнал педиатрии , 89 (6), 992-999.
3. Саломон, Ф., Кунео, Р. К., Хесп, Р., и Сонксен, П. Х. (1989). Влияние лечения рекомбинантным гормоном роста человека на состав тела и метаболизм у взрослых с дефицитом гормона роста. Медицинский журнал Новой Англии , 321 (26), 1797-1803.
4.Куаббе, Х.Дж., Люкс, А.С., Лаге М., и Шварц, К. (1983). Концентрации гормона роста, кортизола и глюкагона во время депрессии свободных жирных кислот в плазме: различные эффекты никотиновой кислоты и производного аденозина (BM 11.189). J. Clin Endocrinol Metab., 57 (2): 410-4.
Почему некоторым видам дрожжей для роста требуется ниацин? Различные режимы синтеза НАД | FEMS дрожжевое исследование
4″ data-legacy-id=»ss0″> Введение
НАД хорошо известен как важный кофермент в различных метаболических реакциях. Недавние исследования показали, что это универсальное соединение играет роль во многих различных клеточных процессах, таких как деацетилирование белка (Lin et al. , 2000; Hekimi & Guarente, 2003; Howitz et al., 2003), моно- и поли-АДФ-рибозилирование (Berger et al. , 2004), передачу сигналов кальция (Guse, 2004) и модуляцию транскрипционной активности (Rutter et al. , 2001; Zhang et al. др. , 2002).
НАД является важным кофактором в живых системах. Два альтернативных пути биосинтеза НАД de novo (начиная с l-аспарагиновой кислоты или l-триптофана) могут использоваться в различных организмах. Многие прокариоты, такие как Escherichia coli (Begley et al., 2001), а некоторые растения, такие как Arabidopsis thaliana (Katoh & Hashimoto, 2004; Katoh et al. , 2006), синтезируют НАД через аспартатный путь. Напротив, большинство эукариот используют путь деградации триптофана (кинуренин) (Katoh & Hashimoto, 2004). Недавно было продемонстрировано, что кинурениновый путь обнаруживается также у некоторых бактерий (Курнасов и др. , 2003). У растения Oryza sativa , вероятно, есть оба пути, согласно поиску сходства взрыва (Katoh & Hashimoto, 2004).Пути аспартата и кинуренина сходятся в хинолиновой кислоте, а затем используются те же стадии реакции для окончательного образования НАД. С другой стороны, в различных реакциях с потреблением НАД, НАД превращается в никотинамид (Berger et al. , 2004), который может быть возвращен обратно в НАД через никотиновую кислоту (Na) и мононуклеотид никотиновой кислоты (NaMN), или через никотинамидмононуклеотид (NMN) путями спасения (Rongvaux et al. , 2003). Такие схемы рециркуляции НАД связывают ниацин (общее название, относящееся как к никотиновой кислоте, так и к никотинамиду) с биосинтезом НАД.В то время как никотинамид может использовать два разных пути спасения, никотиновая кислота универсально превращается в НАД консервативным «путем Прейсс-Хэндлера» (три стадии от никотиновой кислоты до НАД в пути спасения через Na и NaMN) (Rongvaux et al. , 2003 г.). Таким образом, через эти пути биосинтеза НАД (суммированные на рис. 1) как аминокислоты (аспарагиновая кислота и триптофан), так и ниацин могут действовать как предшественники НАД.
1
Схематическое изображение различных путей синтеза НАД.Биосинтез НАД включает два пути de novo — кинурениновый путь и аспартатный путь (начиная с триптофана или аспарагиновой кислоты), а также два пути спасения — через никотиновую кислоту (Na) и мононуклеотид никотиновой кислоты (NaMN) и через мононуклеотид никотинамида ( NMN). Показаны стадии реакции, требующие включения O 2 .
1
Схематическое изображение различных путей синтеза НАД. Биосинтез NAD включает два пути de novo — путь кинуренина и путь аспартата (начиная с триптофана или аспарагиновой кислоты), а также два пути спасения — через никотиновую кислоту (Na) и мононуклеотид никотиновой кислоты (NaMN) и через мононуклеотид никотинамида ( NMN).Показаны стадии реакции, требующие включения O 2 .
Большинству видов дрожжей для роста ниацин не требуется. Все такие хорошо известные виды, как Saccharomyces cerevisiae, Debaryomyces hansenii, Candida albicans и Yarrowia lipolytica , являются ниацин-положительными. Однако существует меньшинство дрожжей, которым необходим ниацин (35 из 590 описанных видов ниацин-отрицательные) (Barnett et al. , 1990). К ним относятся Kluyveromyces lactis, Candida glabrata и Schizosaccharomyces pombe (рис.2).
2
Тесты на ауксотрофию никотиновой кислоты различных видов дрожжей. Штаммы дрожжей, представляющие S. cerevisiae (S288C), C. glabrata (CBS138), K. lactis (CBS2359), D. hansenii (CBS767), C. albicans (CBS562), Y . lipolytica (CLIB89) и Schiz. pombe (CBS356) выращивали до стационарной фазы при 28 ° C в полной среде с глюкозой. Культуры центрифугировали, и осадки промывали физиологическим раствором (0.15 М NaCl). Десять микролитров 100-кратно разведенных клеточных суспензий по каплям наносили на среду с минимальным содержанием глюкозы с (верхняя панель) и без никотиновой кислоты (нижняя панель), а затем выращивали при 28 ° C в течение 3 дней (за исключением D. hansenii , который выращивали 4 дня).
2
Тесты на ауксотрофию никотиновой кислоты различных видов дрожжей. Штаммы дрожжей, представляющие S. cerevisiae (S288C), C. glabrata (CBS138), K. lactis (CBS2359), D.hansenii (CBS767), C. albicans (CBS562), Y. lipolytica (CLIB89) и Schiz. pombe (CBS356) выращивали до стационарной фазы при 28 ° C в полной среде с глюкозой. Культуры центрифугировали и осадки промывали физиологическим раствором (0,15 М NaCl). Десять микролитров 100-кратно разведенных клеточных суспензий по каплям наносили на среду с минимальным содержанием глюкозы с (верхняя панель) и без никотиновой кислоты (нижняя панель), а затем выращивали при 28 ° C в течение 3 дней (за исключением D.hansenii , который выращивали 4 дня).
Ниацин участвует в некоторых путях синтеза НАД. Следовательно, возможно, что разные потребности в ниацине разных дрожжей происходят из-за различий в способах биосинтеза НАД. Поскольку большинство генов, непосредственно участвующих в различных путях образования НАД, уже известно, можно реконструировать на основе данных о последовательности генома пути синтеза НАД, действующие у разных видов дрожжей. Для указанных выше семи видов доступны полные последовательности генома (Goffeau et al., 1996; Wood et al. , 2002; Dujon et al. , 2004; Джонс и др. , 2004). Сравнивая эти пути, мы искали возможную основу для различий в потребности в ниацине среди этих дрожжей.
Еще один интерес, который побудил нас изучить пути биосинтеза НАД, — это связь между аэробным / анаэробным ростом и путями биосинтеза НАД в S. cerevisiae , где синтез НАД осуществляется как кинурениновым, так и спасательным путем (Panozzo et al., 2002). Путь кинуренина представляет собой процесс, зависящий от O 2 , в котором три стадии реакции требуют включения молекулярного кислорода (рис. 1). По этой причине для роста этих дрожжей в среде, обедненной O 2 , необходим спасательный путь. В то время как S. cerevisiae могут расти анаэробно, многие из этих дрожжей не могут расти без кислорода. Поэтому мы исследовали возможную связь между способностью к анаэробному росту и наличием или отсутствием различных путей биосинтеза НАД у этих дрожжей.
3″ data-legacy-id=»ss2″> Штаммы и среды Штаммы дрожжей перечислены в таблице 1. Дрожжевые клетки обычно выращивали при 28 ° C в полной среде, содержащей 1% бакто-дрожжевой экстракт (Difco), 1% бакто-пептон (Difco) и 2% глюкозу. При необходимости добавляли 200 мкг мл -1 антибиотика G418. Для споруляции диплоидный штамм K. lactis выращивали на чашке ME (5% бакто-солодовый экстракт и 2% бакто-агар, Difco).Синтетическая минимальная среда была приготовлена, как описано (Sherman, 1991), и никотиновая кислота была удалена, как указано.
Штаммы дрожжей Генотип Источник S. cerevisiae S288C Prototroph K. CK11 MAT a / MAT α uraA1 / uraA1, adeT-600 / +, + / lysA1 X.Дж. Чен, Юго-западный медицинский центр штата Юта, США CK11 / Δklnpt1 CK11 klnpt1 :: KanMX / KlNPT1 Эта работа CBS2359 CBS2359 Proutha C. glabrata CBS138 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie D. hansenii CBS767 CBS767 H.Фукухара, Institut Curie C. albicans CBS562 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie H. Fukuhara, Institut Curie Schiz. pombe CBS356 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie
Штаммы дрожжей Генотип Источник cerevisiae S288C Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie K. lactis CK11 14 MATra MATra 600 / +, + / lysA1 XJ Чен, Юго-западный медицинский центр CK11 / Δklnpt1 CK11 klnpt1 :: KanMX / KlNPT1 Эта работа CBS2359 PrototФукухара, Институт Кюри C. glabrata CBS138 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie Prototroph D. Фукухара, Institut Curie C. albicans CBS562 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie Y.lipolytica CLIB89 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie Schiz. pombe CBS356 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie
Дрожжевые штаммы Генотип cerevisia Источник S. Прототроф Х.Фукухара, Институт Кюри K. lactis CK11 MAT a / MAT α uraA1 / uraA1, adeT-600 / +, + / lysA1 X.J . Чен, Юго-западный медицинский центр CK11 / Δklnpt1 CK11 klnpt1 :: KanMX / KlNPT1 Эта работа CBS2359 CBS2359 Prototha .glabrata CBS138 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie D. hansenii CBS767 CBS767 Protothara 9028 Fukuhara 9028 albicans CBS562 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie Y. lipolytica CLIB89 Prototroph H.Fukuhara, Institut Curie Schiz. pombe CBS356 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie
Дрожжевые штаммы Генотип cerevisia Источник S. Прототроф Х. Фукухара, Институт Кюри К.lactis CK11 MAT a / MAT α uraA1 / uraA1, adeT-600 / +, + / lysA1 X.J. Чен, Юго-западный медицинский центр CK11 / Δklnpt1 CK11 klnpt1 :: KanMX / KlNPT1 Эта работа CBS2359 CBS2359 Prototha .glabrata CBS138 Prototroph H.Фукухара, Institut Curie D. hansenii CBS767 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie 9028 C. albicans Fukuhara, Institut Curie Y. lipolytica CLIB89 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie Schiz.pombe CBS356 Prototroph H. Fukuhara, Institut Curie
8″ data-legacy-id=»ss4″> Сравнительный анализ генома и реконструкция путей биосинтеза НАД у дрожжей Веб-сайты баз данных о видах дрожжей, использованных в этом исследовании, перечислены в конце таблицы 2.поиск взрыва проводился с использованием реализованных в нем инструментов.
2 Сравнение путей биосинтеза НАД у дрожжей
S. cerevisiae 1 C. glabrata 2 K. lactis 2 2 2 C. albicans 3 Y. lipolytica 2 Schiz.Pombe 4 Другие ссылочные последовательности 5 de novo Биосинтез NAD —Кинурениновый путь BNA-TrypRW2 — — DEHA0G12947g (364 / e-101) orf19.583 (919 / 9.9e-94) YALI0F26455g (304 / 6e-83) — NA YJL060W: Арилформамидаза CAGL0J05126g (645/0.0) KLLA0F01617g (633 / 0.0) DEHA0A04840g (471 / e-133) orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) YALI0E28787g (474 / e-134) Bc /1.6e-110) BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа — — DEHA0C06743g (365 / e-101) — orf19 / 5 107) YALI0D09867g (358 / 5e-99) — BNA5 / YLR231C: кинурениназа — — .394 (1248 / 1.4e-128) YALI0B22902g (416 / e-116) — BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 — DE -90HA / 4e-63) orf19.3515 (616 / 1.3e-61) YALI0B02852g (243 / 4e-65) — BNA6 / YFR047Cibosylate трансфосфораза — хинолинат — DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) YALI0E07073g (419 / e-118) — — Путь аспартата — * — — * — — * — * — * — * — * — * NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) — — — — — NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) Спасение биосинтеза НАД 7, биосинтез НАД 7 — сульфатиновая кислота 7 PNC1 / YGL037C: никотинамидаза CAGL0A01716g (279 / 7e-76) KLLA0F22242g (219 / 1e-57) DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) YALI0A21153g (153 / 6e-38) SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) KLLA0D06655g (624 / e-179) DEHA0G25201g (493 / e-140) NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) 432800 / YALG ) SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, YALI0E25652g (455 / e-128, SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) 503 / e-143) 479 / e-136) 1221 / 2.3e-129) 472 / e-133) 1045 / 1.8e-107) QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза CAGL0J10758g (1255/0.0) KLLA0D13024g (1214 / 0,0) DEHA0A01969g (1004 / 0,0) orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) YALI0A20108g (1042 / 0,0) 2276- SPCC55 / 6.02 238) — Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) — — — — — — никотинамидфосфорибозилтрансфераза) Транспорт никотиновой кислоты TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) DEHA0E10494g (257 / 4e-69) TNA1-64 / orf19.4 ) YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58)
S. cerevisiae 1 C. glabrata 2 K. lactis 2 D. hansenii 2 C. Y. lipolytica 2 Schiz.Pombe 4 Другие ссылочные последовательности 5 de novo Биосинтез NAD —Кинурениновый путь BNA-TrypRW2 — — DEHA0G12947g (364 / e-101) orf19.583 (919 / 9.9e-94) YALI0F26455g (304 / 6e-83) — NA YJL060W: Арилформамидаза CAGL0J05126g (645/0.0) KLLA0F01617g (633 / 0.0) DEHA0A04840g (471 / e-133) orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) YALI0E28787g (474 / e-134) Bc /1.6e-110) BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа — — DEHA0C06743g (365 / e-101) — orf19 / 5 107) YALI0D09867g (358 / 5e-99) — BNA5 / YLR231C: кинурениназа — — .394 (1248 / 1.4e-128) YALI0B22902g (416 / e-116) — BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 — DE -90HA / 4e-63) orf19.3515 (616 / 1.3e-61) YALI0B02852g (243 / 4e-65) — BNA6 / YFR047Cibosylate трансфосфораза — хинолинат — DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) YALI0E07073g (419 / e-118) — — Путь аспартата — * — — * — — * — * — * — * — * — * NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) — — — — — NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) Спасение биосинтеза НАД 7, биосинтез НАД 7 — сульфатиновая кислота 7 PNC1 / YGL037C: никотинамидаза CAGL0A01716g (279 / 7e-76) KLLA0F22242g (219 / 1e-57) DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) YALI0A21153g (153 / 6e-38) SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) KLLA0D06655g (624 / e-179) DEHA0G25201g (493 / e-140) NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) 432800 / YALG ) SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, YALI0E25652g (455 / e-128, SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) 503 / e-143) 479 / e-136) 1221 / 2.3e-129) 472 / e-133) 1045 / 1.8e-107) QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза CAGL0J10758g (1255/0.0) KLLA0D13024g (1214 / 0,0) DEHA0A01969g (1004 / 0,0) orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) YALI0A20108g (1042 / 0,0) 2276- SPCC55 / 6.02 238) — Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) — — — — — — никотинамидфосфорибозилтрансфераза) Транспорт никотиновой кислоты TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) DEHA0E10494g (257 / 4e-69) TNA1-64 / orf19.4 ) YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58)
2 Сравнение путей биосинтеза НАД у дрожжей
S. cerevisiae 1 C. glabrata 2 K. lactis 2 hansenii C. albicans 3 Y.lipolytica 2 Schiz. Pombe 4 Другие ссылочные последовательности 5 de novo Биосинтез NAD —Кинурениновый путь BNA-TrypRW2 — — DEHA0G12947g (364 / e-101) orf19.583 (919 / 9.9e-94) YALI0F26455g (304 / 6e-83) — NA YJL060W: Арилформамидаза CAGL0J05126g (645/0.0) KLLA0F01617g (633 / 0.0) DEHA0A04840g (471 / e-133) orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) YALI0E28787g (474 / e-134) Bc /1.6e-110) BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа — — DEHA0C06743g (365 / e-101) — orf19 / 5 107) YALI0D09867g (358 / 5e-99) — BNA5 / YLR231C: кинурениназа — — .394 (1248 / 1.4e-128) YALI0B22902g (416 / e-116) — BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 — DE -90HA / 4e-63) orf19.3515 (616 / 1.3e-61) YALI0B02852g (243 / 4e-65) — BNA6 / YFR047Cibosylate трансфосфораза — хинолинат — DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) YALI0E07073g (419 / e-118) — — Путь аспартата — * — — * — — * — * — * — * — * — * NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) — — — — — NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) Спасение биосинтеза НАД 7, биосинтез НАД 7 — сульфатиновая кислота 7 PNC1 / YGL037C: никотинамидаза CAGL0A01716g (279 / 7e-76) KLLA0F22242g (219 / 1e-57) DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) YALI0A21153g (153 / 6e-38) SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) KLLA0D06655g (624 / e-179) DEHA0G25201g (493 / e-140) NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) 432800 / YALG ) SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, YALI0E25652g (455 / e-128, SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) 503 / e-143) 479 / e-136) 1221 / 2.3e-129) 472 / e-133) 1045 / 1.8e-107) QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза CAGL0J10758g (1255/0.0) KLLA0D13024g (1214 / 0,0) DEHA0A01969g (1004 / 0,0) orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) YALI0A20108g (1042 / 0,0) 2276- SPCC55 / 6.02 238) — Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) — — — — — — никотинамидфосфорибозилтрансфераза) Транспорт никотиновой кислоты TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) DEHA0E10494g (257 / 4e-69) TNA1-64 / orf19.4 ) YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58)
S. cerevisiae 1 C. glabrata 2 K. lactis 2 D. hansenii 2 C. Y. lipolytica 2 Schiz.Pombe 4 Другие ссылочные последовательности 5 de novo Биосинтез NAD —Кинурениновый путь BNA-TrypRW2 — — DEHA0G12947g (364 / e-101) orf19.583 (919 / 9.9e-94) YALI0F26455g (304 / 6e-83) — NA YJL060W: Арилформамидаза CAGL0J05126g (645/0.0) KLLA0F01617g (633 / 0.0) DEHA0A04840g (471 / e-133) orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) YALI0E28787g (474 / e-134) Bc /1.6e-110) BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа — — DEHA0C06743g (365 / e-101) — orf19 / 5 107) YALI0D09867g (358 / 5e-99) — BNA5 / YLR231C: кинурениназа — — .394 (1248 / 1.4e-128) YALI0B22902g (416 / e-116) — BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 — DE -90HA / 4e-63) orf19.3515 (616 / 1.3e-61) YALI0B02852g (243 / 4e-65) — BNA6 / YFR047Cibosylate трансфосфораза — хинолинат — DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) YALI0E07073g (419 / e-118) — — Путь аспартата — * — — * — — * — * — * — * — * — * NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) — — — — — NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) Спасение биосинтеза НАД 7, биосинтез НАД 7 — сульфатиновая кислота 7 PNC1 / YGL037C: никотинамидаза CAGL0A01716g (279 / 7e-76) KLLA0F22242g (219 / 1e-57) DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) YALI0A21153g (153 / 6e-38) SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) KLLA0D06655g (624 / e-179) DEHA0G25201g (493 / e-140) NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) 432800 / YALG ) SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, YALI0E25652g (455 / e-128, SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) 503 / e-143) 479 / e-136) 1221 / 2.3e-129) 472 / e-133) 1045 / 1.8e-107) QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза CAGL0J10758g (1255/0.0) KLLA0D13024g (1214 / 0,0) DEHA0A01969g (1004 / 0,0) orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) YALI0A20108g (1042 / 0,0) 2276- SPCC55 / 6.02 238) — Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) — — — — — — никотинамидфосфорибозилтрансфераза) Транспорт никотиновой кислоты TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) DEHA0E10494g (257 / 4e-69) TNA1-64 / orf19.4 ) YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58)
Результаты
Гены, кодирующие ферменты в путях биосинтеза de novo НАД, отсутствуют в геномах K. lactis, C. glabrata и Schiz. Помбе . В дрожжах S. cerevisiae путь кинуренина является признанным путем для биосинтеза НАД de novo , а гены с BNA1 до BNA6 (которые кодируют все ферменты, катализирующие превращение триптофана в мононуклеотид никотиновой кислоты) были идентифицированы, за исключением BNA3 (Schott et al., 1971 г .; Ивамото и др. , 1995; Kucharczyk et al. , 1998; Panozzo et al. , 2002). Используя аминокислотные последовательности из S. cerevisiae , мы с помощью алгоритма blast провели поиск предполагаемых кодирующих последовательностей для ферментов кинуренинового пути в геномных последовательностях шести других видов дрожжей. Результаты представлены в Таблице 2. В D. hansenii, C. albicans и Y. lipolytica были обнаружены ортологи генов BNA1 – BNA6 , что позволяет предположить, что эти три дрожжа имеют кинурениновый путь, аналогичный что в S.cerevisiae . Однако в геномах C. glabrata, K. lactis или Schiz не было обнаружено генов, ортологичных BNA1, BNA2, BNA4, BNA5 и BNA6 . pombe , что указывает на то, что у этих дрожжей отсутствует весь кинурениновый путь. Возможно ли, что эти виды могли использовать путь аспартата для биосинтеза НАД, хотя до сих пор он был обнаружен только у прокариот и растений? Чтобы проверить эту возможность, в геномах был проведен поиск кодирующих последовательностей, соответствующих аминокислотным последовательностям E.coli l-аспартатоксидаза и хинолинатсинтаза. Но ни одного ортолога в геномах этих семи дрожжей обнаружить не удалось (таблица 2). Поиск был повторен с использованием аминокислотных последовательностей тех же ферментов из растения A. thaliana с тем же результатом (данные не показаны). Результаты показали, что C. glabrata, K. lactis и Schiz. pombe также не имеет пути аспартата, обнаруженного в бактериях и некоторых растениях. Это соответствует отсутствию ортолога BNA6 (в S.cerevisiae , этот ген кодирует хинолинатфосфорибозилтрансферазу, которая превращает хинолиновую кислоту в мононуклеотид никотиновой кислоты). Аспартатный и кинурениновый пути сходятся в хинолиновой кислоте. Чтобы дополнительно прояснить, есть ли какие-либо следы генов для синтеза NAD de novo у этих трех дрожжей, мы снова выполнили бластный поиск с использованием нуклеотидных последовательностей. Не было обнаружено значительных совпадений, за исключением BNA3 (данные не показаны). В заключение, биоинформатический анализ показал, что некоторые дрожжи, такие как C.glabrata, K. lactis и Schiz. pombe , вероятно, лишены каких-либо средств биосинтеза NAD de novo , поскольку отсутствуют как кинурениновый путь, так и путь аспартата.
Следует отметить два момента, касающихся отдельных генов кинуренинового пути. В то время как BNA1, BNA2, BNA4, BNA5 и BNA6 имеют ортологи в геномах D. hansenii, C. albicans и Y. lipolytica , все они отсутствуют в геномах K.lactis, C. glabrata и Schiz. Глазурь . BNA3 , однако, является исключением, поскольку он присутствует в каждом геноме, включая те, в которых явно отсутствуют гены кинуренинового пути (Таблица 2). Хотя предполагалось, что BNA3 кодирует арилформамидазу, катализирующую вторую стадию ( N -формил-1-кинуренин в l-кинуренин) пути кинуренина, его точная роль не установлена, в отличие от других пяти генов ( Panozzo et al., 2002). Наши сравнительные геномные данные предполагают, что этот ген может участвовать в другой функции. Во-вторых, две частично перекрывающиеся последовательности, показывающие значительное сходство с BNA6 , как на уровне белка, так и на уровне ДНК, были обнаружены в D. hansenii (Таблица 2). DEHA0F27995g может предсказать полипептид, похожий на N-концевую часть Bna6p и DEHA0F28006g на C-концевую часть. Эти две последовательности были аннотированы как псевдогены в базе данных генома, и их выведенные аминокислотные последовательности были исключены из реестра D.hansenii белков в базе. Присутствие этих двух открытых рамок считывания и тот факт, что D. hansenii может расти в отсутствие никотиновой кислоты (рис.2), строго подразумевает, что эти две последовательности могут действовать как гомолог BNA6 после вероятной ошибки сдвига рамки считывания. был исправлен.
Путь спасения NAD сохраняется во всех семи дрожжах
В дополнение к маршруту биосинтеза de novo , S. cerevisiae может использовать путь спасения (через Na и NaMN) для рециркуляции никотинамида, образующегося в различных реакциях с потреблением НАД.Используя этот путь, никотиновая кислота включается в синтез НАД под действием никотинатфосфорибозилтрансферазы, которая является высококонсервативной от прокариот до эукариот. Данные, представленные в таблице 2, показывают, что этот путь спасения также хорошо сохраняется среди видов дрожжей. В частности, гены никотинатфосфорибозилтрансферазы демонстрируют высокое сходство с NPT1 в S. cerevisiae (Panozzo et al. , 2002) на уровне аминокислотной последовательности. Сообщалось, что млекопитающие используют другой путь спасения (через NMN) для рециркуляции никотинамида посредством реакции, катализируемой никотинамидфосфорибозилтрансферазой (NAmPRTase) (Rongvaux et al., 2002, 2003). Однако наши биоинформатические исследования показали, что у дрожжей, исследованных в этой работе, нет гена, кодирующего предполагаемую NAmPRTase (Таблица 2).
De novo пути и путь спасения с использованием никотиновой кислоты сходятся в NaMN, поэтому они разделяют две стадии реакции от NaMN до NAD, катализируемые мононуклеотид аденилилтрансферазой никотиновой кислоты и глутамин-зависимой NAD синтетазой соответственно. Как показано в таблице 2, гены этих двух ферментов высоко консервативны у всех семи дрожжей.
KlNPT1 является важным геном в K. lactis Приведенные выше результаты показали, что K. lactis, C. glabrata и Schiz. pombe может не осуществлять de novo биосинтез NAD, в то время как они обладают путем спасения NAD (через Na и NaMN). Если это так, то спасательный путь был бы единственным путем, которым эти дрожжи генерируют НАД. Чтобы проверить эту точку зрения, мы удалили ген KlNPT1 , который, как предполагается, кодирует никотинатфосфорибозилтрансферазу, ключевой фермент, превращающий никотиновую кислоту в NaMN в пути спасения.Делецию KlNPT1 проводили в диплоидном штамме СК11 K. lactis . Полученный гетерозиготный диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 спорулировали, и 20 асков иссекали до полной глюкозной среды. Тетрадная диссекция показала образец сегрегации несущественного гена: 18 аски дали четыре жизнеспособные споры, а два аска дали три жизнеспособные споры [(a) на фиг. 3]. Этот результат был неожиданным. Однако мы заметили, что некоторые колонии были намного меньше, и что сегрегация спор в 18 аски представляла типичную менделевскую генетическую ситуацию: две нормальные колонии vs.две меньшие колонии. Все 40 меньших колоний были устойчивыми к антибиотику G418, в то время как 38 нормальных колоний были чувствительны [(b) на фиг. 3]. Клетки, устойчивые к G418, росли плохо, и рост, казалось, прекращался через 2 дня. Это наблюдение напомнило нам, что мутанты Δ klnpt1 могут выживать за счет некоторых метаболитов, таких как НАД, диффундированный их соседями KlNPT1 , даже если разрушение будет летальным. Известно, что клетки могут жить при очень низкой концентрации НАД. Чтобы проверить эту гипотезу, устойчивые к G418 колонии реплицировали второй раз на планшете, содержащем G418.Никакие клетки больше не могли расти [(c) на рис. 3]. В то же время был проведен эксперимент по кормлению со всеми этими G418-устойчивыми колониями, и результаты показали, что их выживаемость зависела от присутствия клеток KlNPT1 [(d) на фиг. 3]. Следовательно, мы заключаем, что разрушение KlNPT1 является летальным, показывая, что путь спасения является единственным средством биосинтеза NAD у K. lactis .
3
Анализ тетрадной диссекции K.lactis гетерозиготный диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 . Аски препарировали и выращивали на полной среде (а), а затем реплицировали на чашку, содержащую 200 мкг мл -1 антибиотика G418 (b). Вторую репликацию проводили с планшетом G418 (c). В то же время клетки каждой устойчивой к G418 колонии суспендировали в физиологическом растворе (0,15 М NaCl) и наносили на полную среду для эксперимента по кормлению, в котором диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 использовался в качестве держателя KlNPT1 . штамм (d).Все планшеты инкубировали при 28 ° C в течение 3-4 дней, а затем сфотографировали.
3
Анализ тетрадной диссекции гетерозиготного диплоида K. lactis Δ klnpt1 / KlNPT1 . Аски препарировали и выращивали на полной среде (а), а затем реплицировали на чашку, содержащую 200 мкг мл -1 антибиотика G418 (b). Вторую репликацию проводили с планшетом G418 (c). В то же время клетки из каждой устойчивой к G418 колонии суспендировали в физиологическом растворе (0.15 M NaCl) и наносили на полную среду для эксперимента по кормлению, в котором диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 использовали в качестве удерживающего штамма KlNPT1 (d). Все планшеты инкубировали при 28 ° C в течение 3-4 дней, а затем сфотографировали.
Обсуждение
Путем анализа данных геномной последовательности мы обнаружили, что три вида, нуждающихся в ниацине ( K. lactis, C. glabrata и Schiz. Pombe ), лишены как кинуренинового пути, так и пути аспартата.Присутствуют только гены пути спасения. Фактически, все исследованные виды дрожжей, по-видимому, обладают генами этого пути (никотинамидаза, никотинатфосфорибозилтрансфераза). Таким образом, для ниацин-отрицательных видов этот путь абсолютно необходим для биосинтеза НАД. Это было экспериментально подтверждено тем фактом, что мутант K. lactis , удаленный из NPT1 , был неспособен к росту даже в присутствии никотиновой кислоты. Насколько нам известно, все другие ранее исследованные организмы, от низших прокариот до млекопитающих или зеленых растений, имеют либо кинурениновый путь, либо аспартатный путь, либо оба пути для синтеза НАД de novo .Следовательно, хотя ниацин обычно считается витамином (B 3 ), он не является витамином в строгом смысле этого слова, потому что никотинатная составляющая НАД также может быть синтезирована из триптофана или аспарагиновой кислоты в этих организмах. Однако наша работа показала, что ниацин действительно является витамином для некоторых дрожжей, таких как K. lactis, C. glabrata и Schiz. Глазурь .
Согласно имеющимся таксономическим данным (Barnett et al. , 1990), существует всего около 35 видов дрожжей, нуждающихся в ниацине.Такие виды чрезмерно представлены в отдельных родах. Например, все виды, близкие к K. lactis , являются ниацин-отрицательными ( K. marxianus, K. aestuarii, K. africanus, K. wickerhamii и т. Д.). Hanseniaspora видов также часто нуждаются в ниацине для роста. Мы можем предположить, что все эти виды утратили пути синтеза НАД, производные от аминокислот, и сделали путь спасения достаточно эффективным, чтобы обеспечить альтернативу. Возможно, что этот способ приобретения NAD мог предшествовать развитию кинуренинового пути у эукариот.
Было показано, что путь спасения НАД с использованием никотиновой кислоты необходим для анаэробного роста дрожжей S. cerevisiae (Panozzo et al. , 2002). Поэтому стоит изучить связь между анаэробиозом и наличием пути спасения. Однако, поскольку путь спасения сохраняется у разных видов дрожжей, независимо от их способности расти в отсутствие кислорода (таблица 2), мы исследовали их способность переносить никотиновую кислоту.Хотя основным путем абсорбции никотиновой кислоты считается процесс пассивной диффузии (Henderson, 1983), TNA1 , был идентифицирован ген высокоаффинного переносчика никотиновой кислоты (Klebl et al. , 2000; Llorente И Dujon, 2000). Поиск ортологов TNA1 показал, что гены для такого предполагаемого переносчика существуют в разных геномах дрожжей и что эта функция часто является совершенно избыточной (Таблица 2). Таким образом, наши данные не предполагают какой-либо прямой связи между различиями в путях биосинтеза НАД и способностью дрожжей к анаэробному росту.
Благодарности
Мы очень благодарны доктору Хироши Фукухара (Институт Кюри), доктору Моник Болотин-Фукухара (IGM, Орсе) и профессору Стивену Оливеру (Манчестер) за критическое прочтение рукописи. Мы благодарим доктора Хироши Фукухару и доктора Синь Цзе Чена (Юго-западный медицинский центр) за любезно предоставленные нам штаммы.
Эта работа была поддержана «Institut Fédératif de Recherche Génomes-IFR115-».
Список литературы
(
1990
) Дрожжи: характеристики и идентификация
. Издательство Кембриджского университета
, Кембридж, Нью-Йорк. (
2001
) Биосинтез никотинамидадениндинуклеотидов в бактериях
. Vitam Horm
61
: 103
— 119
. (
2004
) Новая жизнь долгожителя: сигнальные функции NAD (P)
. Trends Biochem Sci
29
: 111
— 118
. и другие.
(
2004
) Эволюция генома дрожжей
. Природа
430
: 35
— 44
. (
1996
) Новые векторы для комбинаторных делеций в хромосомах дрожжей и для клонирования с восстановлением разрывов с использованием рекомбинации «маркеров расщепления»
. Дрожжи
12
: 1439
— 1457
. и другие.
(
1996
) Жизнь с 6000 генами
. Наука
274
: 546
— 563
, 547. (
2004
) Регуляция кальциевой передачи сигналов вторым мессенджером циклической аденозиндифосфорибозы (cADPR)
. Curr Mol Med
4
: 239
— 248
. (
2003
) Генетика и специфика процесса старения
. Наука
299
: 1351
— 1354
. (
1983
) Ниацин
. Annu Rev Nutr
3
: 289
— 307
. и другие.
(
2003
) Низкомолекулярные активаторы сиртуинов увеличивают продолжительность жизни Saccharomyces cerevisiae
. Природа
425
: 191
— 196
. (
1995
) Триптофан-2,3-диоксигеназа в Saccharomyces cerevisiae
. Can J Microbiol
41
: 19
— 26
. и другие.
(
2004
) Диплоидная последовательность генома Candida albicans
. Proc Natl Acad Sci USA
101
: 7329
— 7334
. (
2004
) Молекулярная биология пиридиновых нуклеотидов и биосинтез никотина
. Передняя панель Biosci
9
: 1577
— 1586
. (
2006
) Ранние этапы биосинтеза НАД у арабидопсиса начинаются с аспартата и происходят в пластиде
. Plant Physiol
141
: 851
— 857
. (
2000
) Транскрипция дрожжевого гена TNA1 регулируется не только никотинатом, но также п-аминобензоатом
. FEBS Lett
481
: 86
— 87
. (
1998
) Дрожжевой ген YJR025c кодирует диоксигеназу 3-гидроксиантраниловой кислоты и участвует в биосинтезе никотиновой кислоты
. FEBS Lett
424
: 127
— 130
. (
2003
) Биосинтез НАД: идентификация пути от триптофана до хинолината у бактерий
. Chem Biol
10
: 1195
— 1204
. (
2000
) Требование NAD и SIR2 для увеличения продолжительности жизни путем ограничения калорийности у Saccharomyces cerevisiae
. Наука
289
: 2126
— 2128
. (
2000
) Регуляция транскрипции семейства генов Saccharomyces cerevisiae DAL5 и идентификация высокоаффинной пермеазы никотиновой кислоты TNA1 (YGR260w)
. FEBS Lett
475
: 237
— 241
. (
2002
) Аэробный и анаэробный метаболизм НАД + в Saccharomyces cerevisiae
. FEBS Lett
517
: 97
— 102
. (
2002
) Фактор увеличения колоний пре-В-клеток, экспрессия которого повышается в активированных лимфоцитах, представляет собой никотинамидфосфорибозилтрансферазу, цитозольный фермент, участвующий в биосинтезе NAD
. Eur J Immunol
32
: 3225
— 3234
. (
2003
) Реконструкция метаболизма НАД эукариот
. Bioessays
25
: 683
— 690
. (
2001
) Регулирование часов и связывания ДНК NPAS2 окислительно-восстановительным состоянием кофакторов NAD
. Наука
293
: 510
— 514
. (
1971
) Регулирующая функция l-кинуренин-3-гидроксилазы (EC 1.14.1.2) для биосинтеза пиридиновых нуклеотидов в анаэробно и аэробно выращенных Saccharomyces cerevisiae
. Hoppe Seylers Z Physiol Chem
352
: 1654
— 1658
. (
1991
) Начало работы с дрожжами
. Методы Enzymol
194
: 3
— 21
. и другие.
(
2002
) Последовательность генома Schizosaccharomyces pombe
. Природа
415
: 871
— 880
. (
2002
) Регулирование функции корепрессора ядерным NADH
. Наука
295
: 1895
— 1897
. © 2007 Федерация европейских микробиологических обществ. Издано Blackwell Publishing Ltd.Все права защищены
границ | Экспрессия гена, опосредованная ниацином, и роль NiaR как репрессора транскрипции niaX, nadC и pnuC в Streptococcus pneumoniae
Введение
Бактерии могут запускать транскрипционные и фенотипические программы для синхронизации адаптивного ответа в ответ на колебания окружающей среды или стрессы (Edwards et al., 2013). Это зависит не только от количества факторов вирулентности, которыми он обладает, но и от правильного использования питательных веществ, доступных в нишах человека (Phillips et al., 1990; Титгемейер и Хиллен, 2002). Для выживания и успешного роста бактериям требуется ряд важных витаминов и кофакторов. Streptococcus pneumoniae , главный грамположительный патоген человека и носоглоточный колонизатор, сталкивается с различными факторами окружающей среды и должен соответствующим образом настраивать экспрессию своего гена (Bogaert et al., 2004; Kadioglu et al., 2008).
Ниацин (никотиновая кислота), встречающийся в природе комплекс витаминов B, является предшественником коферментов НАД и НАДФ и играет важную роль в переносе электронов во время метаболических процессов (Wei et al., 2014). Ниацин давно используется для лечения нарушений липидного обмена и сердечно-сосудистых заболеваний (Wei et al., 2014). Он может регулировать активность микробных двухкомпонентных систем и впоследствии модулировать гены и фенотипы, которые контролируются этими регуляторными белками (McPheat et al., 1983). В частности, сообщалось, что ниацин подавляет экспрессию многих генов, включая факторы вирулентности в Bordetella pertussis , такие как токсин коклюша, токсин аденилатциклазы и нитчатый гемагглютинин (Schneider and Parker, 1982; McPheat et al., 1983; Коттер и ДиРита, 2000; Каммингс и др., 2006). Кроме того, двухкомпонентная система BvgA / BvgS, которая, как известно, играет роль в регуляции вирулентности и колонизации, становится неактивной у B. pertussis , когда в среде присутствует ниацин (Miller et al., 1989). Точно так же система Escherichia coli EvgA / EvgS, которая придает множественную лекарственную устойчивость и кислотостойкость, регулируется ниацином (Masuda and Church, 2002, 2003; Eguchi et al., 2003; Nishino et al., 2003).Как система BvgA / BvgS из B. pertussis , так и система EvgA / EvgS из E. coli являются частью семейства белков, которые используют многоступенчатый фосфорный ретранслятор для запуска своих ответных путей.
Было высказано предположение, что в S. pneumoniae ниацин проникает в клетку через NiaX и превращается в никотинат (никотиновая кислота) -мононуклеотид под действием PncB (Johnson et al., 2015). Затем никотинатмононуклеотид превращается в адениндинуклеотид никотиновой кислоты с помощью NadD, после чего NadE превращает адениндинуклеотид никотиновой кислоты в адениндинуклеотид никотиновой кислоты (NAD) (Johnson et al., 2015). Другой важный фермент — глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (GAP) — это высококонсервативный и многофункциональный белок со значительной активностью в нескольких основных клеточных путях (Sirover, 2011). Обычно дегидрогеназные реакции метаболических путей считаются основными источниками НАДФН. Тем не менее важность трансгидрогеназ, глюкозодегидрогеназ и нефосфорилирующих глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназ (GAPN) становится очевидной, что позволяет предположить, что традиционная точка зрения является чрезмерно упрощенной (Sauer U.et al., 2004; Мацубара и др., 2011; Bräsen et al., 2014). Поскольку НАД является жизненно важным кофактором, используемым всеми живыми организмами, все виды бактерий используют пути восстановления НАД + до НАДН (Jurtshuk, 1996). NAD + также используется бактериями в качестве субстрата для дегидрогеназ, участвующих в расщеплении альдегидов и спиртов (Nobelmann, Lengeler, 1996; Kotrbova-Kozak et al., 2007; Luong et al., 2015). Кроме того, некоторые клеточные процессы в клетках бактерий и млекопитающих также используют НАД, например лигирование и восстановление ДНК, окислительно-восстановительный цикл в пути пируватдегидрогеназы и синтез ацетил-КоА для цикла трикарбоновых кислот (Ishino et al., 1986; Сато и Линдал, 1992; Wilkinson et al., 2001; Халкиадаки и Гуаренте, 2012 г .; Chiarugi et al., 2012; Patel et al., 2014).
YrxA (NiaR) оказался чувствительным к ниацину репрессором синтеза NAD de novo в Bacillus subtilis и регуляции транскрипции биосинтеза NAD у бактерий, имеющих ортологи B. subtilis yrxA был определен с использованием сравнительного геномного подхода. и исследования экспрессии (Родионов и др., 2008a). Члены семейства NiaR обычно консервативны в группе Bacillus / Clostridium и в неродственных линиях Fusobacteria и Thermotogales (Rodionov et al., 2008а). Реглон NiaR не ограничивается регуляцией транскрипции nadABC , но у некоторых видов он также охватывает спасение ниацина (гены pncAB ) и содержит нехарактеризованные мембранные белки, предположительно участвующие в транспорте ниацина (Родионов и др., 2008a). Более того, члены семейства NiaP (участвующие в поглощении ниацина) консервативны не только у бактерий, но и у многоклеточных эукариот, включая человека, что предполагает предполагаемое участие NiaP в утилизации ниацина этими организмами (Родионов и др., 2008а).
Это исследование объясняет транскриптомный ответ S. pneumoniae D39 на ниацин и регуляцию генов niaX, pnuC и nadC . Мы установили, что регулятор транскрипции NiaR действует как репрессор транскрипции для генов niaX, pnuC и nadC , участвующих в захвате и утилизации ниацина. Предполагаемый сайт оператора (5′-TACWRGTGTMTWKACASYTRWAW-3 ′, где R = A / G, K = G / T, S = G / C, Y = T / C, W = A / T и M = A / C) NiaR в промоторных областях niaX, pnuC и nadC предсказывается и впоследствии подтверждается мутацией сайтов-операторов NiaR в соответствующих промоторах.
Материалы и методы
Бактериальные штаммы и условия роста
Бактериальные штаммы и плазмиды, использованные в этом исследовании, перечислены в таблице 1. S. pneumonia e D39 выращивали, как описано ранее (Kloosterman et al., 2006; Afzal et al., 2014). Для анализов β-галактозидазы производные S. pneumoniae D39 выращивали в среде определенного химического состава (CDM) (Neves et al., 2002) с 10 мМ ниацином или без него. CDM был приготовлен без ниацина. Для отбора антибиотиков в среду добавляли следующие концентрации антибиотиков: 150 мкг / мл спектиномицина и 2.5 мкг / мл тетрациклина для S. pneumoniae и 100 мкг / мл ампициллина для E. coli . Все бактериальные штаммы, использованные в этом исследовании, хранили в 10% (об. / Об.) Глицерине при -80 ° C. Для ПЦР-амплификации в качестве матрицы использовали хромосомную ДНК S. pneumoniae D39 (Lanie et al., 2007). Праймеры, использованные в этом исследовании, основаны на последовательности генома S. pneumoniae D39 и перечислены в таблице 2.
Таблица 1. Список штаммов и плазмид, использованных в данном исследовании .
Таблица 2. Список праймеров, использованных в этом исследовании .
Строительство
niaR Mutant Мутант niaR (MA1300) был сконструирован в S. pneumoniae D39 путем аллельной замены кассетой устойчивости к спектиномицину. Пары праймеров niaR-1 / niaR-2 и niaR-3 / niaR-4 использовали для создания ПЦР-фрагментов левой и правой фланкирующих областей niaR с использованием ДНК-полимеразы Phusion ® High-Fidelity.Продукты ПЦР левого и правого фланкирующих участков niaR содержат сайтов AscI и NotI соответственно. Маркер устойчивости к спектиномицину, который был амплифицирован праймерами SpecR / SpecF из pORI38, также содержит сайтов AscI и NotI на своих концах. Затем путем рестрикции и лигирования левую и правую фланкирующие области niaR были слиты с геном устойчивости к спектиномицину. Полученные продукты лигирования трансформировали в S.pneumoniae D39 дикого типа, и отбор мутанта проводили по соответствующей концентрации спектиномицина. Делецию niaR дополнительно подтверждали с помощью ПЦР с использованием пары праймеров NiaR-Conf-1 / NiaR-Conf-2 и секвенирования ДНК.
Конструирование промотора
слияния lacZ и их использование в анализах β-галактозидазы Хромосомные транскрипционные слияния lacZ с промоторами niaX, pnuC и nadC были сконструированы в pPP2 (Halfmann et al., 2007) с парами праймеров, указанными в таблице 2, что дает pMA1301-03 соответственно. Эти конструкции были дополнительно введены в D39 дикого типа и D39 Δ niaR (MA1300), в результате чего были получены штаммы MA1301-03 и MA1304-06, соответственно. Следующие lacZ -слияния P niaX , P pnuC и P nadC с мутациями в сайте NiaR были сделаны в pPP2 (Halfmann et al., 2007) с использованием пар праймеров, указанных в таблице 2: P niaX-M (мутация в сайте niaR ), P pnuC-M (мутация в сайте niaR ), P nadC-R1 (мутация в сайте niaR 1) и P nadC-R2 (мутация в niaR сайте 2), что приводит к плазмидам pMA1304-07 соответственно.Эти конструкции были введены в штамм S. pneumoniae D39 дикого типа, в результате чего были получены штаммы MA1307-1310, соответственно. Аналогичным образом, хромосомные транскрипционные слияния lacZ с промоторами fba, rex, gapN, pncB, gap, adhE и adhB2 были сконструированы в pPP2 (Halfmann et al., 2007) с парами праймеров, указанными в таблице 2, в результате в pMA1308-14 соответственно. Эти конструкции затем вводили в D39 дикого типа, получая штаммы MA1311-17, соответственно.Все плазмидные конструкции дополнительно проверяли на наличие правильной вставки с помощью ПЦР и секвенирования ДНК.
Анализы β-галактозидазы выполняли, как описано ранее (Israelsen et al., 1995; Halfmann et al., 2007), с использованием клеток, которые были собраны в фазе среднего экспоненциального роста и выращены в CDM (Neves et al., 2002) с или без ниацина, как указано в разделе результатов.
Анализ микрочипов
Анализ микроматрицы выполняли, как описано ранее (Afzal et al., 2015; Shafeeq et al., 2015). Для анализа ДНК-микрочипов S. pneumoniae в присутствии ниацина транскриптом S. pneumoniae D39 дикого типа, выращенного в повторностях в CDM с 10 мМ ниацина, сравнивали с транскриптомом, выращенным в CDM с 0 мМ ниацина и собирали. на их соответствующих фазах среднего экспоненциального роста.
Для анализа ДНК микрочипов D39 Δ niaR транскриптом S. pneumoniae D39 Δ niaR сравнивали с S.pneumoniae D39 дикого типа выращивали в повторностях в полной CDM и собирали на соответствующих фазах среднего экспоненциального роста. Полный CDM содержит 8 мкМ ниацина. Процедуры анализа ДНК-микрочипов выполнялись, как описано ранее (Afzal et al., 2015; Shafeeq et al., 2015). Для идентификации дифференциально экспрессируемых генов применяли байесовский p <0,001 и пороговое значение кратного изменения> 1,5. Данные микрочипов были представлены в GEO (Gene Expression Omnibus) под номерами доступа GSE
и GSE. Результаты
Регулирование ниацин-зависимых генов в
S. pneumoniae D39 Сравнение микрочипов S. pneumoniae D39, выращенных в CDM с 0 мМ, с тем же штаммом, выращенным в CDM с 10 мМ ниацином, было выполнено для изучения влияния ниацина на транскриптом S. pneumoniae D39 дикого типа. CDM был приготовлен без ниацина. Ряд генов / оперонов дифференциально экспрессировался в тестируемых нами условиях (таблица 3). Конкретный кластер генов ( spd-0093-0095 ) был значительно активирован в отсутствие ниацина.Этот кластер генов кодирует три гипотетических белка, которые являются предполагаемыми мембранными белками. Другой кластер генов ( spd-1798-1802 ) был значительно активирован в отсутствие ниацина. Этот кластер генов состоит из регулятора реакции связывания ДНК (кодируется spd-1798 ), сенсорной гистидинкиназы (кодируется spd-1799 ), двух гипотетических белков (кодируется spd-1800 и spd- 1802 ) и транспортер ABC (кодируется spd-1801 ).Некоторые гены, которые, по-видимому, являются частью кластера генов, также были подавлены в наших тестируемых условиях ( spd-0113-15 и spd-0122-24 ). Все эти гены кодируют гипотетические белки, и роль этих генов требует дальнейшего изучения.
Таблица 3. Резюме сравнения транскриптомов S. pneumoniae D39 дикого типа, выращенного в CDM с 0 мМ ниацина, для выращивания в CDM с 10 мМ ниацина .
Предполагаемые гены пути биосинтеза ниацина были значительно активированы в отсутствие ниацина ( fba, rex, gapN, niaX, pncB — nadE, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 ). fba кодирует фруктозо-бисфосфатальдолазу, тогда как rex кодирует окислительно-восстановительный регулятор транскрипции. Аналогично, gapN кодирует глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназу, которая участвует в образовании НАДФН из НАДН. pncB кодирует никотинатфосфорибозилтрансферазу, которая превращает никотинат в никотинатный D-рибонуклеотид, и наоборот, , тогда как nadE кодирует синтетазу NAD + , которая преобразует коды деамино-NAD 9273 + + NAD 9273 + NAD + для алкогольдегидрогеназы. gap кодирует другую глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназу, а adhE кодирует железосодержащую алкогольдегидрогеназу, тогда как adhB2 кодирует цинксодержащую алкогольдегидрогеназу. NiaX (кодируемый niaX ) представляет собой субстрат-специфический компонент, предсказанный транспортером ECF ниацина, тогда как PnuC (кодируемый pnuC ) является транспортером рибозилникотинамида. NadC (кодируемый nadC ) представляет собой никотинат-нуклеотидпирофосфорилазу, и было предложено преобразовать хинолинат, образованный из аланина, аспартата и глутамата, а также метаболизм триптофана в никотинат-D-рибонуклеотид (Kanehisa et al., 2014).
Ниацин-зависимая экспрессия
fba, rex, gapN, niaX, pncB, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 Наши данные о ниацин-зависимом микрочипе, упомянутые выше, показали роль ниацина в регуляции fba, rex, gapN, niaX, pncB, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 . Чтобы подтвердить результаты наших микроматриц и продолжить изучение влияния ниацина на экспрессию fba, rex, gapN, niaX, pncB, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 , мы выполнили β-галактозидазу. тесты с промотором lacZ — слияниями этих генов, сконструированными в S.pneumoniae D39 дикого типа. Наши данные о β-галактозидазе показали, что экспрессия P fba-lacZ , P rex — lacZ , P gapN — lacZ , P niaX — lacZ , P
0000 — pnc lacZ , P pnuC — lacZ , P разрыв — lacZ , P nadC — lacZ , P adhE — lacZ и P lacZ , а P lacZ , а P lacZ , а P lacZ значительно увеличился в отсутствие ниацина в среде (рис. 1).Эти данные дополнительно подтверждают наши данные микрочипа, описанные выше, и предполагают роль ниацина в регуляции этих генов. Рисунок 1. Уровни экспрессии (в единицах Миллера) P niaX-lacZ , P pnuC-lacZ , P nadC-lacZ , P fba4 Z, rex-lacZ , P pncB-lacZ , P gap-lacZ , P adhE-lacZ , P adhB3000 P
N000, adhB2-N — lacZ в CDM с 0 и 10 мМ ниацина в S.pneumoniae D39 дикого типа . Стандартные отклонения трех независимых экспериментов указаны в столбцах. Статистическую значимость различий в уровнях экспрессии определяли с помощью однофакторного дисперсионного анализа (NS, недостоверно, ** P <0,001 и *** P <0,0001). Микроматричный анализ D39 Δ
niaR Гены ниацина в основном регулируются транскрипционным регулятором NiaR у различных бактерий (Новичков и др., 2010).У Firmicutes и Thermotogales регулятор транскрипции NiaR регулирует биосинтез NAD и утилизацию ниацина (Rodionov et al., 2008a). NiaR был впервые изучен на B. subtilis как реагирующий на ниацин репрессор транскрипции, который связывается со своими ДНК-мишенями в присутствии ниацина (Rossolillo et al., 2005). NiaR принадлежит к уникальному семейству белков, которое обладает N-концевым доменом связывания ДНК HTH (Helix-Turn-Helix) (PF08279) и C-концевым эффекторным связывающим доменом, называемым доменом 3H (PF02829). S. pneumoniae также обладает регулятором транскрипции NiaR, который может участвовать в регуляции описанных выше генов, регулируемых ниацином. Поэтому мы решили продолжить изучение роли NiaR в регуляции этих генов.
Был сконструирован делеционный мутант гена niaR , и было проведено сравнение микрочипов S. pneumoniae D39 Δ niaR с D39 дикого типа, выращенных в полной CDM, для исследования роли NiaR в S.pneumoniae D39. Полный CDM содержит 8 мкМ ниацина. В таблице 4 суммированы изменения транскриптома, вызванные делецией niaR в S. pneumoniae D39. Экспрессия niaR подавлялась примерно в 3 раза, что подтверждает делецию niaR в D39 Δ niaR . Экспрессия nadC, niaX и pnuC была значительно повышена в D39 Δ niaR , что указывает на роль NiaR в качестве репрессора транскрипции niaX, nadC и pnuC в S.pneumoniae D39. Также была повышена экспрессия spd-1824 и spd-1827 (кодирующих гипотетические белки). Spd — 1827 находится рядом с nadC ( spd-1826 ), но транскрибируется в противоположном направлении.
Таблица 4. Резюме сравнения транскриптомов S. pneumoniae D39 Δ niaR по сравнению с диким типом D39, выращенным в полной CDM .
Роль NiaR как репрессора транскрипции для
niaX, nadC и pnuC Для дальнейшего изучения роли NiaR в регуляции niaX, nadC и pnuC мы трансформировали lacZ -слияния промоторных областей niaX, nadC и pnuC в D39 . niaR и выполнили анализы β-галактозидазы в полной CDM (рис. 2). Результаты анализов β-галактозидазы показали, что активность всех этих промоторов значительно увеличилась в D39 Δ niaR по сравнению с D39 дикого типа, подтверждая роль NiaR в качестве репрессора транскрипции niaX, nadC и . pnuC .
Рисунок 2. Уровни экспрессии (в единицах Миллера) P niaX-lacZ , P pnuC-lacZ и P nadC — lacZ в комплекте S. pneumoniae D39 дикого типа и D39 Δ niaR . Стандартные отклонения трех независимых экспериментов указаны в столбцах. Статистическую значимость различий в уровнях экспрессии определяли с помощью однофакторного дисперсионного анализа (NS, не статистически значимо, ** P <0.001 и *** P <0,0001).
Прогнозирование и подтверждение сайта NiaR в P
niaX , P nadC и P pnuC Промоторные области всех генов с усиленной регуляцией, включая spd_1824 и spd_1827 , были проанализированы с помощью программного обеспечения Genome2D (Baerends et al., 2004) и поиска с помощью пробоотборника MEME-мотива (Bailey and Elkan, 1994). Палиндромоподобная последовательность длиной 22 п.н. была обнаружена в промоторных областях niaX, nadC и pnuC (рис. 3).Эта последовательность ДНК может служить сайтом оператора NiaR в S. pneumoniae . P niaX из различных стрептококков также анализировали на наличие сайта NaiR. Сайт NiaR, присутствующий в промоторной области niaX различных стрептококков, показан на фиг.4. Была построена матрица весов, основанная на этих предполагаемых сайтах NiaR (5′-TACWRGTGTMTWKACASYTRWAW -3 ‘) (фиг.4).
Рисунок 3. Организация генов, регулируемых NiaR, в S.pneumoniae D39 . Предполагаемые последовательности операторов NiaR имеют прямоугольную форму, а сайты инициации трансляции выделены курсивом, тогда как структуры леденцов представляют собой предполагаемые терминаторы транскрипции. См текст для дополнительной информации.
Рисунок 4. Идентификация сайта оператора NiaR. (A) Весовая матрица идентифицированного сайта оператора NiaR в промоторных областях niaX, nadC и pnuC . (B) Положение сайта оператора NiaR в промоторной области niaX, nadC и pnuC у различных стрептококков.Сайты предполагаемых операторов NiaR выделены жирным шрифтом и подчеркнуты. SP, S. pneumoniae ; SI, Streptococcus mitis ; SA, Streptococcus agalactiae ; SD, Streptococcus dysgalactiae ; SE, Streptococcus equi; SG, Streptococcus gallolyticus ; SN, Streptococcus gordonii ; SM, Streptococcus mutans ; SO, Streptococcus pyogenes ; SS, Streptococcus sanguinis ; SU, Streptococcus suis ; СТ, Стрептококки термофилы ; и SB, Streptococcus uberis .
Предсказанный сайт оператора NiaR, присутствующий в промоторных областях niaX, nadC и pnuC , был дополнительно подтвержден экспериментом с промоторной мутацией. С этой целью мы сделали транскрипционные lacZ -слияния P niaX , P pnuC и P nadC , где консервативные основания в предполагаемых сайтах NiaR были мутированы в P niaX (5′- TACTAGT GT ATATGC A GTTAAA-3 ‘- 5’- TACTAGT AC ATATGC C GTTAAA -3′), P pnuC (5′- TTTTACT GT AAAGAC A ‘GTTG ′ — TTTTACT AC AAAGAC G GTTGAC -3 ′), P nadC-R1 (5′- TACAATT GT CTTGAC A ATTGTA -3 ′ до 5′- TACAATT AC CTT AC ATTGTA -3 ′) и P nadC-R2 (5′- GACAATT GT ATTGAC A CTTGTT -3 ′ до 5′- GACAATT AC ATTGAC C CTTGTT -3 ′).Анализы β-галактозидазы проводили на клетках, выращенных в полной CDM. Полный CDM содержит 8 мкМ ниацина. Экспрессия P niaX и P pnuC с мутантными консервативными основаниями операторских сайтов NiaR значительно увеличилась в S. pneumoniae D39 дикого типа, подтверждая, что предсказанные сайты NiaR присутствуют в промоторных областях niaX и pnuC активны и неповреждены в S. pneumoniae (рис. 5). Два предполагаемых операторских сайта для NiaR присутствуют в P nadC (R1 и R2).Мы мутировали оба сайта по отдельности и провели анализ β-галактозидазы. Мы могли наблюдать только дерепрессию (вызванную NiaR) активности P nadC , когда сайт оператора NiaR 2 (R2) был мутирован, и не наблюдали никаких изменений в активности P nadC из-за мутации в сайте оператора NiaR 1. (R1) (Рисунок 5). Эти данные предполагают, что сайт оператора 2 (R2) является функциональным сайтом оператора в P nadC .
Рисунок 5. Уровни экспрессии (в единицах Миллера) P niaX-lacZ , P pnuC-lacZ и P nadC-lacZ с мутированными и немутантными сайтами операторов NiaR в С.pneumoniae D39 дикого типа, выращенная в полном CDM . Стандартные отклонения трех независимых экспериментов указаны в столбцах. Статистическую значимость различий в уровнях экспрессии определяли с помощью однофакторного дисперсионного анализа (NS, недостоверно, ** P <0,001 и *** P <0,0001).
Обсуждение
НАД — важный кофактор, используемый всеми живыми организмами. Синтез НАД — это строго регулируемый внутриклеточный процесс у бактерий (Huang et al., 2009). Бактерии приобретают НАД двумя основными путями: через синтез de novo и через спасательный путь. Некоторые бактерии не обладают способностью de novo синтезировать НАД и должны использовать спасательный путь для импорта ниацина или никотинамид рибозида через импортеры субстрата NiaX и PnuC соответственно. Путь de novo синтезирует НАД из аспарагиновой кислоты, тогда как путь спасения приносит промежуточные звенья на многие ступени ниже по ходу пути синтеза НАД de novo (Родионов и др., 2008b). NiaX и PnuC являются двумя основными импортерами в пути спасения NAD, где NiaX отвечает за поглощение ниацина, а PnuC транспортирует никотинамид рибозид (Herbert et al., 2003; Sauer E. et al., 2004; Rodionov et al., 2008a). , 2009). Наше текущее исследование демонстрирует транскриптомный ответ S. pneumoniae на ниацин и показывает, что ряд генов, включая pnuC, pncB и nadC , дифференциально экспрессируются в тестируемых условиях. Мы также демонстрируем, что регулятор транскрипции NiaR действует как репрессор транскрипции niaX, pnuC и nadC в присутствии ниацина.
Внеклеточный белок, способный модифицировать никотинамидмононуклеотид до импортируемой формы, по-видимому, помогает NiaX и PnuC импортировать никотинамидмононуклеотид, или может быть другая система импорта в S. pneumoniae (Johnson et al., 2015). Существует значительная вариабельность между гомологами PnuC (Jaehme et al., 2014) и гомологами PnuC из Haemophilus influenzae и Salmonella typhimurium не импортируют никотинамидмононуклеотид, но могут преобразовывать его в импортируемую форму для PnuC (никотинамид) через NadN или AphA соответственно (Kemmer et al., 2001; Grose et al., 2005). Все белки PnuC из H. influenzae, S. typhimurium и S. pneumoniae обладают мотивом связывания никотинамидмононуклеотида. Тем не менее, гомологи PnuC из многих других организмов лишены консенсусных связывающих остатков (Kemmer et al., 2001; Sauer E. et al., 2004; Grose et al., 2005). Эти наблюдения показывают, что различные группы импортеров субстрата-спасателя НАД (обозначенные как PnuC) импортируют никотинамид-рибозид и / или никотинамидмононуклеотид, и что NiaX импортирует ниацин и / или никотинамидмононуклеотид в качестве предпочтительных субстратов.Более того, аминокислоты в Salmonella PnuC, ограничивающие импорт никотинамидмононуклеотида, не законсервированы в пневмококках, что позволяет предположить, что пневмококковый PnuC может допускать этот субстрат вместе с никотинамид рибозидом. Хотя и PnuC, и NiaX в S. pneumoniae , возможно, приобрели способность импортировать никотинамидмононуклеотид, дополнительный импортер (который еще не охарактеризован) также может присутствовать (Johnson et al., 2015). Роль PnuC в патогенезе пневмококков была изучена, и PnuC может быть потенциальной жизнеспособной терапевтической мишенью для малых молекул, чтобы остановить прогрессирование заболевания у хозяина (Johnson et al., 2015). Предлагаемый путь НАД в S. pneumoniae утверждает, что ниацин и никотинамид проникают в клетки через NiaX, а PnuC транспортирует никотинамид-рибозид внутрь клетки, тогда как переносчик никотинамидмононуклеотида неизвестен (Johnson et al., 2015). spd-1411 кодирует никотинамидазу (PncA), которая превращает никотинамид в ниацин, который далее превращается в никотинатмононуклеотид фосфорибозилтрансферазой никотиновой кислоты (PncB) (Johnson et al., 2015). Затем никотинатный мононуклеотид превращается в NAD с помощью NadD и NadE. Более того, NadD (никотинат / никотинамиднуклеотид-аденилилтрансфераза) превращает никотинамид-рибозид и никотинамидмононуклеотид в NAD (Johnson et al., 2015). Увеличение количества никотинамид-рибозидов объясняется несколькими полезными функциями хозяина, включая защиту от митохондриальной миопатии (Khan et al., 2014), потерю слуха (Brown et al., 2014) и ожирение (Cantó et al., 2012). Эти функции могут быть не связаны с увеличением синтеза НАД (Frederick et al., 2015), но может быть связано с общей биодоступностью. В то время как никотинамид рибозид необходим для патогена и хозяина, к счастью, пневмококковый PnuC и его гомолог у других бактерий не имеют гомологии последовательности с какими-либо белками в животном мире. Следовательно, PnuC может быть потенциальной терапевтической мишенью для видов бактерий, экранирующих этот путь, без значимости для млекопитающих, как было эффективно показано с H. influenzae (Sauer E. et al., 2004).
ортологов NiaR были обнаружены у 30 из 45 видов из группы Bacillus / Clostridium (Firmicutes), в дополнение к расходящимся группам Fusobacteria и Thermotogales и для другой группы Bacillus /, Clostrida . был предложен сайт связывания (Родионов и др., 2008а). Существует два разных типа ДНК-связывающих сайтов NiaR, то есть оператор типа I, обнаруженный у Firmicutes и Fusobacteria, и тип II у Thermotogales. Чувствительный к ниацину фактор транскрипции NiaR (известный как YrxA в B. subtilis ) был впервые обнаружен как чувствительный к никотиновой кислоте репрессор оперона биосинтеза de novo NAD ( nadABC ) в B. subtilis (Rossolillo). и др., 2005). Регуляция NiaR генов спасения ниацина pncB (в Lactobacillus plantarum ), pncA (в Streptococcus pyogenes, Streptococcus equi и Clostridium tetani ) и / или salv00porter
С.pneumoniae и Streptococcus mutans ) (Родионов и др., 2008а) встречается реже. Более того, регулон NiaR содержит мембранные белки, которые предположительно играют роль в поглощении ниацина. Наиболее многочисленное семейство NiaP обнаружено у десяти видов, содержащих NiaR (Bacilli, Lactobacilli и Thermotogales), в дополнение к нескольким видам, у которых нет регулятора NiaR (Родионов и др., 2008a). Среди стрептококков и клостридий NiaX обнаружен в двенадцати геномах, а NiaY обнаружен в пяти геномах (бациллы и клостридии).Несколько линий геномных данных подтверждают предполагаемое участие этих семейств генов в поглощении ниацина, включая предсказанную ко-регуляцию с биосинтезом NAD и генами спасения ниацина, а также совместное присутствие с генами спасения ниацина pncB — pncA (Родионов и др. ., 2008а). Наше исследование демонстрирует, что niaX, pnuC и nadC являются генами, которые имеют предполагаемый операторный сайт NiaR в своих промоторных областях и репрессируются NiaR в присутствии ниацина.Мы дополнительно подтвердили сайты операторов NiaR в промоторных областях niaX, pnuC и nadC с помощью исследований мутагенеза. Есть и другие гены, которые дифференциально экспрессируются в наших тестируемых условиях ( fba, rex, gapN, pncB — nadE, gap, spd-1824, spd-1827, adhE и adhB2 ). Изменение экспрессии этих генов предполагает, что эти гены могут играть роль в транспорте и биосинтезе ниацина или они могут быть активированы из-за некоторого косвенного действия генов ниацина.Эти гены не имеют предполагаемого сайта-оператора NiaR в их промоторных областях, что позволяет предположить роль другого регулятора транскрипции в регуляции fba, rex, gapN, pncB — nadE, gap, spd-1824, spd-1827, adhE . , и adhB2 . Поэтому мы предполагаем, что изучение режима регуляции вышеупомянутых генов пролило бы свет на эту возможность. Авторские взносы
Существенный вклад в концепцию или дизайн работы; или сбор, анализ или интерпретация данных для работы: MA, SS и OK.Составление проекта работы или ее критический пересмотр на предмет важного интеллектуального содержания: MA, SS и OK. Окончательное утверждение публикуемой версии: MA, SS и OK. Согласие нести ответственность за все аспекты работы для обеспечения того, чтобы вопросы, связанные с точностью или целостностью любой части работы, были надлежащим образом исследованы и решены: MA, SS и OK.
Заявление о конфликте интересов
Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.
Благодарности
MA поддерживается Государственным колледжем Университета, Фейсалабад, Пакистан, в рамках программы повышения квалификации профессорско-преподавательского состава HEC в Пакистане.
Список литературы
Афзал М., Манзур И. и Койперс О. П. (2015). Быстрый и надежный конвейер для анализа бактериального транскриптома: тематическое исследование: серин-зависимая регуляция генов в Streptococcus pneumoniae . J. Vis. Exp. 98: e52649. DOI: 10.3791 / 52649
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Афзал, М., Шафик, С., Койперс, О. П. (2014). LacR является репрессором lacABCD , а LacT является активатором lacTFEG , составляющим кластер генов lac в Streptococcus pneumoniae . Заявл. Environ. Microbiol. 80, 5349–5358. DOI: 10.1128 / aem.01370-14
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Баэрэндс, Р. Дж. С., Смитс, В. К., де Йонг, А., Хамоэн, Л. В., Кок, Дж., И Койперс, О. П. (2004). Genome2D: инструмент визуализации для быстрого анализа данных бактериального транскриптома. Genome Biol. 5: R37. DOI: 10.1186 / GB-2004-5-5-r37
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Бейли Т. Л. и Элкан К. (1994). Подбор модели смеси путем максимизации ожидания для обнаружения мотивов в биополимерах. Proc. Int. Конф. Intell. Syst. Мол. Биол. Биол. 2, 28–36.
PubMed Аннотация
Богерт, Д., Де Гроот, Г. Р., и Херманс, П. В. (2004). Streptococcus pneumoniae колонизация: ключ к пневмококковой инфекции. Lancet Infect. Дис. 4, 144–154. DOI: 10.1016 / S1473-3099 (04) 00938-7
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Bräsen, C., Esser, D., Rauch, B., and Siebers, B. (2014). Углеводный обмен у архей: современные сведения о необычных ферментах и путях их регуляции. Microbiol. Мол. Биол. Ред. 78, 89–175. DOI: 10.1128 / MMBR.00041-13
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Браун, К.D., Maqsood, S., Huang, J.-Y., Pan, Y., Harkcom, W., Li, W., et al. (2014). Активация SIRT3 предшественником никотинамида рибозида NAD + защищает от потери слуха, вызванной шумом. Cell Metab. 20, 1059–1068. DOI: 10.1016 / j.cmet.2014.11.003
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Cantó, C., Houtkooper, R.H., Pirinen, E., Youn, D.Y., Oosterveer, M.H., Cen, Y., et al. (2012). Никотинамид рибозид, предшественник НАД (+), усиливает окислительный метаболизм и защищает от ожирения, вызванного диетой с высоким содержанием жиров. Cell Metab. 15, 838–847. DOI: 10.1016 / j.cmet.2012.04.022
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Каммингс К. А., Бутсма Х. Дж., Релман Д. А. и Миллер Дж. Ф. (2006). Видовой и штаммоспецифический контроль сложного гибкого регулона с помощью Bordetella BvgAS. J. Bacteriol. 188, 1775–1785. DOI: 10.1128 / JB.188.5.1775-1785.2006
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Эдвардс, Р. Л., Брайан, А., Жюль, М., Харада, К., Бухризер, К., и Суонсон, М. С. (2013). Никотиновая кислота модулирует экспрессию гена Legionella pneumophila и индуцирует признаки вирулентности. Заражение. Иммун. 81, 945–955. DOI: 10.1128 / IAI.00999-12
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Эгути Ю., Осима Т., Мори Х., Аоно Р., Ямамото К., Исихама А. и др. (2003). Транскрипционная регуляция генов оттока лекарств с помощью EvgAS, двухкомпонентной системы в Escherichia coli . Микробиология 149, 2819–2828. DOI: 10.1099 / mic.0.26460-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Фредерик Д. В., Дэвис Дж. Г., Давила А., Агарвал Б., Мичан С., Пухович М. А. и др. (2015). Повышения синтеза НАД в мышцах с помощью никотинамидфосфорибозилтрансферазы недостаточно для стимуляции окислительного метаболизма. J. Biol. Chem. 290, 1546–1558. DOI: 10.1074 / jbc.M114.579565
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Гроуз, Дж.Х., Бергторссон, У., Сюй, Ю., Стернекерт, Дж., Ходавердян, Б., и Рот, Дж. Р. (2005). Для ассимиляции никотинамидмононуклеотида требуется периплазматическая фосфатаза AphA в Salmonella enterica . J. Bacteriol. 187, 4521–4530. DOI: 10.1128 / JB.187.13.4521-4530.2005
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Халфманн А., Хакенбек Р. и Брукнер Р. (2007). Новая интегративная репортерная плазмида для Streptococcus pneumoniae . FEMS Microbiol. Lett. 268, 217–224. DOI: 10.1111 / j.1574-6968.2006.00584.x
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Герберт, М., Зауэр, Э., Сметурст, Г., Крайсс, А., Хильперт, А.-К., и Рейдл, Дж. (2003). Мутанты по захвату никотинамид-рибозила в Haemophilus influenzae . Заражение. Иммун. 71, 5398–5401. DOI: 10.1128 / IAI.71.9.5398-5401.2003
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Хуанг, Н., De Ingeniis, J., Galeazzi, L., Mancini, C., Korostelev, Y. D., Rakhmaninova, A. B., et al. (2009). Структура и функция АДФ-рибозозависимого регулятора транскрипции метаболизма НАД. Строение 17, 939–951. DOI: 10.1016 / j.str.2009.05.012
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ишино, Ю., Синагава, Х., Макино, К., Цунасава, С., Сакияма, Ф., и Наката, А. (1986). Нуклеотидная последовательность гена lig и первичная структура ДНК-лигазы Escherichia coli . Мол. Genet Genet. 204, 1–7. DOI: 10.1007 / BF00330179
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Израэльсен, Х., Мадсен, С. М., Вранг, А., Хансен, Э. Б., и Йохансен, Э. (1995). Клонирование и частичная характеристика регулируемых промоторов из Lactococcus lactis, интегрирующих Tn917-lacZ, с новым вектором промоторного зонда pAK80. Заявл. Environ. Microbiol. 61, 2540–2547.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Джеме, М., Гуськов А., Слотбум Д. Дж. (2014). Кристаллическая структура транспортера витамина B3 PnuC, полноразмерного гомолога SWEET. Нат. Struct. Мол. Биол. 21, 1013–1015. DOI: 10.1038 / nsmb.2909
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Джонсон, М. Д. Л., Эчлин, Х., Дао, Т. Х., и Рош, Дж. У. (2015). Характеристика путей спасения НАД и их роль в вирулентности у Streptococcus pneumoniae . Микробиология 161, 2127–2136.DOI: 10.1099 / микрофон. 0.000164
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Юртчук П. (1996). «Бактериальный метаболизм», в Медицинская микробиология , ред. С. Барон (Галвестон, Техас: Медицинский филиал Техасского университета в Галвестоне).
Google Scholar
Кадиоглу А., Вейзер Дж. Н., Патон Дж. К. и Эндрю П. В. (2008). Роль факторов вирулентности Streptococcus pneumoniae в респираторной колонизации и болезни хозяина. Нат. Rev. Microbiol. 6, 288–301. DOI: 10.1038 / nrmicro1871
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Канехиса М., Гото С., Сато Ю., Кавасима М., Фурумичи М. и Танабэ М. (2014). Данные, информация, знания и принципы: назад к метаболизму в KEGG. Nucleic Acids Res. 42, D199 – D205. DOI: 10.1093 / nar / gkt1076
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Кеммер, Г., Рейли, Т. Дж., Шмидт-Браунс, Дж., Злотник, Г. В., Грин, Б. А., Фиске, М. Дж. И др. (2001). NadN и e (P4) необходимы для использования NAD и никотинамидмононуклеотида, но не никотинамид рибозида в Haemophilus influenzae . J. Bacteriol. 183, 3974–3981. DOI: 10.1128 / JB.183.13.3974-3981.2001
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Хан, Н. А., Ауранен, М., Паэтау, И., Пиринен, Э., Евро, Л., Форсстрём, С., и др. (2014). Эффективное лечение митохондриальной миопатии никотинамид рибозидом, витамином B3. EMBO Mol. Med. 6, 721–731. DOI: 10.1002 / emmm.201403943
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Клоостерман, Т. Г., Бийлсма, Дж. Дж. Э., Кок, Дж., И Койперс, О. П. (2006). Чтобы угостить соседей: расширение молекулярного набора инструментов для Streptococcus pneumoniae . Микробиология 152, 351–359. DOI: 10.1099 / mic.0.28521-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Котрбова-Козак, А., Котрба, П., Инуи, М., Сайдок, Дж., И Юкава, Х. (2007). Транскрипционно регулируемый ген adhA кодирует алкогольдегидрогеназу, необходимую для утилизации этанола и н-пропанола у Corynebacterium glutamicum R. Appl. Microbiol. Biotechnol. 76, 1347–1356. DOI: 10.1007 / s00253-007-1094-6
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Lanie, J. A., Ng, W. L., Kazmierczak, K. M., Andrzejewski, T. M., Davidsen, T. M., Wayne, K. J., et al. (2007). Последовательность генома вирулентного штамма D39 серотипа 2 Эйвери из Streptococcus pneumoniae и сравнение с таковой неинкапсулированного лабораторного штамма R6. J. Bacteriol. 189, 38–51. DOI: 10.1128 / JB.01148-06
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Луонг, Т. Т., Ким, Э.-Х., Бак, Дж. П., Нгуен, К. Т., Чой, С., Брилес, Д. Е. и др. (2015). Этанол-индуцированная алкогольдегидрогеназа E (AdhE) усиливает пневмолизин у Streptococcus pneumoniae . Заражение. Иммун. 83, 108–119. DOI: 10.1128 / IAI.02434-14
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Масуда, Н., и Черч, Г. М. (2002). Экспрессия гена Escherichia coli зависит от уровня регулятора ответа EvgA. J. Bacteriol. 184, 6225–6234. DOI: 10.1128 / JB.184.22.6225-6234.2002
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Мацубара К., Йокудзи Ю., Атоми Х. и Иманака Т. (2011). Биохимическая и генетическая характеристика трех метаболических путей у Thermococcus kodakarensis, связывающих глицеральдегид-3-фосфат и 3-фосфоглицерат. Мол. Microbiol. 81, 1300–1312. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2011.07762.x
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
McPheat, W. L., Wardlaw, A. C., and Novotny, P. (1983). Модуляция Bordetella pertussis никотиновой кислотой. Заражение. Иммун. 41, 516–522.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Миллер, Дж. Ф., Рой, К. Р. и Фалькоу, С. (1989). Анализ регуляции гена вирулентности Bordetella pertussis с использованием транскрипционных слияний в Escherichia coli . J. Bacteriol. 171, 6345–6348. DOI: 10.1128 / jb.171.11.6345-6348.1989
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Невес А. Р., Вентура Р., Мансур Н., Ширман К., Гассон М. Дж., Мэйкок К. и др. (2002). Контролируется ли гликолитический поток в Lactococcus lactis в первую очередь окислительно-восстановительным зарядом? Кинетика пулов НАД (+) и НАДН определена in vivo методом 13С ЯМР. J. Biol. Chem. 277, 28088–28098. DOI: 10.1074 / jbc.M202573200
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Нишино, К., Инадзуми, Ю., Ямагути, А. (2003). Глобальный анализ регулируемых EvgA генов двухкомпонентной регуляторной системы у Escherichia coli . J. Bacteriol. 185, 2667–2672. DOI: 10.1128 / JB.185.8.2667-2672.2003
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Нобельманн Б. и Ленгелер Дж. У. (1996). Молекулярный анализ генов gat из Escherichia coli и их роли в транспорте и метаболизме галактита. Дж.Бактериол. 178, 6790–6795. DOI: 10.1128 / jb.178.23.6790-6795.1996
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Новичков П.С., Лайкова О.Н., Новичкова Е.С., Гельфанд М.С., Аркин А.П., Дубчак И. и др. (2010). RegPrecise: база данных контролируемых геномных выводов о взаимодействиях регулятора транскрипции у прокариот. Nucleic Acids Res. 38, D111 – D118. DOI: 10.1093 / nar / gkp894
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Патель, М.С., Немерия, Н. С., Фьюри, В., Джордан, Ф. (2014). Комплексы пируватдегидрогеназы: функция и регуляция на основе структуры. J. Biol. Chem. 289, 16615–16623. DOI: 10.1074 / jbc.R114.563148
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Филлипс, Н. Дж., Джон, К. М., Рейндерс, Л. Г., Гибсон, Б. В., Апичелла, М. А., и Гриффисс, Дж. М. (1990). Структурные модели липоолигосахаридов клеточной поверхности Neisseria gonorrhoeae и Haemophilus influenzae . Biomed. Environ. Масс-спектрометрия. 19, 731–745. DOI: 10.1002 / bms.12001
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Родионов Д.А., Де Инженис, Дж., Манчини, К., Чимадамор, Ф., Чжан, Х., Остерман, А. Л. и др. (2008b). Транскрипционная регуляция метаболизма НАД в бактериях: семейство NrtR регуляторов, связанных с Nudix. Nucleic Acids Res. 36, 2047–2059. DOI: 10.1093 / nar / gkn047
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Родионов, Д.A., Hebbeln, P., Eudes, A., ter Beek, J., Rodionova, I.A., Erkens, G. B., et al. (2009). Новый класс модульных транспортеров витаминов у прокариот. J. Bacteriol. 191, 42–51. DOI: 10.1128 / JB.01208-08
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Родионов Д.А., Ли X., Родионова И.А., Янг, К., Сорчи, Л., Дервин, Э. и др. (2008a). Транскрипционная регуляция метаболизма НАД у бактерий: геномная реконструкция регулона NiaR (YrxA). Nucleic Acids Res. 36, 2032–2046. DOI: 10.1093 / nar / gkn046
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Россолилло, П., Маринони, И., Галли, Э., Колозимо, А., и Альбертини, А. М. (2005). YrxA является регулятором транскрипции, который репрессирует de novo биосинтез NAD в Bacillus subtilis . J. Bacteriol. 187, 7155–7160. DOI: 10.1128 / JB.187.20.7155-7160.2005
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Зауэр, Э., Мерданович, М., Мортимер, А. П., Брингманн, Г., и Рейдл, Дж. (2004). PnuC и использование аналога никотинамид рибозида 3-аминопиридина в Haemophilus influenzae . Антимикробный. Агенты Chemother. 48, 4532–4541. DOI: 10.1128 / AAC.48.12.4532-4541.2004
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Зауэр У., Канонако Ф., Хери С., Перрено А. и Фишер Э. (2004). Растворимые и связанные с мембраной трансгидрогеназы UdhA и PntAB выполняют различные функции в метаболизме НАДФН Escherichia coli . J. Biol. Chem. 279, 6613–6619. DOI: 10.1074 / jbc.M311657200
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Шнайдер Д. Р. и Паркер К. Д. (1982). Влияние пиридинов на фенотипические свойства Bordetella pertussis . Заражение. Иммун. 38, 548–553.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Шафик, С., Афзал, М., Энрикес-Нормарк, Б., и Койперс, О. П. (2015). Транскрипционное профилирование регулируемых UlaR генов в Streptococcus pneumoniae . Genomics Data 4, 57–59. DOI: 10.1016 / j.gdata.2015.02.004
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Сировер, М.А. (2011). О функциональном разнообразии глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы: биохимические механизмы и регуляторный контроль. Biochim. Биофиз. Acta 1810, 741–751. DOI: 10.1016 / j.bbagen.2011.05.010
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Вэй, З., Фу, Ю., Чжоу, Э., Тянь, Ю., Yao, M., Li, Y., et al. (2014). Влияние ниацина на интернализацию Staphylococcus aureus в эпителиальные клетки молочной железы крупного рогатого скота путем модуляции активации NF-κB. Microb. Патог. 71–72, 62–67. DOI: 10.1016 / j.micpath.2014.03.005
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Влияние высоких концентраций никотиновой кислоты и никотинамида на рост некоторых стрептококков и пневмококков на JSTOR
Abstract Рост пневмококков, гемолитических стрептококков и стрептококков из групп Enterococcus и viridans в различной степени задерживался, а в некоторых случаях полностью подавлялся в присутствии от 5000 до 20000 мкг на мл никотиновой кислоты или никотинамида в среде с мясным настоем пептон-глюкозы. .Энтерококки и стрептококки viridans несколько меньше подвержены влиянию избыточного количества витамина, чем гемолитические стрептококки и плевмококки. При pH 6,5 высокие концентрации никотиновой кислоты были более ингибирующими, чем при pH 7,5, но при этих уровнях pH не было большой разницы в действии никотинамида.
Journal Information Основанный в 1904 году, The Journal of Infectious Diseases является ведущим изданием в Западном полушарии для оригинальных исследований патогенеза, диагностики и лечения инфекционных заболеваний, микробов, вызывающих их, и нарушений иммунных механизмов хозяина.Статьи в JID включают результаты исследований в области микробиологии, иммунологии, эпидемиологии и смежных дисциплин. Опубликовано для Общества инфекционных болезней Америки.
Информация об издателе Oxford University Press — это отделение Оксфордского университета. Издание во всем мире способствует достижению цели университета в области исследований, стипендий и образования. OUP — крупнейшая в мире университетская пресса с самым широким глобальным присутствием. В настоящее время он издает более 6000 новых публикаций в год, имеет офисы примерно в пятидесяти странах и насчитывает более 5500 сотрудников по всему миру.Он стал известен миллионам людей благодаря разнообразной издательской программе, которая включает научные работы по всем академическим дисциплинам, библии, музыку, школьные и университетские учебники, книги по бизнесу, словари и справочники, а также академические журналы.
Рынок никотиновой кислоты | Глобальный отраслевой отчет, 2027 г.
Рынок никотиновой кислоты: незаменимый витамин
- Никотиновая кислота также известна как ниацин, витамин B3 и никотинамид.Это важно для роста и синтеза гормонов. Эта кислота является питательным веществом, которое поддерживает организм, превращая пищу в глюкозу. Затем глюкоза используется для производства энергии в организме.
- Никотиновая кислота также помогает в нормальном функционировании нервной системы и снижает утомляемость. Он широко присутствует в мясе, рыбе, цельных злаках, дрожжах, горохе, бобах, орехах, фруктах и овощах.
- Ткани, присутствующие в нашем организме, превращают абсорбированный ниацин в кофермент никотинамидадениндинуклеотид (НАД).НАД в первую очередь участвует в катаболических реакциях для передачи потенциальной энергии углеводов, жиров и белков аденозинтрифосфату (АТФ).
Что-то сдерживает рост вашей компании на рынке никотиновой кислоты? Запросите брошюру с отчетом здесь
Ключевые драйверы рынка никотиновой кислоты
- Увеличение потребления мяса — ключевой драйвер мирового рынка никотиновой кислоты. Рост мирового потребления мяса на душу населения и повышение осведомленности о потреблении белка в ежедневном рационе увеличили потребление мяса.Никотиновая кислота добавляется в корм для свиней и кур. Ожидается, что это, в свою очередь, будет способствовать развитию мирового рынка никотиновой кислоты в течение прогнозируемого периода.
- Никотиновая кислота используется для лечения диабета 1 типа. Он повышает уровень ЛПВП и используется при лечении пеллагры. Спрос на витаминные добавки растет в связи с повышением осведомленности потребителей о своем здоровье. Это движет мировым рынком никотиновой кислоты.
- Увеличение располагаемого дохода людей во всем мире привело к изменениям в образе жизни.Это, в свою очередь, увеличило потребление нездоровой пищи. Увеличение потребления нездоровой пищи привело к дисбалансу уровня холестерина в организме. Это, в свою очередь, может повысить спрос на лекарства, тем самым стимулируя рынок никотиновой кислоты.
Отсутствие осведомленности о преимуществах рынка никотиновой кислоты для создания препятствий на рынке
- Рынок никотиновой кислоты консолидирован. Никотиновая кислота в очень небольших количествах используется в производстве лекарств, косметики и т. Д.
- На рынке доминируют несколько производителей со всего мира. Низкая осведомленность о преимуществах никотиновой кислоты препятствует глобальному рынку никотиновой кислоты.
Сегментация рынка никотиновой кислоты
- В зависимости от отрасли, в которой работают конечные пользователи, глобальный рынок никотиновой кислоты можно разделить на промышленный рынок, кормовые добавки, фармацевтические препараты, косметику, продукты питания и напитки. Никотиновая кислота используется для подготовки металлических поверхностей при производстве цинковых и кадмиевых отбеливателей.Он также используется в качестве осветляющей добавки в металлических ваннах, не содержащих цианидов, для гальванического цинка и других металлов.
- Никотиновая кислота используется в качестве пищевой добавки для улучшения цвета фарша. Он вступает в реакцию с гемоглобином и миоглобином, присутствующими в мясе, с образованием ярко окрашенного комплекса.
- Никотиновая кислота используется в составе кремов для кожи, лосьонов для волос и других продуктов личной гигиены в косметической промышленности. Кроме того, кислота защищает кожу от солнечных лучей. Рост производства премиальных брендов косметических средств по уходу за кожей стимулировал рост рынка косметики.
- Потребители во всем мире постоянно стремятся обновлять и расширять свои знания о продуктах по уходу за кожей. Они активно занимаются продажами люксовых и премиальных брендов в Интернете. Эти факторы привели к увеличению продаж брендов средств по уходу за кожей премиум-класса, что повысило спрос на косметику во всем мире. Никотиновая кислота в форме никотинамида используется для устранения дисбаланса, создаваемого коферментами никотинамида, присутствующими в коже, с возрастом. Ожидается, что это, в свою очередь, станет движущей силой рынка в ближайшем будущем.
- Кроме того, никотиновая кислота в форме ниацинамида помогает регулировать биосинтез кератиноцитов, которые используются для производства кератина. Кератин — это тип белка, который защищает эпителиальные клетки от повреждений или стресса, а также используется для роста волос. Кроме того, изменения в образе жизни привели к увеличению выпадения волос, что, в свою очередь, может увеличить спрос на никотиновую кислоту в ближайшем будущем. Это, в свою очередь, движет мировым рынком никотиновой кислоты.
Застряли в конкурентной борьбе с другими брендами? Запросите индивидуальный отчет о конкуренции на рынке никотиновой кислоты здесь
Ожидается, что Азиатско-Тихоокеанский регион займет основную долю мирового рынка никотиновой кислоты
- С точки зрения региона глобальный рынок никотиновой кислоты можно разделить на Азиатско-Тихоокеанский регион, Европу, Северную Америку, Ближний Восток и Африку и Латинскую Америку. Ожидается, что Азиатско-Тихоокеанский регион будет составлять основную долю мирового рынка в течение прогнозируемого периода.В Китае и Индии есть большое количество потребителей курицы. Добавки никотиновой кислоты даются цыплятам и свиньям для удовлетворения основных потребностей роста их организма. Это, в свою очередь, по прогнозам, приведет к увеличению спроса на никотиновую кислоту в ближайшем будущем.
- По прогнозам, в связи с растущим влиянием западной культуры увеличение располагаемого дохода, беспокойный образ жизни и высокая численность молодежи будут стимулировать спрос на никотиновую кислоту в ближайшем будущем
- Ожидается, что увеличение численности населения и покупательной способности населения Азиатско-Тихоокеанского региона приведет к увеличению спроса на мясо в регионе.Ожидается, что это, в свою очередь, приведет к увеличению спроса на никотиновую кислоту в ближайшем будущем.
- Ожидается, что рост использования никотиновой кислоты в производстве лекарств для профилактики и лечения пеллагры, которая является заболеванием, вызванным более низким уровнем никотиновой кислоты в организме, будет стимулировать рынок к концу прогнозного периода.
Ключевые участники рынка
Производители никотиновой кислоты в основном занимаются исследованиями и разработками, стратегическими альянсами, а также слияниями и поглощениями для увеличения доли рынка.Основными игроками, действующими на мировом рынке никотиновой кислоты, являются:
- TCI Chemicals (India) Pvt. ООО
- Lonza Group Ltd
- Jubilant Life Sciences
- Koninklijke DSM N.V.
- Resonance Specialties Limited
- Vertellus Holdings LLC
- Zhejiang Lanbo Biotechnology Co., Ltd.
- Lasons India Pvt. ООО
Мировой рынок никотиновой кислоты: объем исследования
Мировой рынок никотиновой кислоты по конечному потреблению
- Промышленное
- Кормовые добавки
- Фармацевтические препараты
- Косметика
- Еда и напитки
Это исследование TMR представляет собой всеобъемлющую структуру динамики рынка.В основном он включает критическую оценку пути потребителей или клиентов, текущих и новых направлений деятельности, а также стратегическую основу, позволяющую руководителям по управлению бизнесом принимать эффективные решения.
Нашей ключевой основой является 4-квадрантная структура EIRS, которая предлагает подробную визуализацию четырех элементов:
- Клиент E Карты опыта
- I наблюдения и инструменты, основанные на исследованиях на основе данных
- Actionable R соответствует всем бизнес-приоритетам
- S трагические рамки для ускорения пути роста
В исследовании предпринята попытка оценить текущие и будущие перспективы роста, неиспользованные возможности, факторы, определяющие их потенциал доходов, а также структуру спроса и потребления на мировом рынке, разбив его на региональную оценку.
Комплексно охватываются следующие региональные сегменты:
- Северная Америка
- Азиатско-Тихоокеанский регион
- Европа
- Латинская Америка
- Ближний Восток и Африка
Структура квадранта EIRS в отчете суммирует наш широкий спектр основанных на данных исследований и рекомендаций для CXO, чтобы помочь им принимать более обоснованные решения для своего бизнеса и оставаться лидерами.
Ниже приведен снимок этих квадрантов.
1. Карта впечатлений клиентов
Исследование предлагает всестороннюю оценку различных путешествий клиентов, имеющих отношение к рынку и его сегментам. Он предлагает различные впечатления клиентов о продуктах и использовании услуг. Анализ позволяет более внимательно изучить их болевые точки и опасения в различных точках контакта с клиентами. Решения для консультаций и бизнес-аналитики помогут заинтересованным сторонам, включая CXO, определить карты клиентского опыта, соответствующие их потребностям.Это поможет им нацелиться на повышение взаимодействия клиентов с их брендами.
2. Анализ и инструменты
Различные идеи в исследовании основаны на тщательно продуманных циклах первичных и вторичных исследований, с которыми аналитики участвуют в ходе исследования. Аналитики и эксперты-консультанты TMR применяют общеотраслевые инструменты количественного анализа клиентов и методологии прогнозирования рынка для получения результатов, что делает их надежными.В исследовании предлагаются не только оценки и прогнозы, но и лаконичная оценка этих цифр в динамике рынка. Эти идеи объединяют основанные на данных исследовательские рамки с качественными консультациями для владельцев бизнеса, CXO, политиков и инвесторов. Эти идеи также помогут их клиентам преодолеть свои страхи.
3. Практические результаты
Выводы, представленные в этом исследовании TMR, являются незаменимым руководством для выполнения всех бизнес-приоритетов, в том числе критически важных.Результаты при внедрении показали ощутимые преимущества для заинтересованных сторон и предприятий отрасли в повышении их производительности. Результаты адаптируются к индивидуальной стратегической структуре. Исследование также иллюстрирует некоторые из недавних тематических исследований по решению различных проблем компаниями, с которыми они столкнулись на пути к консолидации.
4. Стратегические рамки
Исследование дает предприятиям и всем, кто интересуется рынком, возможность сформировать широкие стратегические рамки.Это стало более важным, чем когда-либо, учитывая нынешнюю неопределенность из-за COVID-19. В исследовании обсуждаются консультации по преодолению различных подобных прошлых сбоев и предвидятся новые, чтобы повысить готовность. Эти рамки помогают предприятиям планировать свои стратегические согласования для восстановления после таких разрушительных тенденций. Кроме того, аналитики TMR помогут вам разобраться в сложном сценарии и обеспечить отказоустойчивость в неопределенные времена.
Отчет проливает свет на различные аспекты и дает ответы на актуальные вопросы рынка.Вот некоторые из важных:
1. Какие варианты инвестиций могут быть наилучшими при освоении новых продуктов и услуг?
2. К каким ценностным предложениям следует стремиться предприятиям при финансировании новых исследований и разработок?
3. Какие нормативные акты будут наиболее полезны для заинтересованных сторон в расширении их сети цепочки поставок?
4. В каких регионах в ближайшем будущем может наблюдаться рост спроса в определенных сегментах?
5.Какие из лучших стратегий оптимизации затрат с поставщиками, с которыми некоторые хорошо зарекомендовавшие себя игроки добились успеха?
6. Какие ключевые перспективы использует топ-менеджер, чтобы вывести бизнес на новую траекторию роста?
7. Какие правительственные постановления могут поставить под сомнение статус ключевых региональных рынков?
8. Как новые политические и экономические сценарии повлияют на возможности в ключевых областях роста?
9.Каковы некоторые из возможностей получения прибыли в различных сегментах?
10. Что будет препятствием для входа на рынок новых игроков?
Обладая обширным опытом в создании исключительных рыночных отчетов, Transparency Market Research стала одной из надежных компаний по исследованию рынка среди большого числа заинтересованных сторон и CXO.Каждый отчет Transparency Market Research подвергается тщательной исследовательской деятельности во всех аспектах. Исследователи из TMR внимательно следят за рынком и извлекают полезные точки, способствующие росту. Эти моменты помогают заинтересованным сторонам соответствующим образом разрабатывать свои бизнес-планы.
исследователей TMR проводят исчерпывающие качественные и количественные исследования. Это исследование предполагает использование мнений экспертов рынка, сосредоточение внимания на последних разработках и других.Этот метод исследования отличает TMR от других фирм, занимающихся исследованиями рынка.
Вот как Transparency Market Research помогает заинтересованным сторонам и CXO с помощью отчетов:
Внедрение и оценка стратегического сотрудничества: Исследователи TMR анализируют недавние стратегические действия, такие как слияния, поглощения, партнерства, сотрудничество и совместные предприятия. Вся информация собрана и включена в отчет.
Идеальные оценки размера рынка: В отчете анализируются демографические характеристики, потенциал роста и возможности рынка в течение прогнозируемого периода. Этот фактор приводит к оценке размера рынка, а также дает представление о том, как рынок восстановит рост в течение периода оценки.
Инвестиционное исследование: В отчете основное внимание уделяется текущим и предстоящим инвестиционным возможностям на конкретном рынке.Эти события информируют заинтересованные стороны о текущем инвестиционном сценарии на рынке.
Примечание: Несмотря на то, что были приняты меры для поддержания наивысшего уровня точности отчетов TMR, недавним изменениям, связанным с рынком / поставщиком, может потребоваться время, чтобы отразить их в анализе.
Ниацин — чемпион «Холестериновых войн» может также повысить уровень гормона роста
Автор Ward Dean, MD
Исследование, проведенное в архиве Archives of Internal Medicine (Guyton, et al, 2000), подтверждает мою давнюю веру в превосходство ниацина (витамина B3) как гиполипидемического средства.Запатентованную версию ниацина с ограниченным высвобождением (Ниаспан) сравнивали с фармацевтическим препаратом гемфиброзил (Лопид). В исследовании приняли участие 399 мужчин и женщин в возрасте от 21 до 75 лет, у всех был низкий уровень ЛПВП (липопротеинов высокой плотности — «хороший холестерин») менее 40 мг / л.
Другими критериями включения в это исследование были уровень триглицеридов менее 400 мг / л и ЛПНП (липопротеины низкой плотности — «плохой холестерин») менее 260 мг / л. Ниацин вводили один раз в день перед сном.Дозировка ниацина начиналась с 375 мг / день, затем постепенно увеличивалась в ходе исследования и поддерживалась на уровне 2000 мг каждую ночь в течение 8 недель. Продолжительность исследования составила 16 недель. Субъекты принимали аспирин по мере необходимости, чтобы предотвратить покраснение. Гемфиброзил 600 мг вводили два раза в день в течение всех 16 недель.
Ниацин повысил уровень ЛПВП более чем на 25% по сравнению с увеличением на 13,3% за счет гемфиброзила. Гемфиброзил на самом деле повысил уровень ЛПНП («плохой» холестерин, помните?), В то время как ниацин немного снизил эту фракцию.Гемфиброзил снижает уровень триглицеридов на 40% по сравнению с 30% снижением от ниацина. Таким образом, ниацин привел к общему улучшению липидного профиля, которое превышало индуцированное гемфиброзилом (рис. 1).
Однако ниацин благоприятно изменил и несколько других факторов риска сердечно-сосудистых заболеваний. Уровни аполипопротеина (а) были значительно (20%) снижены ниацином, но не изменялись гемфиброзилом. Оба вещества снижали уровень аполипопротеина (b) в сыворотке на одинаковую величину.Фибриноген, третий фактор риска, снижался при приеме ниацина, но повышался на 6–9% при приеме гемфиброзила. Авторы пришли к выводу: «Ниаспан, 2 000 мг, оказывал значительно лучший эффект на уровень фибриногена, чем гемфиброзил».
Эти результаты подтверждают многие предыдущие исследования использования ниацина в качестве нутриента, снижающего уровень липидов. Например, в проекте Coronary Drug Project, в который были включены мужчины, перенесшие инфаркт миокарда, употребление ниацина привело к сокращению числа повторных сердечных приступов без смертельного исхода на 26% за шестилетний период и к снижению общей смертности на 11% через 15 лет. лет наблюдения (Canner, et al, 1986) (рис.2).
Ниацин стимулирует гормон роста Превознося преимущества ниацина, один часто упускаемый из виду «побочный эффект» заключается в том, что ниацин является мощным высвобождающим гормоном роста гормона (Quabbe, et al, 1983) (рис. 3). Куаббе и его коллеги вводили людям 500 мг ниацина внутривенно и отметили резкое повышение уровня гормона роста. На втором этапе исследования они одновременно вводили вливание жирных кислот. Обратите внимание, что жир полностью подавлял рост гормона роста.Практический урок этого исследования заключается в том, что любой, кто использует ниацин в качестве стимулятора гормона роста, должен принимать его натощак (глюкоза и инсулин также подавляют гормон роста, а также жирные кислоты).
Побочные эффекты и противопоказания к применению высоких доз ниацина Ниацин в высоких дозах очень безопасен. Его наиболее частый «побочный эффект» — безобидное покраснение кожи, сопровождающееся зудом. Этот эффект обычно проходит через несколько дней или недель использования.Прием аспирина за 30 минут до приема ниацина также помогает уменьшить этот эффект. Другой способ минимизировать покраснение — начать с низких доз (50–100 мг) и постепенно увеличивать дозу по мере переносимости. Наконец, также можно использовать гексаникотинат инозита (IHN) — еще одну не смывающую форму ниацина. IHN, хотя и немного дороже, чем ниацин, эффективен в несколько меньших дозах, тем самым оставаясь рентабельным. Другой побочный эффект — это возможность повышения активности печеночных ферментов или токсичности для печени.Токсичность для печени встречается редко и чаще всего возникает при применении препаратов с замедленным высвобождением.
Любому, кто собирается начать терапию ниацином в высоких дозах, вероятно, следует проверить печеночные ферменты в течение нескольких месяцев после достижения терапевтических уровней (1500–3000 мг). Единственное абсолютное противопоказание к терапии ниацином — инсулинозависимый диабет. Ниацин усугубляет проблемы с сахаром в крови у инсулинозависимых диабетиков, еще больше усугубляя их липидные проблемы, обычно вызывая резкое повышение уровня триглицеридов.В качестве альтернативы я рекомендую ниацинамид (также содержащийся в Optimum D) в дозах до трех граммов в день для инсулинозависимых диабетиков. Хотя ниацинамид обычно не влияет на уровень липидов у людей, не страдающих диабетом, из-за его эффекта стабилизации глюкозы у диабетиков он имеет тенденцию нормализовать уровень липидов в крови, особенно триглицеридов.
Заключение Ниацин снова становится недорогим и высокоэффективным средством для снижения уровня холестерина, повышения уровня ЛПВП и снижения уровня ЛПНП и триглицеридов.Кроме того, он обладает дополнительными преимуществами в виде снижения уровня аполипопротеинов А и В, фибриногена и повышения уровня гормона роста. Мунтони (1974) заявил, что «липостатические» вещества являются предпочтительными агентами для замедления старения, и ниацин вполне может быть лучшим веществом в этом классе (Dilman and Dean, 1992).
Список литературы
Каннер П.Л., Берге К.Г., Венгер Н.К. и др. Пятнадцатилетняя смертность пациентов проекта Coronary Drug Project: долгосрочная польза от приема ниацина. Дж. Ам Колл Кардиол, 1986, 8: 1245-1255.
Дилман В. и Дин В. Нейроэндокринная теория старения и дегенеративных заболеваний, 1992, Центр био-геронтологии, Пенсакола.
Гайтон, Джон Р., Блейзинг, Майкл А., Хагар, Джеймс и др. Ниацин с пролонгированным высвобождением по сравнению с гемфиброзилом для лечения низкого уровня холестерина липопротеинов высокой плотности. Arch Intern Med, 2000, 160: 1177-1184.
Горовиц, Н. Связь ниацина с долголетием после инфаркта миокарда. Medical Tribune, 1985, 26: 12, стр. 1, 17.
Мунтони, С.Ингибирование окисления жирных кислот бигуанидами: значение для метаболической физиопатологии. Adv Lipid Res, 1974, 12: 311-377.
Quabbe, H.J., Ramek, W., and Luyckx, A.S. Концентрация гормона роста, кортизола и глюкагона во время депрессии свободных жирных кислот в плазме. Различные эффекты никотиновой кислоты и производного аденозина. J. Clin Endocr Metab, 1983, 57: 410-414.
Отчет об анализе рынка никотиновой кислоты (витамина B3) за 2021 год: текущие тенденции в отрасли, статистика, доля и размер, ожидаемый среднегодовой темп роста, данные ведущих игроков и анализ будущего развития и перспектив до 2027 года
Отдел новостей MarketWatch не участвовал в создании этого контента.
16 апреля 2021 г. (Expresswire) — «В окончательный отчет будет добавлен анализ воздействия COVID-19 на эту отрасль».
Исследовательский отчет « Рынок никотиновой кислоты (витамин B3) » был составлен таким образом, чтобы охватить ключевую динамику рынка в этой отрасли, охватывая исторические, текущие и прогнозируемые данные, текущие рыночные тенденции и будущие рыночные возможности. . В отчете освещаются недавние разработки, в том числе грядущие технологии, партнерства, сделки, слияния и поглощения, которые помогут читателям лучше понять отрасль, тем самым помогая им сформулировать стратегические инвестиционные планы.Отчет также охватывает денежно-кредитные и валютные колебания, импортно-экспортную торговлю и состояние мирового рынка в простой манере.
Получить образец отчета в формате PDF — https://www.industryresearch.biz/enquiry/request-sample/17807131
Объем обзора рынка никотиновой кислоты (витамина B3):
Анализ рынка и аналитические данные : Мировой рынок никотиновой кислоты (витамина B3)
Ожидается, что мировой рынок никотиновой кислоты (витамина B3) будет расти значительными темпами в течение прогнозируемого периода с 2022 по 2027 год.В 2021 году рынок будет расти стабильными темпами, и с ростом числа стратегий, используемых ключевыми игроками, ожидается, что рынок вырастет в течение прогнозируемого периода.
В отчете об исследовании изучается рыночная доля никотиновой кислоты (витамина B3) с использованием различных методологий и анализов, чтобы предоставить точную и всестороннюю информацию о рынке. Для более четкого понимания он разделен на несколько частей, охватывающих различные аспекты рынка. Этот отчет направлен на то, чтобы направить людей к более глубокому и ясному знанию рынка.В отчете указаны различные ключевые производители на рынке. Это помогает читателю понять стратегии и взаимодействия, которые игроки сосредотачивают на борьбе с конкуренцией на рынке.
Основными участниками рынка никотиновой кислоты (витамина B3) являются:
● Aarti Drugs
● Brother Enterprises Holding
● DSM
● Jubilant Life Science
● Lanbo Biotechnology
● Lasons
● Lonza
● Nantong Уксусная кислота, химикат
● Red Sun Group
● Resonance Specialities
● Tianjin Zhongrui Pharmaceutical
● Vanetta
● Vertellus
Чтобы понять, как влияние Covid-19 освещается в этом отчете — https: // www.industryresearch.biz/enquiry/request-covid19/17807131
Мировой рынок никотиновой кислоты (витамина B3): движущие силы и сдерживающие факторы
В исследовательский отчет включен анализ различных факторов, способствующих росту рынка. Он представляет собой тенденции, ограничения и движущие силы, которые трансформируют рынок в положительную или отрицательную сторону. В этом разделе также представлены различные сегменты и приложения, которые потенциально могут повлиять на рынок в будущем.Подробная информация основана на текущих тенденциях и исторических событиях. В этом разделе также представлен анализ объема производства на мировом рынке и по каждому типу за период с 2016 по 2027 год.
Тщательная оценка ограничений, включенных в отчет, показывает контраст с движущими силами и дает возможность для стратегического планирования. Факторы, которые омрачают рост рынка никотиновой кислоты (витамина B3), имеют решающее значение, поскольку их можно понять как создание различных способов использования прибыльных возможностей, которые присутствуют на постоянно растущем рынке.Кроме того, были проанализированы мнения экспертов рынка, чтобы лучше понять рынок.
Запросите этот отчет перед покупкой — https://www.industryresearch.biz/enquiry/pre-order-enquiry/17807131
В этом отчете на основе типа продукта отображается производство, выручка, цена , рыночная доля и темпы роста каждого типа, в основном разделенные на:
● Ниацин снижает уровень холестерина
● Прочие
На основе конечных пользователей / приложений в этом отчете основное внимание уделяется состоянию и перспективам основных приложения / конечные пользователи, потребление (продажи), доля рынка и темпы роста для каждого приложения, в том числе:
● Кормовые добавки
● Продукты питания и напитки
● Фармацевтика
● Промышленное производство
● Daily Chemicals
Никотиновая кислота (Витамин B3) Рыночная конкурентная среда предоставляет подробную информацию и данные по игрокам.Отчет предлагает всесторонний анализ и точную статистику доходов игрока за период 2016-2021 гг. Он также предлагает подробный анализ, подкрепленный надежной статистикой по выручке (на глобальном и региональном уровне) игроков за период 2016-2021 гг. Подробная информация включает описание компании, основной бизнес, общий доход и продажи компании, выручку от никотиновой кислоты (витамина B3), дату выхода на рынок никотиновой кислоты (витамин B3), выпуск продукта на основе никотиновой кислоты (витамина B3), последние разработки и др.
Получите образец отчета о рынке никотиновой кислоты (витамина B3) за 2021-2027 годы
Некоторые из ключевых вопросов, на которые даны ответы в этом отчете:
● Что является глобальным ( Северная Америка, Европа, Азиатско-Тихоокеанский регион, Южная Америка, Ближний Восток и Африка ) стоимость продаж, стоимость производства, стоимость потребления, импорт и экспорт никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Кто являются основными мировыми производителями никотиновой кислоты (витамина B3)? Какова их операционная ситуация (мощность, производство, продажи, цена, себестоимость, валовая прибыль и выручка)? ● С какими возможностями и угрозами на рынке никотиновой кислоты (витамина B3) сталкиваются поставщики в мировой индустрии никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Какое приложение / конечный пользователь или тип продукта могут иметь перспективы для постепенного роста? Какова рыночная доля каждого типа и приложения? ● Какой целенаправленный подход и какие ограничения сдерживают рынок никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Каковы различные каналы продаж, маркетинга и распространения в мировой индустрии? ● Каковы исходные материалы и оборудование для производства никотиновой кислоты (витамина B3), а также процесс производства никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Какие основные рыночные тенденции влияют на рост рынка никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Экономическое влияние на индустрию никотиновой кислоты (витамина B3) и тенденции развития индустрии никотиновой кислоты (витамина B3).● Каковы рыночные возможности, рыночный риск и обзор рынка никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Каковы основные движущие силы, ограничения, возможности и проблемы на рынке никотиновой кислоты (витамина B3) и как они, как ожидается, повлияют на рынок? ● Каков размер рынка никотиновой кислоты (витамина B3) на региональном и национальном уровне? Приобрести этот отчет (цена 4000 долларов США за однопользовательскую лицензию) — https://www.industryresearch.biz/purchase/17807131
Годы, рассматриваемые для этого отчета:
Исторические годы: 2016- 2020
Базовый год: 2020
Расчетный год: 2021
Период прогноза рынка никотиновой кислоты (витамина B3): 2021-2027
Таблицы и цифры помогают анализировать глобальную никотиновую кислоту (витамин B3) рыночных тенденций, это исследование предоставляет ключевую статистику о состоянии отрасли и является ценным источником рекомендаций и указаний для компаний и частных лиц, заинтересованных в рынке.
Некоторые моменты из TOC:
1 Обзор рынка никотиновой кислоты (витамина B3)
1.1 Никотиновая кислота (витамин B3) Объем продукта
1.2 Никотиновая кислота (витамин B3) Сегмент по типу
1.2.1 Глобальная никотиновая кислота (Витамин B3) Продажи по типу (2016, 2021 и 2027)
1.2.2 Тип 1
1.2.3 Тип 2
1.3 Никотиновая кислота (витамин B3) Сегмент по применению
1.3.1 Глобальное сравнение продаж никотиновой кислоты (витамина B3) по заявкам (2016 и 2021 и 2027 годы)
1.3.2 Приложение 1
1.3.3 Приложение 2
1.4 Оценки и прогнозы рынка никотиновой кислоты (витамина B3) (2016-2027)
1.4.1 Мировой размер рынка никотиновой кислоты (витамина B3) в темпах роста стоимости (2016-2027)
1.4 .2 Объем мирового рынка никотиновой кислоты (витамина B3) в объемном темпе роста (2016-2027)
1.4.3 Глобальные тенденции цен на никотиновую кислоту (витамин B3) (2016-2027)
2 Оценка никотиновой кислоты (витамина B3) и Прогнозы по регионам
2.1 Объем мирового рынка никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам: 2016 VS 2021 VS 2027
2.2 Ретроспективный сценарий глобального рынка никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам (2016-2021)
2.2.1 Доля мирового рынка никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам (2016-2021)
2.2.2 Глобальная никотиновая кислота (витамин B3) Доля рынка выручки по регионам (2016-2021)
2.3 Оценки и прогнозы мирового рынка никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам (2022-2027)
2.3.1 Оценки и прогнозы мировых продаж никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам (2022- 2027)
2.3.2 Глобальный прогноз доходов от никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам (2022-2027)
2.4 Географический анализ рынка: факты и цифры рынка
2.4.1 Оценка и прогнозы по никотиновой кислоте (витамин B3) в Северной Америке (2016-2027)
2.4.2 Оценка и прогнозы по никотиновой кислоте (витамин B3) в Европе (2016-2027)
2,4 .3 Оценки и прогнозы по никотиновой кислоте (витамин B3), Китай (2016-2027 гг.)
2.4.4 Оценка и прогнозы по никотиновой кислоте (витамин B3), Япония (2016-2027 гг.)
2.4.5 Оценка содержания никотиновой кислоты (витамин B3) в Юго-Восточной Азии и Прогнозы (2016-2027)
2.4.6 Оценка и прогнозы никотиновой кислоты (витамина B3) в Индии (2016-2027)
3 Глобальная конкуренция по никотиновой кислоте (витамин B3) по игрокам
3.1 Мировые лидеры продаж никотиновой кислоты (витамина B3) по продажам (2016-2021)
3.2 Крупнейшие мировые игроки рынка никотиновой кислоты (витамина B3) по выручке (2016-2021 гг.) Кислота (витамин B3) по состоянию на 2020 год)
3.4 Глобальная средняя цена никотиновой кислоты (витамина B3) по компаниям (2016-2021)
3.5 Производственные площадки производителей никотиновой кислоты (витамина B3), обслуживаемая территория, тип продукта
3.6 Слияния и поглощения производителей, планы расширения
4 Глобальная никотиновая кислота (Витамин B3) Размер рынка по типу
5 Мировой размер рынка никотиновой кислоты (витамин B3) по приложениям
6 Факты и цифры рынка никотиновой кислоты (витамина B3) в Северной Америке
7 Факты и цифры рынка никотиновой кислоты (витамина B3) в Европе
8 Цифры и факты о рынке никотиновой кислоты (витамина B3) в Китае
…………………………………………
12 Профили компаний и ключевые показатели в бизнесе никотиновой кислоты (витамина B3)
12.1 Профиль компании 1
12.1.1 Профиль компании 1 Информация о корпорации
12.1.2 Профиль компании 1 Обзор бизнеса
12.1.3 Профиль компании 1 Никотиновая кислота (витамин B3) Продажи, выручка и валовая прибыль (2016-2021)
12.1. 4 Профиль компании 1 Предлагаемые продукты с никотиновой кислотой (витамином B3)
12.1.5 Профили компании 1 Последние разработки
12.2 Профили компании 2
12.2.1 Профили компании 2 Информация о корпорации
12.2.2 Профили компании 2 Обзор бизнеса
12.2.3 Профили компании 2 Продажи, выручка и валовая прибыль от никотиновой кислоты (витамина B3) (2016-2021)
12.2.4 Профили компании 2 Предлагаемые продукты с никотиновой кислотой (витамином B3)
12.2.5 Профили компании 2 Последние разработки
12.3 Компания Профили 3
12.3.1 Профили компании 3 Информация о корпорации
12.3.2 Профили компании 3 Обзор бизнеса
12.3.3 Профили компании 3 Продажи, выручка и валовая прибыль никотиновой кислоты (витамина B3) (2016-2021)
12.3.4 Компания Профили 3 Предлагаемые продукты с никотиновой кислотой (витамином B3)
12.3.5 Профиль компании 3 Последние разработки
………………………… ..
13 Анализ производственных затрат на никотиновую кислоту (витамин B3)
14 Каналы сбыта, дистрибьюторы и клиенты
15 Динамика рынка
16 Результаты исследований и выводы
Продолжить ………………
Подробная информация о ТОС глобального рынка никотиновой кислоты (витамина B3) @ https://www.industryresearch.biz/TOC/17807131
О нас:
Рынок быстро меняется с продолжающимся расширением отрасли.Развитие технологий предоставило сегодняшним предприятиям многогранные преимущества, приводящие к ежедневным экономическим сдвигам. Таким образом, для компании очень важно понимать закономерности рыночных движений, чтобы лучше разрабатывать стратегию. Эффективная стратегия предлагает компаниям преимущество в планировании и преимущество перед конкурентами. Отраслевые исследования — это надежный источник отчетов о состоянии рынка, которые помогут вам понять, в чем нуждается ваш бизнес.
Контактная информация:
Имя : Mr.Ajay More
Эл. Почта : [email protected]
Организация : Industry Research Biz
Телефон: США +1424 253 0807 / UK +44 203239 8187
Наши другие отчеты:
Объем мирового рынка оборудования для испытаний резины, доля в 2021 году: исследования с использованием бизнес-анализа, растущий среднегодовой темп роста, развитие, тенденции, стратегия роста, отраслевые тенденции и прогноз до 2024 года
Закрытие рынка электромобилей и ДВС и прогноз доли на 2021-2027 годы Участники, рост, тенденции и методология исследования, а также анализ региональной сегментации с влиянием Covid-19
Обзор мирового рынка упаковщиков для меда 2021: ведущие производители в отрасли, размер, доля, тенденции в технологиях, планы развития, бизнес-статистика, региональный анализ и прогноз роста до 2025 года
Последний отчет об исследовании мирового рынка умягчителей воды, подготовленный ведущими игроками на 2021 год — статус разработки, среднегодовой темп роста 4.8%, Новые технологии, влияние Covid-19, факторы экономического роста, прогноз до 2027 г.
Размер рынка поручней для унитазов на 2021 г .: бизнес-анализ по ведущим производителям, новейшие технологии, состояние спроса, оценка доли, обзор регионального роста и прогноз до 2025 г.
Пресс-релиз, распространенный Express Wire
Чтобы просмотреть исходную версию Express Wire, посетите Отчет об анализе рынка никотиновой кислоты (витамина B3) за 2021 год: текущие тенденции в отрасли, статистика, доля и размер, ожидаемый среднегодовой темп роста, данные и анализ ведущих игроков перспектив развития и перспектив до 2027 г.
COMTEX_384545978 / 2598 / 2021-04-16T06: 34: 52
Есть ли проблемы с этим пресс-релизом? Свяжитесь с поставщиком исходного кода Comtex по адресу editorial @ comtex.com. Вы также можете связаться со службой поддержки клиентов MarketWatch через наш Центр поддержки клиентов.
Штаммы дрожжей перечислены в таблице 1. Дрожжевые клетки обычно выращивали при 28 ° C в полной среде, содержащей 1% бакто-дрожжевой экстракт (Difco), 1% бакто-пептон (Difco) и 2% глюкозу. При необходимости добавляли 200 мкг мл -1 антибиотика G418. Для споруляции диплоидный штамм K. lactis выращивали на чашке ME (5% бакто-солодовый экстракт и 2% бакто-агар, Difco).Синтетическая минимальная среда была приготовлена, как описано (Sherman, 1991), и никотиновая кислота была удалена, как указано.
Штаммы дрожжей | Генотип | Источник |
S. cerevisiae | ||
S288C | Prototroph | K. |
CK11 | MAT a / MAT α uraA1 / uraA1, adeT-600 / +, + / lysA1 | X.Дж. Чен, Юго-западный медицинский центр штата Юта, США |
CK11 / Δklnpt1 | CK11 klnpt1 :: KanMX / KlNPT1 | Эта работа |
CBS2359 | CBS2359 Proutha C. glabrata||
CBS138 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie |
D. hansenii | ||
CBS767 | CBS767 | H.Фукухара, Institut Curie |
C. albicans | ||
CBS562 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie |
H. Fukuhara, Institut Curie | ||
Schiz. pombe | ||
CBS356 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie |
Штаммы дрожжей | Генотип | Источник | cerevisiae|
S288C | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie | |
K. lactis | |||
CK11 | 14MATra MATra 600 / +, + / lysA1 | XJ Чен, Юго-западный медицинский центр | |
CK11 / Δklnpt1 | CK11 klnpt1 :: KanMX / KlNPT1 | Эта работа | |
CBS2359 | PrototФукухара, Институт Кюри | ||
C. glabrata | |||
CBS138 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie | |
Prototroph D. Фукухара, Institut Curie | |||
C. albicans | |||
CBS562 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie | |
Y.lipolytica | |||
CLIB89 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie | |
Schiz. pombe | |||
CBS356 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie |
Дрожжевые штаммы | Генотип | cerevisia Источник S. | Прототроф | Х.Фукухара, Институт Кюри | ||
K. lactis | ||||||
CK11 | MAT a / MAT α uraA1 / uraA1, adeT-600 / +, + / lysA1 X.J | . Чен, Юго-западный медицинский центр|||||
CK11 / Δklnpt1 | CK11 klnpt1 :: KanMX / KlNPT1 | Эта работа | ||||
CBS2359 | CBS2359 | Prototha .glabrata | ||||
CBS138 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie | ||||
D. hansenii | ||||||
CBS767 | CBS767 | Protothara 9028 Fukuhara 9028 albicans | ||||
CBS562 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie | ||||
Y. lipolytica | ||||||
CLIB89 | Prototroph | H.Fukuhara, Institut Curie | ||||
Schiz. pombe | ||||||
CBS356 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie |
Дрожжевые штаммы | Генотип | cerevisia Источник S. | Прототроф | Х. Фукухара, Институт Кюри | ||
К.lactis | ||||||
CK11 | MAT a / MAT α uraA1 / uraA1, adeT-600 / +, + / lysA1 | X.J. Чен, Юго-западный медицинский центр | ||||
CK11 / Δklnpt1 | CK11 klnpt1 :: KanMX / KlNPT1 | Эта работа | ||||
CBS2359 | CBS2359 | Prototha .glabrata | ||||
CBS138 | Prototroph | H.Фукухара, Institut Curie | ||||
D. hansenii | ||||||
CBS767 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie | 9028 C. albicans Fukuhara, Institut Curie | |||
Y. lipolytica | ||||||
CLIB89 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie | ||||
Schiz.pombe | ||||||
CBS356 | Prototroph | H. Fukuhara, Institut Curie |
8″ data-legacy-id=»ss4″> Сравнительный анализ генома и реконструкция путей биосинтеза НАД у дрожжей Веб-сайты баз данных о видах дрожжей, использованных в этом исследовании, перечислены в конце таблицы 2.поиск взрыва проводился с использованием реализованных в нем инструментов.
2 Сравнение путей биосинтеза НАД у дрожжей
S. cerevisiae 1 C. glabrata 2 K. lactis 2 2 2 C. albicans 3 Y. lipolytica 2 Schiz.Pombe 4 Другие ссылочные последовательности 5 de novo Биосинтез NAD —Кинурениновый путь BNA-TrypRW2 — — DEHA0G12947g (364 / e-101) orf19.583 (919 / 9.9e-94) YALI0F26455g (304 / 6e-83) — NA YJL060W: Арилформамидаза CAGL0J05126g (645/0.0) KLLA0F01617g (633 / 0.0) DEHA0A04840g (471 / e-133) orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) YALI0E28787g (474 / e-134) Bc /1.6e-110) BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа — — DEHA0C06743g (365 / e-101) — orf19 / 5 107) YALI0D09867g (358 / 5e-99) — BNA5 / YLR231C: кинурениназа — — .394 (1248 / 1.4e-128) YALI0B22902g (416 / e-116) — BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 — DE -90HA / 4e-63) orf19.3515 (616 / 1.3e-61) YALI0B02852g (243 / 4e-65) — BNA6 / YFR047Cibosylate трансфосфораза — хинолинат — DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) YALI0E07073g (419 / e-118) — — Путь аспартата — * — — * — — * — * — * — * — * — * NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) — — — — — NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) Спасение биосинтеза НАД 7, биосинтез НАД 7 — сульфатиновая кислота 7 PNC1 / YGL037C: никотинамидаза CAGL0A01716g (279 / 7e-76) KLLA0F22242g (219 / 1e-57) DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) YALI0A21153g (153 / 6e-38) SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) KLLA0D06655g (624 / e-179) DEHA0G25201g (493 / e-140) NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) 432800 / YALG ) SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, YALI0E25652g (455 / e-128, SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) 503 / e-143) 479 / e-136) 1221 / 2.3e-129) 472 / e-133) 1045 / 1.8e-107) QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза CAGL0J10758g (1255/0.0) KLLA0D13024g (1214 / 0,0) DEHA0A01969g (1004 / 0,0) orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) YALI0A20108g (1042 / 0,0) 2276- SPCC55 / 6.02 238) — Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) — — — — — — никотинамидфосфорибозилтрансфераза) Транспорт никотиновой кислоты TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) DEHA0E10494g (257 / 4e-69) TNA1-64 / orf19.4 ) YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58)
S. cerevisiae 1 C. glabrata 2 K. lactis 2 D. hansenii 2 C. Y. lipolytica 2 Schiz.Pombe 4 Другие ссылочные последовательности 5 de novo Биосинтез NAD —Кинурениновый путь BNA-TrypRW2 — — DEHA0G12947g (364 / e-101) orf19.583 (919 / 9.9e-94) YALI0F26455g (304 / 6e-83) — NA YJL060W: Арилформамидаза CAGL0J05126g (645/0.0) KLLA0F01617g (633 / 0.0) DEHA0A04840g (471 / e-133) orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) YALI0E28787g (474 / e-134) Bc /1.6e-110) BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа — — DEHA0C06743g (365 / e-101) — orf19 / 5 107) YALI0D09867g (358 / 5e-99) — BNA5 / YLR231C: кинурениназа — — .394 (1248 / 1.4e-128) YALI0B22902g (416 / e-116) — BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 — DE -90HA / 4e-63) orf19.3515 (616 / 1.3e-61) YALI0B02852g (243 / 4e-65) — BNA6 / YFR047Cibosylate трансфосфораза — хинолинат — DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) YALI0E07073g (419 / e-118) — — Путь аспартата — * — — * — — * — * — * — * — * — * NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) — — — — — NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) Спасение биосинтеза НАД 7, биосинтез НАД 7 — сульфатиновая кислота 7 PNC1 / YGL037C: никотинамидаза CAGL0A01716g (279 / 7e-76) KLLA0F22242g (219 / 1e-57) DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) YALI0A21153g (153 / 6e-38) SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) KLLA0D06655g (624 / e-179) DEHA0G25201g (493 / e-140) NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) 432800 / YALG ) SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, YALI0E25652g (455 / e-128, SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) 503 / e-143) 479 / e-136) 1221 / 2.3e-129) 472 / e-133) 1045 / 1.8e-107) QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза CAGL0J10758g (1255/0.0) KLLA0D13024g (1214 / 0,0) DEHA0A01969g (1004 / 0,0) orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) YALI0A20108g (1042 / 0,0) 2276- SPCC55 / 6.02 238) — Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) — — — — — — никотинамидфосфорибозилтрансфераза) Транспорт никотиновой кислоты TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) DEHA0E10494g (257 / 4e-69) TNA1-64 / orf19.4 ) YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58)
2 Сравнение путей биосинтеза НАД у дрожжей
S. cerevisiae 1 C. glabrata 2 K. lactis 2 hansenii C. albicans 3 Y.lipolytica 2 Schiz. Pombe 4 Другие ссылочные последовательности 5 de novo Биосинтез NAD —Кинурениновый путь BNA-TrypRW2 — — DEHA0G12947g (364 / e-101) orf19.583 (919 / 9.9e-94) YALI0F26455g (304 / 6e-83) — NA YJL060W: Арилформамидаза CAGL0J05126g (645/0.0) KLLA0F01617g (633 / 0.0) DEHA0A04840g (471 / e-133) orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) YALI0E28787g (474 / e-134) Bc /1.6e-110) BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа — — DEHA0C06743g (365 / e-101) — orf19 / 5 107) YALI0D09867g (358 / 5e-99) — BNA5 / YLR231C: кинурениназа — — .394 (1248 / 1.4e-128) YALI0B22902g (416 / e-116) — BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 — DE -90HA / 4e-63) orf19.3515 (616 / 1.3e-61) YALI0B02852g (243 / 4e-65) — BNA6 / YFR047Cibosylate трансфосфораза — хинолинат — DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) YALI0E07073g (419 / e-118) — — Путь аспартата — * — — * — — * — * — * — * — * — * NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) — — — — — NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) Спасение биосинтеза НАД 7, биосинтез НАД 7 — сульфатиновая кислота 7 PNC1 / YGL037C: никотинамидаза CAGL0A01716g (279 / 7e-76) KLLA0F22242g (219 / 1e-57) DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) YALI0A21153g (153 / 6e-38) SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) KLLA0D06655g (624 / e-179) DEHA0G25201g (493 / e-140) NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) 432800 / YALG ) SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, YALI0E25652g (455 / e-128, SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) 503 / e-143) 479 / e-136) 1221 / 2.3e-129) 472 / e-133) 1045 / 1.8e-107) QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза CAGL0J10758g (1255/0.0) KLLA0D13024g (1214 / 0,0) DEHA0A01969g (1004 / 0,0) orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) YALI0A20108g (1042 / 0,0) 2276- SPCC55 / 6.02 238) — Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) — — — — — — никотинамидфосфорибозилтрансфераза) Транспорт никотиновой кислоты TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) DEHA0E10494g (257 / 4e-69) TNA1-64 / orf19.4 ) YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58)
S. cerevisiae 1 C. glabrata 2 K. lactis 2 D. hansenii 2 C. Y. lipolytica 2 Schiz.Pombe 4 Другие ссылочные последовательности 5 de novo Биосинтез NAD —Кинурениновый путь BNA-TrypRW2 — — DEHA0G12947g (364 / e-101) orf19.583 (919 / 9.9e-94) YALI0F26455g (304 / 6e-83) — NA YJL060W: Арилформамидаза CAGL0J05126g (645/0.0) KLLA0F01617g (633 / 0.0) DEHA0A04840g (471 / e-133) orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) YALI0E28787g (474 / e-134) Bc /1.6e-110) BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа — — DEHA0C06743g (365 / e-101) — orf19 / 5 107) YALI0D09867g (358 / 5e-99) — BNA5 / YLR231C: кинурениназа — — .394 (1248 / 1.4e-128) YALI0B22902g (416 / e-116) — BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 — DE -90HA / 4e-63) orf19.3515 (616 / 1.3e-61) YALI0B02852g (243 / 4e-65) — BNA6 / YFR047Cibosylate трансфосфораза — хинолинат — DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) YALI0E07073g (419 / e-118) — — Путь аспартата — * — — * — — * — * — * — * — * — * NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) — — — — — NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) Спасение биосинтеза НАД 7, биосинтез НАД 7 — сульфатиновая кислота 7 PNC1 / YGL037C: никотинамидаза CAGL0A01716g (279 / 7e-76) KLLA0F22242g (219 / 1e-57) DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) YALI0A21153g (153 / 6e-38) SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) KLLA0D06655g (624 / e-179) DEHA0G25201g (493 / e-140) NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) 432800 / YALG ) SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, YALI0E25652g (455 / e-128, SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) 503 / e-143) 479 / e-136) 1221 / 2.3e-129) 472 / e-133) 1045 / 1.8e-107) QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза CAGL0J10758g (1255/0.0) KLLA0D13024g (1214 / 0,0) DEHA0A01969g (1004 / 0,0) orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) YALI0A20108g (1042 / 0,0) 2276- SPCC55 / 6.02 238) — Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) — — — — — — никотинамидфосфорибозилтрансфераза) Транспорт никотиновой кислоты TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) DEHA0E10494g (257 / 4e-69) TNA1-64 / orf19.4 ) YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58)
Результаты
Гены, кодирующие ферменты в путях биосинтеза de novo НАД, отсутствуют в геномах K. lactis, C. glabrata и Schiz. Помбе . В дрожжах S. cerevisiae путь кинуренина является признанным путем для биосинтеза НАД de novo , а гены с BNA1 до BNA6 (которые кодируют все ферменты, катализирующие превращение триптофана в мононуклеотид никотиновой кислоты) были идентифицированы, за исключением BNA3 (Schott et al., 1971 г .; Ивамото и др. , 1995; Kucharczyk et al. , 1998; Panozzo et al. , 2002). Используя аминокислотные последовательности из S. cerevisiae , мы с помощью алгоритма blast провели поиск предполагаемых кодирующих последовательностей для ферментов кинуренинового пути в геномных последовательностях шести других видов дрожжей. Результаты представлены в Таблице 2. В D. hansenii, C. albicans и Y. lipolytica были обнаружены ортологи генов BNA1 – BNA6 , что позволяет предположить, что эти три дрожжа имеют кинурениновый путь, аналогичный что в S.cerevisiae . Однако в геномах C. glabrata, K. lactis или Schiz не было обнаружено генов, ортологичных BNA1, BNA2, BNA4, BNA5 и BNA6 . pombe , что указывает на то, что у этих дрожжей отсутствует весь кинурениновый путь. Возможно ли, что эти виды могли использовать путь аспартата для биосинтеза НАД, хотя до сих пор он был обнаружен только у прокариот и растений? Чтобы проверить эту возможность, в геномах был проведен поиск кодирующих последовательностей, соответствующих аминокислотным последовательностям E.coli l-аспартатоксидаза и хинолинатсинтаза. Но ни одного ортолога в геномах этих семи дрожжей обнаружить не удалось (таблица 2). Поиск был повторен с использованием аминокислотных последовательностей тех же ферментов из растения A. thaliana с тем же результатом (данные не показаны). Результаты показали, что C. glabrata, K. lactis и Schiz. pombe также не имеет пути аспартата, обнаруженного в бактериях и некоторых растениях. Это соответствует отсутствию ортолога BNA6 (в S.cerevisiae , этот ген кодирует хинолинатфосфорибозилтрансферазу, которая превращает хинолиновую кислоту в мононуклеотид никотиновой кислоты). Аспартатный и кинурениновый пути сходятся в хинолиновой кислоте. Чтобы дополнительно прояснить, есть ли какие-либо следы генов для синтеза NAD de novo у этих трех дрожжей, мы снова выполнили бластный поиск с использованием нуклеотидных последовательностей. Не было обнаружено значительных совпадений, за исключением BNA3 (данные не показаны). В заключение, биоинформатический анализ показал, что некоторые дрожжи, такие как C.glabrata, K. lactis и Schiz. pombe , вероятно, лишены каких-либо средств биосинтеза NAD de novo , поскольку отсутствуют как кинурениновый путь, так и путь аспартата.
Следует отметить два момента, касающихся отдельных генов кинуренинового пути. В то время как BNA1, BNA2, BNA4, BNA5 и BNA6 имеют ортологи в геномах D. hansenii, C. albicans и Y. lipolytica , все они отсутствуют в геномах K.lactis, C. glabrata и Schiz. Глазурь . BNA3 , однако, является исключением, поскольку он присутствует в каждом геноме, включая те, в которых явно отсутствуют гены кинуренинового пути (Таблица 2). Хотя предполагалось, что BNA3 кодирует арилформамидазу, катализирующую вторую стадию ( N -формил-1-кинуренин в l-кинуренин) пути кинуренина, его точная роль не установлена, в отличие от других пяти генов ( Panozzo et al., 2002). Наши сравнительные геномные данные предполагают, что этот ген может участвовать в другой функции. Во-вторых, две частично перекрывающиеся последовательности, показывающие значительное сходство с BNA6 , как на уровне белка, так и на уровне ДНК, были обнаружены в D. hansenii (Таблица 2). DEHA0F27995g может предсказать полипептид, похожий на N-концевую часть Bna6p и DEHA0F28006g на C-концевую часть. Эти две последовательности были аннотированы как псевдогены в базе данных генома, и их выведенные аминокислотные последовательности были исключены из реестра D.hansenii белков в базе. Присутствие этих двух открытых рамок считывания и тот факт, что D. hansenii может расти в отсутствие никотиновой кислоты (рис.2), строго подразумевает, что эти две последовательности могут действовать как гомолог BNA6 после вероятной ошибки сдвига рамки считывания. был исправлен.
Путь спасения NAD сохраняется во всех семи дрожжах
В дополнение к маршруту биосинтеза de novo , S. cerevisiae может использовать путь спасения (через Na и NaMN) для рециркуляции никотинамида, образующегося в различных реакциях с потреблением НАД.Используя этот путь, никотиновая кислота включается в синтез НАД под действием никотинатфосфорибозилтрансферазы, которая является высококонсервативной от прокариот до эукариот. Данные, представленные в таблице 2, показывают, что этот путь спасения также хорошо сохраняется среди видов дрожжей. В частности, гены никотинатфосфорибозилтрансферазы демонстрируют высокое сходство с NPT1 в S. cerevisiae (Panozzo et al. , 2002) на уровне аминокислотной последовательности. Сообщалось, что млекопитающие используют другой путь спасения (через NMN) для рециркуляции никотинамида посредством реакции, катализируемой никотинамидфосфорибозилтрансферазой (NAmPRTase) (Rongvaux et al., 2002, 2003). Однако наши биоинформатические исследования показали, что у дрожжей, исследованных в этой работе, нет гена, кодирующего предполагаемую NAmPRTase (Таблица 2).
De novo пути и путь спасения с использованием никотиновой кислоты сходятся в NaMN, поэтому они разделяют две стадии реакции от NaMN до NAD, катализируемые мононуклеотид аденилилтрансферазой никотиновой кислоты и глутамин-зависимой NAD синтетазой соответственно. Как показано в таблице 2, гены этих двух ферментов высоко консервативны у всех семи дрожжей.
KlNPT1 является важным геном в K. lactis Приведенные выше результаты показали, что K. lactis, C. glabrata и Schiz. pombe может не осуществлять de novo биосинтез NAD, в то время как они обладают путем спасения NAD (через Na и NaMN). Если это так, то спасательный путь был бы единственным путем, которым эти дрожжи генерируют НАД. Чтобы проверить эту точку зрения, мы удалили ген KlNPT1 , который, как предполагается, кодирует никотинатфосфорибозилтрансферазу, ключевой фермент, превращающий никотиновую кислоту в NaMN в пути спасения.Делецию KlNPT1 проводили в диплоидном штамме СК11 K. lactis . Полученный гетерозиготный диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 спорулировали, и 20 асков иссекали до полной глюкозной среды. Тетрадная диссекция показала образец сегрегации несущественного гена: 18 аски дали четыре жизнеспособные споры, а два аска дали три жизнеспособные споры [(a) на фиг. 3]. Этот результат был неожиданным. Однако мы заметили, что некоторые колонии были намного меньше, и что сегрегация спор в 18 аски представляла типичную менделевскую генетическую ситуацию: две нормальные колонии vs.две меньшие колонии. Все 40 меньших колоний были устойчивыми к антибиотику G418, в то время как 38 нормальных колоний были чувствительны [(b) на фиг. 3]. Клетки, устойчивые к G418, росли плохо, и рост, казалось, прекращался через 2 дня. Это наблюдение напомнило нам, что мутанты Δ klnpt1 могут выживать за счет некоторых метаболитов, таких как НАД, диффундированный их соседями KlNPT1 , даже если разрушение будет летальным. Известно, что клетки могут жить при очень низкой концентрации НАД. Чтобы проверить эту гипотезу, устойчивые к G418 колонии реплицировали второй раз на планшете, содержащем G418.Никакие клетки больше не могли расти [(c) на рис. 3]. В то же время был проведен эксперимент по кормлению со всеми этими G418-устойчивыми колониями, и результаты показали, что их выживаемость зависела от присутствия клеток KlNPT1 [(d) на фиг. 3]. Следовательно, мы заключаем, что разрушение KlNPT1 является летальным, показывая, что путь спасения является единственным средством биосинтеза NAD у K. lactis .
3
Анализ тетрадной диссекции K.lactis гетерозиготный диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 . Аски препарировали и выращивали на полной среде (а), а затем реплицировали на чашку, содержащую 200 мкг мл -1 антибиотика G418 (b). Вторую репликацию проводили с планшетом G418 (c). В то же время клетки каждой устойчивой к G418 колонии суспендировали в физиологическом растворе (0,15 М NaCl) и наносили на полную среду для эксперимента по кормлению, в котором диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 использовался в качестве держателя KlNPT1 . штамм (d).Все планшеты инкубировали при 28 ° C в течение 3-4 дней, а затем сфотографировали.
3
Анализ тетрадной диссекции гетерозиготного диплоида K. lactis Δ klnpt1 / KlNPT1 . Аски препарировали и выращивали на полной среде (а), а затем реплицировали на чашку, содержащую 200 мкг мл -1 антибиотика G418 (b). Вторую репликацию проводили с планшетом G418 (c). В то же время клетки из каждой устойчивой к G418 колонии суспендировали в физиологическом растворе (0.15 M NaCl) и наносили на полную среду для эксперимента по кормлению, в котором диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 использовали в качестве удерживающего штамма KlNPT1 (d). Все планшеты инкубировали при 28 ° C в течение 3-4 дней, а затем сфотографировали.
Обсуждение
Путем анализа данных геномной последовательности мы обнаружили, что три вида, нуждающихся в ниацине ( K. lactis, C. glabrata и Schiz. Pombe ), лишены как кинуренинового пути, так и пути аспартата.Присутствуют только гены пути спасения. Фактически, все исследованные виды дрожжей, по-видимому, обладают генами этого пути (никотинамидаза, никотинатфосфорибозилтрансфераза). Таким образом, для ниацин-отрицательных видов этот путь абсолютно необходим для биосинтеза НАД. Это было экспериментально подтверждено тем фактом, что мутант K. lactis , удаленный из NPT1 , был неспособен к росту даже в присутствии никотиновой кислоты. Насколько нам известно, все другие ранее исследованные организмы, от низших прокариот до млекопитающих или зеленых растений, имеют либо кинурениновый путь, либо аспартатный путь, либо оба пути для синтеза НАД de novo .Следовательно, хотя ниацин обычно считается витамином (B 3 ), он не является витамином в строгом смысле этого слова, потому что никотинатная составляющая НАД также может быть синтезирована из триптофана или аспарагиновой кислоты в этих организмах. Однако наша работа показала, что ниацин действительно является витамином для некоторых дрожжей, таких как K. lactis, C. glabrata и Schiz. Глазурь .
Согласно имеющимся таксономическим данным (Barnett et al. , 1990), существует всего около 35 видов дрожжей, нуждающихся в ниацине.Такие виды чрезмерно представлены в отдельных родах. Например, все виды, близкие к K. lactis , являются ниацин-отрицательными ( K. marxianus, K. aestuarii, K. africanus, K. wickerhamii и т. Д.). Hanseniaspora видов также часто нуждаются в ниацине для роста. Мы можем предположить, что все эти виды утратили пути синтеза НАД, производные от аминокислот, и сделали путь спасения достаточно эффективным, чтобы обеспечить альтернативу. Возможно, что этот способ приобретения NAD мог предшествовать развитию кинуренинового пути у эукариот.
Было показано, что путь спасения НАД с использованием никотиновой кислоты необходим для анаэробного роста дрожжей S. cerevisiae (Panozzo et al. , 2002). Поэтому стоит изучить связь между анаэробиозом и наличием пути спасения. Однако, поскольку путь спасения сохраняется у разных видов дрожжей, независимо от их способности расти в отсутствие кислорода (таблица 2), мы исследовали их способность переносить никотиновую кислоту.Хотя основным путем абсорбции никотиновой кислоты считается процесс пассивной диффузии (Henderson, 1983), TNA1 , был идентифицирован ген высокоаффинного переносчика никотиновой кислоты (Klebl et al. , 2000; Llorente И Dujon, 2000). Поиск ортологов TNA1 показал, что гены для такого предполагаемого переносчика существуют в разных геномах дрожжей и что эта функция часто является совершенно избыточной (Таблица 2). Таким образом, наши данные не предполагают какой-либо прямой связи между различиями в путях биосинтеза НАД и способностью дрожжей к анаэробному росту.
Благодарности
Мы очень благодарны доктору Хироши Фукухара (Институт Кюри), доктору Моник Болотин-Фукухара (IGM, Орсе) и профессору Стивену Оливеру (Манчестер) за критическое прочтение рукописи. Мы благодарим доктора Хироши Фукухару и доктора Синь Цзе Чена (Юго-западный медицинский центр) за любезно предоставленные нам штаммы.
Эта работа была поддержана «Institut Fédératif de Recherche Génomes-IFR115-».
Список литературы
(
1990
) Дрожжи: характеристики и идентификация
. Издательство Кембриджского университета
, Кембридж, Нью-Йорк. (
2001
) Биосинтез никотинамидадениндинуклеотидов в бактериях
. Vitam Horm
61
: 103
— 119
. (
2004
) Новая жизнь долгожителя: сигнальные функции NAD (P)
. Trends Biochem Sci
29
: 111
— 118
. и другие.
(
2004
) Эволюция генома дрожжей
. Природа
430
: 35
— 44
. (
1996
) Новые векторы для комбинаторных делеций в хромосомах дрожжей и для клонирования с восстановлением разрывов с использованием рекомбинации «маркеров расщепления»
. Дрожжи
12
: 1439
— 1457
. и другие.
(
1996
) Жизнь с 6000 генами
. Наука
274
: 546
— 563
, 547. (
2004
) Регуляция кальциевой передачи сигналов вторым мессенджером циклической аденозиндифосфорибозы (cADPR)
. Curr Mol Med
4
: 239
— 248
. (
2003
) Генетика и специфика процесса старения
. Наука
299
: 1351
— 1354
. (
1983
) Ниацин
. Annu Rev Nutr
3
: 289
— 307
. и другие.
(
2003
) Низкомолекулярные активаторы сиртуинов увеличивают продолжительность жизни Saccharomyces cerevisiae
. Природа
425
: 191
— 196
. (
1995
) Триптофан-2,3-диоксигеназа в Saccharomyces cerevisiae
. Can J Microbiol
41
: 19
— 26
. и другие.
(
2004
) Диплоидная последовательность генома Candida albicans
. Proc Natl Acad Sci USA
101
: 7329
— 7334
. (
2004
) Молекулярная биология пиридиновых нуклеотидов и биосинтез никотина
. Передняя панель Biosci
9
: 1577
— 1586
. (
2006
) Ранние этапы биосинтеза НАД у арабидопсиса начинаются с аспартата и происходят в пластиде
. Plant Physiol
141
: 851
— 857
. (
2000
) Транскрипция дрожжевого гена TNA1 регулируется не только никотинатом, но также п-аминобензоатом
. FEBS Lett
481
: 86
— 87
. (
1998
) Дрожжевой ген YJR025c кодирует диоксигеназу 3-гидроксиантраниловой кислоты и участвует в биосинтезе никотиновой кислоты
. FEBS Lett
424
: 127
— 130
. (
2003
) Биосинтез НАД: идентификация пути от триптофана до хинолината у бактерий
. Chem Biol
10
: 1195
— 1204
. (
2000
) Требование NAD и SIR2 для увеличения продолжительности жизни путем ограничения калорийности у Saccharomyces cerevisiae
. Наука
289
: 2126
— 2128
. (
2000
) Регуляция транскрипции семейства генов Saccharomyces cerevisiae DAL5 и идентификация высокоаффинной пермеазы никотиновой кислоты TNA1 (YGR260w)
. FEBS Lett
475
: 237
— 241
. (
2002
) Аэробный и анаэробный метаболизм НАД + в Saccharomyces cerevisiae
. FEBS Lett
517
: 97
— 102
. (
2002
) Фактор увеличения колоний пре-В-клеток, экспрессия которого повышается в активированных лимфоцитах, представляет собой никотинамидфосфорибозилтрансферазу, цитозольный фермент, участвующий в биосинтезе NAD
. Eur J Immunol
32
: 3225
— 3234
. (
2003
) Реконструкция метаболизма НАД эукариот
. Bioessays
25
: 683
— 690
. (
2001
) Регулирование часов и связывания ДНК NPAS2 окислительно-восстановительным состоянием кофакторов NAD
. Наука
293
: 510
— 514
. (
1971
) Регулирующая функция l-кинуренин-3-гидроксилазы (EC 1.14.1.2) для биосинтеза пиридиновых нуклеотидов в анаэробно и аэробно выращенных Saccharomyces cerevisiae
. Hoppe Seylers Z Physiol Chem
352
: 1654
— 1658
. (
1991
) Начало работы с дрожжами
. Методы Enzymol
194
: 3
— 21
. и другие.
(
2002
) Последовательность генома Schizosaccharomyces pombe
. Природа
415
: 871
— 880
. (
2002
) Регулирование функции корепрессора ядерным NADH
. Наука
295
: 1895
— 1897
. © 2007 Федерация европейских микробиологических обществ. Издано Blackwell Publishing Ltd.Все права защищены
границ | Экспрессия гена, опосредованная ниацином, и роль NiaR как репрессора транскрипции niaX, nadC и pnuC в Streptococcus pneumoniae
Введение
Бактерии могут запускать транскрипционные и фенотипические программы для синхронизации адаптивного ответа в ответ на колебания окружающей среды или стрессы (Edwards et al., 2013). Это зависит не только от количества факторов вирулентности, которыми он обладает, но и от правильного использования питательных веществ, доступных в нишах человека (Phillips et al., 1990; Титгемейер и Хиллен, 2002). Для выживания и успешного роста бактериям требуется ряд важных витаминов и кофакторов. Streptococcus pneumoniae , главный грамположительный патоген человека и носоглоточный колонизатор, сталкивается с различными факторами окружающей среды и должен соответствующим образом настраивать экспрессию своего гена (Bogaert et al., 2004; Kadioglu et al., 2008).
Ниацин (никотиновая кислота), встречающийся в природе комплекс витаминов B, является предшественником коферментов НАД и НАДФ и играет важную роль в переносе электронов во время метаболических процессов (Wei et al., 2014). Ниацин давно используется для лечения нарушений липидного обмена и сердечно-сосудистых заболеваний (Wei et al., 2014). Он может регулировать активность микробных двухкомпонентных систем и впоследствии модулировать гены и фенотипы, которые контролируются этими регуляторными белками (McPheat et al., 1983). В частности, сообщалось, что ниацин подавляет экспрессию многих генов, включая факторы вирулентности в Bordetella pertussis , такие как токсин коклюша, токсин аденилатциклазы и нитчатый гемагглютинин (Schneider and Parker, 1982; McPheat et al., 1983; Коттер и ДиРита, 2000; Каммингс и др., 2006). Кроме того, двухкомпонентная система BvgA / BvgS, которая, как известно, играет роль в регуляции вирулентности и колонизации, становится неактивной у B. pertussis , когда в среде присутствует ниацин (Miller et al., 1989). Точно так же система Escherichia coli EvgA / EvgS, которая придает множественную лекарственную устойчивость и кислотостойкость, регулируется ниацином (Masuda and Church, 2002, 2003; Eguchi et al., 2003; Nishino et al., 2003).Как система BvgA / BvgS из B. pertussis , так и система EvgA / EvgS из E. coli являются частью семейства белков, которые используют многоступенчатый фосфорный ретранслятор для запуска своих ответных путей.
Было высказано предположение, что в S. pneumoniae ниацин проникает в клетку через NiaX и превращается в никотинат (никотиновая кислота) -мононуклеотид под действием PncB (Johnson et al., 2015). Затем никотинатмононуклеотид превращается в адениндинуклеотид никотиновой кислоты с помощью NadD, после чего NadE превращает адениндинуклеотид никотиновой кислоты в адениндинуклеотид никотиновой кислоты (NAD) (Johnson et al., 2015). Другой важный фермент — глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (GAP) — это высококонсервативный и многофункциональный белок со значительной активностью в нескольких основных клеточных путях (Sirover, 2011). Обычно дегидрогеназные реакции метаболических путей считаются основными источниками НАДФН. Тем не менее важность трансгидрогеназ, глюкозодегидрогеназ и нефосфорилирующих глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназ (GAPN) становится очевидной, что позволяет предположить, что традиционная точка зрения является чрезмерно упрощенной (Sauer U.et al., 2004; Мацубара и др., 2011; Bräsen et al., 2014). Поскольку НАД является жизненно важным кофактором, используемым всеми живыми организмами, все виды бактерий используют пути восстановления НАД + до НАДН (Jurtshuk, 1996). NAD + также используется бактериями в качестве субстрата для дегидрогеназ, участвующих в расщеплении альдегидов и спиртов (Nobelmann, Lengeler, 1996; Kotrbova-Kozak et al., 2007; Luong et al., 2015). Кроме того, некоторые клеточные процессы в клетках бактерий и млекопитающих также используют НАД, например лигирование и восстановление ДНК, окислительно-восстановительный цикл в пути пируватдегидрогеназы и синтез ацетил-КоА для цикла трикарбоновых кислот (Ishino et al., 1986; Сато и Линдал, 1992; Wilkinson et al., 2001; Халкиадаки и Гуаренте, 2012 г .; Chiarugi et al., 2012; Patel et al., 2014).
YrxA (NiaR) оказался чувствительным к ниацину репрессором синтеза NAD de novo в Bacillus subtilis и регуляции транскрипции биосинтеза NAD у бактерий, имеющих ортологи B. subtilis yrxA был определен с использованием сравнительного геномного подхода. и исследования экспрессии (Родионов и др., 2008a). Члены семейства NiaR обычно консервативны в группе Bacillus / Clostridium и в неродственных линиях Fusobacteria и Thermotogales (Rodionov et al., 2008а). Реглон NiaR не ограничивается регуляцией транскрипции nadABC , но у некоторых видов он также охватывает спасение ниацина (гены pncAB ) и содержит нехарактеризованные мембранные белки, предположительно участвующие в транспорте ниацина (Родионов и др., 2008a). Более того, члены семейства NiaP (участвующие в поглощении ниацина) консервативны не только у бактерий, но и у многоклеточных эукариот, включая человека, что предполагает предполагаемое участие NiaP в утилизации ниацина этими организмами (Родионов и др., 2008а).
Это исследование объясняет транскриптомный ответ S. pneumoniae D39 на ниацин и регуляцию генов niaX, pnuC и nadC . Мы установили, что регулятор транскрипции NiaR действует как репрессор транскрипции для генов niaX, pnuC и nadC , участвующих в захвате и утилизации ниацина. Предполагаемый сайт оператора (5′-TACWRGTGTMTWKACASYTRWAW-3 ′, где R = A / G, K = G / T, S = G / C, Y = T / C, W = A / T и M = A / C) NiaR в промоторных областях niaX, pnuC и nadC предсказывается и впоследствии подтверждается мутацией сайтов-операторов NiaR в соответствующих промоторах.
Материалы и методы
Бактериальные штаммы и условия роста
Бактериальные штаммы и плазмиды, использованные в этом исследовании, перечислены в таблице 1. S. pneumonia e D39 выращивали, как описано ранее (Kloosterman et al., 2006; Afzal et al., 2014). Для анализов β-галактозидазы производные S. pneumoniae D39 выращивали в среде определенного химического состава (CDM) (Neves et al., 2002) с 10 мМ ниацином или без него. CDM был приготовлен без ниацина. Для отбора антибиотиков в среду добавляли следующие концентрации антибиотиков: 150 мкг / мл спектиномицина и 2.5 мкг / мл тетрациклина для S. pneumoniae и 100 мкг / мл ампициллина для E. coli . Все бактериальные штаммы, использованные в этом исследовании, хранили в 10% (об. / Об.) Глицерине при -80 ° C. Для ПЦР-амплификации в качестве матрицы использовали хромосомную ДНК S. pneumoniae D39 (Lanie et al., 2007). Праймеры, использованные в этом исследовании, основаны на последовательности генома S. pneumoniae D39 и перечислены в таблице 2.
Таблица 1. Список штаммов и плазмид, использованных в данном исследовании .
Таблица 2. Список праймеров, использованных в этом исследовании .
Строительство
niaR Mutant Мутант niaR (MA1300) был сконструирован в S. pneumoniae D39 путем аллельной замены кассетой устойчивости к спектиномицину. Пары праймеров niaR-1 / niaR-2 и niaR-3 / niaR-4 использовали для создания ПЦР-фрагментов левой и правой фланкирующих областей niaR с использованием ДНК-полимеразы Phusion ® High-Fidelity.Продукты ПЦР левого и правого фланкирующих участков niaR содержат сайтов AscI и NotI соответственно. Маркер устойчивости к спектиномицину, который был амплифицирован праймерами SpecR / SpecF из pORI38, также содержит сайтов AscI и NotI на своих концах. Затем путем рестрикции и лигирования левую и правую фланкирующие области niaR были слиты с геном устойчивости к спектиномицину. Полученные продукты лигирования трансформировали в S.pneumoniae D39 дикого типа, и отбор мутанта проводили по соответствующей концентрации спектиномицина. Делецию niaR дополнительно подтверждали с помощью ПЦР с использованием пары праймеров NiaR-Conf-1 / NiaR-Conf-2 и секвенирования ДНК.
Конструирование промотора
слияния lacZ и их использование в анализах β-галактозидазы Хромосомные транскрипционные слияния lacZ с промоторами niaX, pnuC и nadC были сконструированы в pPP2 (Halfmann et al., 2007) с парами праймеров, указанными в таблице 2, что дает pMA1301-03 соответственно. Эти конструкции были дополнительно введены в D39 дикого типа и D39 Δ niaR (MA1300), в результате чего были получены штаммы MA1301-03 и MA1304-06, соответственно. Следующие lacZ -слияния P niaX , P pnuC и P nadC с мутациями в сайте NiaR были сделаны в pPP2 (Halfmann et al., 2007) с использованием пар праймеров, указанных в таблице 2: P niaX-M (мутация в сайте niaR ), P pnuC-M (мутация в сайте niaR ), P nadC-R1 (мутация в сайте niaR 1) и P nadC-R2 (мутация в niaR сайте 2), что приводит к плазмидам pMA1304-07 соответственно.Эти конструкции были введены в штамм S. pneumoniae D39 дикого типа, в результате чего были получены штаммы MA1307-1310, соответственно. Аналогичным образом, хромосомные транскрипционные слияния lacZ с промоторами fba, rex, gapN, pncB, gap, adhE и adhB2 были сконструированы в pPP2 (Halfmann et al., 2007) с парами праймеров, указанными в таблице 2, в результате в pMA1308-14 соответственно. Эти конструкции затем вводили в D39 дикого типа, получая штаммы MA1311-17, соответственно.Все плазмидные конструкции дополнительно проверяли на наличие правильной вставки с помощью ПЦР и секвенирования ДНК.
Анализы β-галактозидазы выполняли, как описано ранее (Israelsen et al., 1995; Halfmann et al., 2007), с использованием клеток, которые были собраны в фазе среднего экспоненциального роста и выращены в CDM (Neves et al., 2002) с или без ниацина, как указано в разделе результатов.
Анализ микрочипов
Анализ микроматрицы выполняли, как описано ранее (Afzal et al., 2015; Shafeeq et al., 2015). Для анализа ДНК-микрочипов S. pneumoniae в присутствии ниацина транскриптом S. pneumoniae D39 дикого типа, выращенного в повторностях в CDM с 10 мМ ниацина, сравнивали с транскриптомом, выращенным в CDM с 0 мМ ниацина и собирали. на их соответствующих фазах среднего экспоненциального роста.
Для анализа ДНК микрочипов D39 Δ niaR транскриптом S. pneumoniae D39 Δ niaR сравнивали с S.pneumoniae D39 дикого типа выращивали в повторностях в полной CDM и собирали на соответствующих фазах среднего экспоненциального роста. Полный CDM содержит 8 мкМ ниацина. Процедуры анализа ДНК-микрочипов выполнялись, как описано ранее (Afzal et al., 2015; Shafeeq et al., 2015). Для идентификации дифференциально экспрессируемых генов применяли байесовский p <0,001 и пороговое значение кратного изменения> 1,5. Данные микрочипов были представлены в GEO (Gene Expression Omnibus) под номерами доступа GSE
и GSE. Результаты
Регулирование ниацин-зависимых генов в
S. pneumoniae D39 Сравнение микрочипов S. pneumoniae D39, выращенных в CDM с 0 мМ, с тем же штаммом, выращенным в CDM с 10 мМ ниацином, было выполнено для изучения влияния ниацина на транскриптом S. pneumoniae D39 дикого типа. CDM был приготовлен без ниацина. Ряд генов / оперонов дифференциально экспрессировался в тестируемых нами условиях (таблица 3). Конкретный кластер генов ( spd-0093-0095 ) был значительно активирован в отсутствие ниацина.Этот кластер генов кодирует три гипотетических белка, которые являются предполагаемыми мембранными белками. Другой кластер генов ( spd-1798-1802 ) был значительно активирован в отсутствие ниацина. Этот кластер генов состоит из регулятора реакции связывания ДНК (кодируется spd-1798 ), сенсорной гистидинкиназы (кодируется spd-1799 ), двух гипотетических белков (кодируется spd-1800 и spd- 1802 ) и транспортер ABC (кодируется spd-1801 ).Некоторые гены, которые, по-видимому, являются частью кластера генов, также были подавлены в наших тестируемых условиях ( spd-0113-15 и spd-0122-24 ). Все эти гены кодируют гипотетические белки, и роль этих генов требует дальнейшего изучения.
Таблица 3. Резюме сравнения транскриптомов S. pneumoniae D39 дикого типа, выращенного в CDM с 0 мМ ниацина, для выращивания в CDM с 10 мМ ниацина .
Предполагаемые гены пути биосинтеза ниацина были значительно активированы в отсутствие ниацина ( fba, rex, gapN, niaX, pncB — nadE, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 ). fba кодирует фруктозо-бисфосфатальдолазу, тогда как rex кодирует окислительно-восстановительный регулятор транскрипции. Аналогично, gapN кодирует глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназу, которая участвует в образовании НАДФН из НАДН. pncB кодирует никотинатфосфорибозилтрансферазу, которая превращает никотинат в никотинатный D-рибонуклеотид, и наоборот, , тогда как nadE кодирует синтетазу NAD + , которая преобразует коды деамино-NAD 9273 + + NAD 9273 + NAD + для алкогольдегидрогеназы. gap кодирует другую глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназу, а adhE кодирует железосодержащую алкогольдегидрогеназу, тогда как adhB2 кодирует цинксодержащую алкогольдегидрогеназу. NiaX (кодируемый niaX ) представляет собой субстрат-специфический компонент, предсказанный транспортером ECF ниацина, тогда как PnuC (кодируемый pnuC ) является транспортером рибозилникотинамида. NadC (кодируемый nadC ) представляет собой никотинат-нуклеотидпирофосфорилазу, и было предложено преобразовать хинолинат, образованный из аланина, аспартата и глутамата, а также метаболизм триптофана в никотинат-D-рибонуклеотид (Kanehisa et al., 2014).
Ниацин-зависимая экспрессия
fba, rex, gapN, niaX, pncB, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 Наши данные о ниацин-зависимом микрочипе, упомянутые выше, показали роль ниацина в регуляции fba, rex, gapN, niaX, pncB, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 . Чтобы подтвердить результаты наших микроматриц и продолжить изучение влияния ниацина на экспрессию fba, rex, gapN, niaX, pncB, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 , мы выполнили β-галактозидазу. тесты с промотором lacZ — слияниями этих генов, сконструированными в S.pneumoniae D39 дикого типа. Наши данные о β-галактозидазе показали, что экспрессия P fba-lacZ , P rex — lacZ , P gapN — lacZ , P niaX — lacZ , P
0000 — pnc lacZ , P pnuC — lacZ , P разрыв — lacZ , P nadC — lacZ , P adhE — lacZ и P lacZ , а P lacZ , а P lacZ , а P lacZ значительно увеличился в отсутствие ниацина в среде (рис. 1).Эти данные дополнительно подтверждают наши данные микрочипа, описанные выше, и предполагают роль ниацина в регуляции этих генов. Рисунок 1. Уровни экспрессии (в единицах Миллера) P niaX-lacZ , P pnuC-lacZ , P nadC-lacZ , P fba4 Z, rex-lacZ , P pncB-lacZ , P gap-lacZ , P adhE-lacZ , P adhB3000 P
N000, adhB2-N — lacZ в CDM с 0 и 10 мМ ниацина в S.pneumoniae D39 дикого типа . Стандартные отклонения трех независимых экспериментов указаны в столбцах. Статистическую значимость различий в уровнях экспрессии определяли с помощью однофакторного дисперсионного анализа (NS, недостоверно, ** P <0,001 и *** P <0,0001). Микроматричный анализ D39 Δ
niaR Гены ниацина в основном регулируются транскрипционным регулятором NiaR у различных бактерий (Новичков и др., 2010).У Firmicutes и Thermotogales регулятор транскрипции NiaR регулирует биосинтез NAD и утилизацию ниацина (Rodionov et al., 2008a). NiaR был впервые изучен на B. subtilis как реагирующий на ниацин репрессор транскрипции, который связывается со своими ДНК-мишенями в присутствии ниацина (Rossolillo et al., 2005). NiaR принадлежит к уникальному семейству белков, которое обладает N-концевым доменом связывания ДНК HTH (Helix-Turn-Helix) (PF08279) и C-концевым эффекторным связывающим доменом, называемым доменом 3H (PF02829). S. pneumoniae также обладает регулятором транскрипции NiaR, который может участвовать в регуляции описанных выше генов, регулируемых ниацином. Поэтому мы решили продолжить изучение роли NiaR в регуляции этих генов.
Был сконструирован делеционный мутант гена niaR , и было проведено сравнение микрочипов S. pneumoniae D39 Δ niaR с D39 дикого типа, выращенных в полной CDM, для исследования роли NiaR в S.pneumoniae D39. Полный CDM содержит 8 мкМ ниацина. В таблице 4 суммированы изменения транскриптома, вызванные делецией niaR в S. pneumoniae D39. Экспрессия niaR подавлялась примерно в 3 раза, что подтверждает делецию niaR в D39 Δ niaR . Экспрессия nadC, niaX и pnuC была значительно повышена в D39 Δ niaR , что указывает на роль NiaR в качестве репрессора транскрипции niaX, nadC и pnuC в S.pneumoniae D39. Также была повышена экспрессия spd-1824 и spd-1827 (кодирующих гипотетические белки). Spd — 1827 находится рядом с nadC ( spd-1826 ), но транскрибируется в противоположном направлении.
Таблица 4. Резюме сравнения транскриптомов S. pneumoniae D39 Δ niaR по сравнению с диким типом D39, выращенным в полной CDM .
Роль NiaR как репрессора транскрипции для
niaX, nadC и pnuC Для дальнейшего изучения роли NiaR в регуляции niaX, nadC и pnuC мы трансформировали lacZ -слияния промоторных областей niaX, nadC и pnuC в D39 . niaR и выполнили анализы β-галактозидазы в полной CDM (рис. 2). Результаты анализов β-галактозидазы показали, что активность всех этих промоторов значительно увеличилась в D39 Δ niaR по сравнению с D39 дикого типа, подтверждая роль NiaR в качестве репрессора транскрипции niaX, nadC и . pnuC .
Рисунок 2. Уровни экспрессии (в единицах Миллера) P niaX-lacZ , P pnuC-lacZ и P nadC — lacZ в комплекте S. pneumoniae D39 дикого типа и D39 Δ niaR . Стандартные отклонения трех независимых экспериментов указаны в столбцах. Статистическую значимость различий в уровнях экспрессии определяли с помощью однофакторного дисперсионного анализа (NS, не статистически значимо, ** P <0.001 и *** P <0,0001).
Прогнозирование и подтверждение сайта NiaR в P
niaX , P nadC и P pnuC Промоторные области всех генов с усиленной регуляцией, включая spd_1824 и spd_1827 , были проанализированы с помощью программного обеспечения Genome2D (Baerends et al., 2004) и поиска с помощью пробоотборника MEME-мотива (Bailey and Elkan, 1994). Палиндромоподобная последовательность длиной 22 п.н. была обнаружена в промоторных областях niaX, nadC и pnuC (рис. 3).Эта последовательность ДНК может служить сайтом оператора NiaR в S. pneumoniae . P niaX из различных стрептококков также анализировали на наличие сайта NaiR. Сайт NiaR, присутствующий в промоторной области niaX различных стрептококков, показан на фиг.4. Была построена матрица весов, основанная на этих предполагаемых сайтах NiaR (5′-TACWRGTGTMTWKACASYTRWAW -3 ‘) (фиг.4).
Рисунок 3. Организация генов, регулируемых NiaR, в S.pneumoniae D39 . Предполагаемые последовательности операторов NiaR имеют прямоугольную форму, а сайты инициации трансляции выделены курсивом, тогда как структуры леденцов представляют собой предполагаемые терминаторы транскрипции. См текст для дополнительной информации.
Рисунок 4. Идентификация сайта оператора NiaR. (A) Весовая матрица идентифицированного сайта оператора NiaR в промоторных областях niaX, nadC и pnuC . (B) Положение сайта оператора NiaR в промоторной области niaX, nadC и pnuC у различных стрептококков.Сайты предполагаемых операторов NiaR выделены жирным шрифтом и подчеркнуты. SP, S. pneumoniae ; SI, Streptococcus mitis ; SA, Streptococcus agalactiae ; SD, Streptococcus dysgalactiae ; SE, Streptococcus equi; SG, Streptococcus gallolyticus ; SN, Streptococcus gordonii ; SM, Streptococcus mutans ; SO, Streptococcus pyogenes ; SS, Streptococcus sanguinis ; SU, Streptococcus suis ; СТ, Стрептококки термофилы ; и SB, Streptococcus uberis .
Предсказанный сайт оператора NiaR, присутствующий в промоторных областях niaX, nadC и pnuC , был дополнительно подтвержден экспериментом с промоторной мутацией. С этой целью мы сделали транскрипционные lacZ -слияния P niaX , P pnuC и P nadC , где консервативные основания в предполагаемых сайтах NiaR были мутированы в P niaX (5′- TACTAGT GT ATATGC A GTTAAA-3 ‘- 5’- TACTAGT AC ATATGC C GTTAAA -3′), P pnuC (5′- TTTTACT GT AAAGAC A ‘GTTG ′ — TTTTACT AC AAAGAC G GTTGAC -3 ′), P nadC-R1 (5′- TACAATT GT CTTGAC A ATTGTA -3 ′ до 5′- TACAATT AC CTT AC ATTGTA -3 ′) и P nadC-R2 (5′- GACAATT GT ATTGAC A CTTGTT -3 ′ до 5′- GACAATT AC ATTGAC C CTTGTT -3 ′).Анализы β-галактозидазы проводили на клетках, выращенных в полной CDM. Полный CDM содержит 8 мкМ ниацина. Экспрессия P niaX и P pnuC с мутантными консервативными основаниями операторских сайтов NiaR значительно увеличилась в S. pneumoniae D39 дикого типа, подтверждая, что предсказанные сайты NiaR присутствуют в промоторных областях niaX и pnuC активны и неповреждены в S. pneumoniae (рис. 5). Два предполагаемых операторских сайта для NiaR присутствуют в P nadC (R1 и R2).Мы мутировали оба сайта по отдельности и провели анализ β-галактозидазы. Мы могли наблюдать только дерепрессию (вызванную NiaR) активности P nadC , когда сайт оператора NiaR 2 (R2) был мутирован, и не наблюдали никаких изменений в активности P nadC из-за мутации в сайте оператора NiaR 1. (R1) (Рисунок 5). Эти данные предполагают, что сайт оператора 2 (R2) является функциональным сайтом оператора в P nadC .
Рисунок 5. Уровни экспрессии (в единицах Миллера) P niaX-lacZ , P pnuC-lacZ и P nadC-lacZ с мутированными и немутантными сайтами операторов NiaR в С.pneumoniae D39 дикого типа, выращенная в полном CDM . Стандартные отклонения трех независимых экспериментов указаны в столбцах. Статистическую значимость различий в уровнях экспрессии определяли с помощью однофакторного дисперсионного анализа (NS, недостоверно, ** P <0,001 и *** P <0,0001).
Обсуждение
НАД — важный кофактор, используемый всеми живыми организмами. Синтез НАД — это строго регулируемый внутриклеточный процесс у бактерий (Huang et al., 2009). Бактерии приобретают НАД двумя основными путями: через синтез de novo и через спасательный путь. Некоторые бактерии не обладают способностью de novo синтезировать НАД и должны использовать спасательный путь для импорта ниацина или никотинамид рибозида через импортеры субстрата NiaX и PnuC соответственно. Путь de novo синтезирует НАД из аспарагиновой кислоты, тогда как путь спасения приносит промежуточные звенья на многие ступени ниже по ходу пути синтеза НАД de novo (Родионов и др., 2008b). NiaX и PnuC являются двумя основными импортерами в пути спасения NAD, где NiaX отвечает за поглощение ниацина, а PnuC транспортирует никотинамид рибозид (Herbert et al., 2003; Sauer E. et al., 2004; Rodionov et al., 2008a). , 2009). Наше текущее исследование демонстрирует транскриптомный ответ S. pneumoniae на ниацин и показывает, что ряд генов, включая pnuC, pncB и nadC , дифференциально экспрессируются в тестируемых условиях. Мы также демонстрируем, что регулятор транскрипции NiaR действует как репрессор транскрипции niaX, pnuC и nadC в присутствии ниацина.
Внеклеточный белок, способный модифицировать никотинамидмононуклеотид до импортируемой формы, по-видимому, помогает NiaX и PnuC импортировать никотинамидмононуклеотид, или может быть другая система импорта в S. pneumoniae (Johnson et al., 2015). Существует значительная вариабельность между гомологами PnuC (Jaehme et al., 2014) и гомологами PnuC из Haemophilus influenzae и Salmonella typhimurium не импортируют никотинамидмононуклеотид, но могут преобразовывать его в импортируемую форму для PnuC (никотинамид) через NadN или AphA соответственно (Kemmer et al., 2001; Grose et al., 2005). Все белки PnuC из H. influenzae, S. typhimurium и S. pneumoniae обладают мотивом связывания никотинамидмононуклеотида. Тем не менее, гомологи PnuC из многих других организмов лишены консенсусных связывающих остатков (Kemmer et al., 2001; Sauer E. et al., 2004; Grose et al., 2005). Эти наблюдения показывают, что различные группы импортеров субстрата-спасателя НАД (обозначенные как PnuC) импортируют никотинамид-рибозид и / или никотинамидмононуклеотид, и что NiaX импортирует ниацин и / или никотинамидмононуклеотид в качестве предпочтительных субстратов.Более того, аминокислоты в Salmonella PnuC, ограничивающие импорт никотинамидмононуклеотида, не законсервированы в пневмококках, что позволяет предположить, что пневмококковый PnuC может допускать этот субстрат вместе с никотинамид рибозидом. Хотя и PnuC, и NiaX в S. pneumoniae , возможно, приобрели способность импортировать никотинамидмононуклеотид, дополнительный импортер (который еще не охарактеризован) также может присутствовать (Johnson et al., 2015). Роль PnuC в патогенезе пневмококков была изучена, и PnuC может быть потенциальной жизнеспособной терапевтической мишенью для малых молекул, чтобы остановить прогрессирование заболевания у хозяина (Johnson et al., 2015). Предлагаемый путь НАД в S. pneumoniae утверждает, что ниацин и никотинамид проникают в клетки через NiaX, а PnuC транспортирует никотинамид-рибозид внутрь клетки, тогда как переносчик никотинамидмононуклеотида неизвестен (Johnson et al., 2015). spd-1411 кодирует никотинамидазу (PncA), которая превращает никотинамид в ниацин, который далее превращается в никотинатмононуклеотид фосфорибозилтрансферазой никотиновой кислоты (PncB) (Johnson et al., 2015). Затем никотинатный мононуклеотид превращается в NAD с помощью NadD и NadE. Более того, NadD (никотинат / никотинамиднуклеотид-аденилилтрансфераза) превращает никотинамид-рибозид и никотинамидмононуклеотид в NAD (Johnson et al., 2015). Увеличение количества никотинамид-рибозидов объясняется несколькими полезными функциями хозяина, включая защиту от митохондриальной миопатии (Khan et al., 2014), потерю слуха (Brown et al., 2014) и ожирение (Cantó et al., 2012). Эти функции могут быть не связаны с увеличением синтеза НАД (Frederick et al., 2015), но может быть связано с общей биодоступностью. В то время как никотинамид рибозид необходим для патогена и хозяина, к счастью, пневмококковый PnuC и его гомолог у других бактерий не имеют гомологии последовательности с какими-либо белками в животном мире. Следовательно, PnuC может быть потенциальной терапевтической мишенью для видов бактерий, экранирующих этот путь, без значимости для млекопитающих, как было эффективно показано с H. influenzae (Sauer E. et al., 2004).
ортологов NiaR были обнаружены у 30 из 45 видов из группы Bacillus / Clostridium (Firmicutes), в дополнение к расходящимся группам Fusobacteria и Thermotogales и для другой группы Bacillus /, Clostrida . был предложен сайт связывания (Родионов и др., 2008а). Существует два разных типа ДНК-связывающих сайтов NiaR, то есть оператор типа I, обнаруженный у Firmicutes и Fusobacteria, и тип II у Thermotogales. Чувствительный к ниацину фактор транскрипции NiaR (известный как YrxA в B. subtilis ) был впервые обнаружен как чувствительный к никотиновой кислоте репрессор оперона биосинтеза de novo NAD ( nadABC ) в B. subtilis (Rossolillo). и др., 2005). Регуляция NiaR генов спасения ниацина pncB (в Lactobacillus plantarum ), pncA (в Streptococcus pyogenes, Streptococcus equi и Clostridium tetani ) и / или salv00porter
С.pneumoniae и Streptococcus mutans ) (Родионов и др., 2008а) встречается реже. Более того, регулон NiaR содержит мембранные белки, которые предположительно играют роль в поглощении ниацина. Наиболее многочисленное семейство NiaP обнаружено у десяти видов, содержащих NiaR (Bacilli, Lactobacilli и Thermotogales), в дополнение к нескольким видам, у которых нет регулятора NiaR (Родионов и др., 2008a). Среди стрептококков и клостридий NiaX обнаружен в двенадцати геномах, а NiaY обнаружен в пяти геномах (бациллы и клостридии).Несколько линий геномных данных подтверждают предполагаемое участие этих семейств генов в поглощении ниацина, включая предсказанную ко-регуляцию с биосинтезом NAD и генами спасения ниацина, а также совместное присутствие с генами спасения ниацина pncB — pncA (Родионов и др. ., 2008а). Наше исследование демонстрирует, что niaX, pnuC и nadC являются генами, которые имеют предполагаемый операторный сайт NiaR в своих промоторных областях и репрессируются NiaR в присутствии ниацина.Мы дополнительно подтвердили сайты операторов NiaR в промоторных областях niaX, pnuC и nadC с помощью исследований мутагенеза. Есть и другие гены, которые дифференциально экспрессируются в наших тестируемых условиях ( fba, rex, gapN, pncB — nadE, gap, spd-1824, spd-1827, adhE и adhB2 ). Изменение экспрессии этих генов предполагает, что эти гены могут играть роль в транспорте и биосинтезе ниацина или они могут быть активированы из-за некоторого косвенного действия генов ниацина.Эти гены не имеют предполагаемого сайта-оператора NiaR в их промоторных областях, что позволяет предположить роль другого регулятора транскрипции в регуляции fba, rex, gapN, pncB — nadE, gap, spd-1824, spd-1827, adhE . , и adhB2 . Поэтому мы предполагаем, что изучение режима регуляции вышеупомянутых генов пролило бы свет на эту возможность. Авторские взносы
Существенный вклад в концепцию или дизайн работы; или сбор, анализ или интерпретация данных для работы: MA, SS и OK.Составление проекта работы или ее критический пересмотр на предмет важного интеллектуального содержания: MA, SS и OK. Окончательное утверждение публикуемой версии: MA, SS и OK. Согласие нести ответственность за все аспекты работы для обеспечения того, чтобы вопросы, связанные с точностью или целостностью любой части работы, были надлежащим образом исследованы и решены: MA, SS и OK.
Заявление о конфликте интересов
Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.
Благодарности
MA поддерживается Государственным колледжем Университета, Фейсалабад, Пакистан, в рамках программы повышения квалификации профессорско-преподавательского состава HEC в Пакистане.
Список литературы
Афзал М., Манзур И. и Койперс О. П. (2015). Быстрый и надежный конвейер для анализа бактериального транскриптома: тематическое исследование: серин-зависимая регуляция генов в Streptococcus pneumoniae . J. Vis. Exp. 98: e52649. DOI: 10.3791 / 52649
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Афзал, М., Шафик, С., Койперс, О. П. (2014). LacR является репрессором lacABCD , а LacT является активатором lacTFEG , составляющим кластер генов lac в Streptococcus pneumoniae . Заявл. Environ. Microbiol. 80, 5349–5358. DOI: 10.1128 / aem.01370-14
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Баэрэндс, Р. Дж. С., Смитс, В. К., де Йонг, А., Хамоэн, Л. В., Кок, Дж., И Койперс, О. П. (2004). Genome2D: инструмент визуализации для быстрого анализа данных бактериального транскриптома. Genome Biol. 5: R37. DOI: 10.1186 / GB-2004-5-5-r37
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Бейли Т. Л. и Элкан К. (1994). Подбор модели смеси путем максимизации ожидания для обнаружения мотивов в биополимерах. Proc. Int. Конф. Intell. Syst. Мол. Биол. Биол. 2, 28–36.
PubMed Аннотация
Богерт, Д., Де Гроот, Г. Р., и Херманс, П. В. (2004). Streptococcus pneumoniae колонизация: ключ к пневмококковой инфекции. Lancet Infect. Дис. 4, 144–154. DOI: 10.1016 / S1473-3099 (04) 00938-7
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Bräsen, C., Esser, D., Rauch, B., and Siebers, B. (2014). Углеводный обмен у архей: современные сведения о необычных ферментах и путях их регуляции. Microbiol. Мол. Биол. Ред. 78, 89–175. DOI: 10.1128 / MMBR.00041-13
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Браун, К.D., Maqsood, S., Huang, J.-Y., Pan, Y., Harkcom, W., Li, W., et al. (2014). Активация SIRT3 предшественником никотинамида рибозида NAD + защищает от потери слуха, вызванной шумом. Cell Metab. 20, 1059–1068. DOI: 10.1016 / j.cmet.2014.11.003
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Cantó, C., Houtkooper, R.H., Pirinen, E., Youn, D.Y., Oosterveer, M.H., Cen, Y., et al. (2012). Никотинамид рибозид, предшественник НАД (+), усиливает окислительный метаболизм и защищает от ожирения, вызванного диетой с высоким содержанием жиров. Cell Metab. 15, 838–847. DOI: 10.1016 / j.cmet.2012.04.022
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Каммингс К. А., Бутсма Х. Дж., Релман Д. А. и Миллер Дж. Ф. (2006). Видовой и штаммоспецифический контроль сложного гибкого регулона с помощью Bordetella BvgAS. J. Bacteriol. 188, 1775–1785. DOI: 10.1128 / JB.188.5.1775-1785.2006
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Эдвардс, Р. Л., Брайан, А., Жюль, М., Харада, К., Бухризер, К., и Суонсон, М. С. (2013). Никотиновая кислота модулирует экспрессию гена Legionella pneumophila и индуцирует признаки вирулентности. Заражение. Иммун. 81, 945–955. DOI: 10.1128 / IAI.00999-12
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Эгути Ю., Осима Т., Мори Х., Аоно Р., Ямамото К., Исихама А. и др. (2003). Транскрипционная регуляция генов оттока лекарств с помощью EvgAS, двухкомпонентной системы в Escherichia coli . Микробиология 149, 2819–2828. DOI: 10.1099 / mic.0.26460-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Фредерик Д. В., Дэвис Дж. Г., Давила А., Агарвал Б., Мичан С., Пухович М. А. и др. (2015). Повышения синтеза НАД в мышцах с помощью никотинамидфосфорибозилтрансферазы недостаточно для стимуляции окислительного метаболизма. J. Biol. Chem. 290, 1546–1558. DOI: 10.1074 / jbc.M114.579565
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Гроуз, Дж.Х., Бергторссон, У., Сюй, Ю., Стернекерт, Дж., Ходавердян, Б., и Рот, Дж. Р. (2005). Для ассимиляции никотинамидмононуклеотида требуется периплазматическая фосфатаза AphA в Salmonella enterica . J. Bacteriol. 187, 4521–4530. DOI: 10.1128 / JB.187.13.4521-4530.2005
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Халфманн А., Хакенбек Р. и Брукнер Р. (2007). Новая интегративная репортерная плазмида для Streptococcus pneumoniae . FEMS Microbiol. Lett. 268, 217–224. DOI: 10.1111 / j.1574-6968.2006.00584.x
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Герберт, М., Зауэр, Э., Сметурст, Г., Крайсс, А., Хильперт, А.-К., и Рейдл, Дж. (2003). Мутанты по захвату никотинамид-рибозила в Haemophilus influenzae . Заражение. Иммун. 71, 5398–5401. DOI: 10.1128 / IAI.71.9.5398-5401.2003
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Хуанг, Н., De Ingeniis, J., Galeazzi, L., Mancini, C., Korostelev, Y. D., Rakhmaninova, A. B., et al. (2009). Структура и функция АДФ-рибозозависимого регулятора транскрипции метаболизма НАД. Строение 17, 939–951. DOI: 10.1016 / j.str.2009.05.012
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ишино, Ю., Синагава, Х., Макино, К., Цунасава, С., Сакияма, Ф., и Наката, А. (1986). Нуклеотидная последовательность гена lig и первичная структура ДНК-лигазы Escherichia coli . Мол. Genet Genet. 204, 1–7. DOI: 10.1007 / BF00330179
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Израэльсен, Х., Мадсен, С. М., Вранг, А., Хансен, Э. Б., и Йохансен, Э. (1995). Клонирование и частичная характеристика регулируемых промоторов из Lactococcus lactis, интегрирующих Tn917-lacZ, с новым вектором промоторного зонда pAK80. Заявл. Environ. Microbiol. 61, 2540–2547.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Джеме, М., Гуськов А., Слотбум Д. Дж. (2014). Кристаллическая структура транспортера витамина B3 PnuC, полноразмерного гомолога SWEET. Нат. Struct. Мол. Биол. 21, 1013–1015. DOI: 10.1038 / nsmb.2909
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Джонсон, М. Д. Л., Эчлин, Х., Дао, Т. Х., и Рош, Дж. У. (2015). Характеристика путей спасения НАД и их роль в вирулентности у Streptococcus pneumoniae . Микробиология 161, 2127–2136.DOI: 10.1099 / микрофон. 0.000164
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Юртчук П. (1996). «Бактериальный метаболизм», в Медицинская микробиология , ред. С. Барон (Галвестон, Техас: Медицинский филиал Техасского университета в Галвестоне).
Google Scholar
Кадиоглу А., Вейзер Дж. Н., Патон Дж. К. и Эндрю П. В. (2008). Роль факторов вирулентности Streptococcus pneumoniae в респираторной колонизации и болезни хозяина. Нат. Rev. Microbiol. 6, 288–301. DOI: 10.1038 / nrmicro1871
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Канехиса М., Гото С., Сато Ю., Кавасима М., Фурумичи М. и Танабэ М. (2014). Данные, информация, знания и принципы: назад к метаболизму в KEGG. Nucleic Acids Res. 42, D199 – D205. DOI: 10.1093 / nar / gkt1076
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Кеммер, Г., Рейли, Т. Дж., Шмидт-Браунс, Дж., Злотник, Г. В., Грин, Б. А., Фиске, М. Дж. И др. (2001). NadN и e (P4) необходимы для использования NAD и никотинамидмононуклеотида, но не никотинамид рибозида в Haemophilus influenzae . J. Bacteriol. 183, 3974–3981. DOI: 10.1128 / JB.183.13.3974-3981.2001
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Хан, Н. А., Ауранен, М., Паэтау, И., Пиринен, Э., Евро, Л., Форсстрём, С., и др. (2014). Эффективное лечение митохондриальной миопатии никотинамид рибозидом, витамином B3. EMBO Mol. Med. 6, 721–731. DOI: 10.1002 / emmm.201403943
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Клоостерман, Т. Г., Бийлсма, Дж. Дж. Э., Кок, Дж., И Койперс, О. П. (2006). Чтобы угостить соседей: расширение молекулярного набора инструментов для Streptococcus pneumoniae . Микробиология 152, 351–359. DOI: 10.1099 / mic.0.28521-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Котрбова-Козак, А., Котрба, П., Инуи, М., Сайдок, Дж., И Юкава, Х. (2007). Транскрипционно регулируемый ген adhA кодирует алкогольдегидрогеназу, необходимую для утилизации этанола и н-пропанола у Corynebacterium glutamicum R. Appl. Microbiol. Biotechnol. 76, 1347–1356. DOI: 10.1007 / s00253-007-1094-6
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Lanie, J. A., Ng, W. L., Kazmierczak, K. M., Andrzejewski, T. M., Davidsen, T. M., Wayne, K. J., et al. (2007). Последовательность генома вирулентного штамма D39 серотипа 2 Эйвери из Streptococcus pneumoniae и сравнение с таковой неинкапсулированного лабораторного штамма R6. J. Bacteriol. 189, 38–51. DOI: 10.1128 / JB.01148-06
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Луонг, Т. Т., Ким, Э.-Х., Бак, Дж. П., Нгуен, К. Т., Чой, С., Брилес, Д. Е. и др. (2015). Этанол-индуцированная алкогольдегидрогеназа E (AdhE) усиливает пневмолизин у Streptococcus pneumoniae . Заражение. Иммун. 83, 108–119. DOI: 10.1128 / IAI.02434-14
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Масуда, Н., и Черч, Г. М. (2002). Экспрессия гена Escherichia coli зависит от уровня регулятора ответа EvgA. J. Bacteriol. 184, 6225–6234. DOI: 10.1128 / JB.184.22.6225-6234.2002
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Мацубара К., Йокудзи Ю., Атоми Х. и Иманака Т. (2011). Биохимическая и генетическая характеристика трех метаболических путей у Thermococcus kodakarensis, связывающих глицеральдегид-3-фосфат и 3-фосфоглицерат. Мол. Microbiol. 81, 1300–1312. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2011.07762.x
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
McPheat, W. L., Wardlaw, A. C., and Novotny, P. (1983). Модуляция Bordetella pertussis никотиновой кислотой. Заражение. Иммун. 41, 516–522.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Миллер, Дж. Ф., Рой, К. Р. и Фалькоу, С. (1989). Анализ регуляции гена вирулентности Bordetella pertussis с использованием транскрипционных слияний в Escherichia coli . J. Bacteriol. 171, 6345–6348. DOI: 10.1128 / jb.171.11.6345-6348.1989
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Невес А. Р., Вентура Р., Мансур Н., Ширман К., Гассон М. Дж., Мэйкок К. и др. (2002). Контролируется ли гликолитический поток в Lactococcus lactis в первую очередь окислительно-восстановительным зарядом? Кинетика пулов НАД (+) и НАДН определена in vivo методом 13С ЯМР. J. Biol. Chem. 277, 28088–28098. DOI: 10.1074 / jbc.M202573200
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Нишино, К., Инадзуми, Ю., Ямагути, А. (2003). Глобальный анализ регулируемых EvgA генов двухкомпонентной регуляторной системы у Escherichia coli . J. Bacteriol. 185, 2667–2672. DOI: 10.1128 / JB.185.8.2667-2672.2003
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Нобельманн Б. и Ленгелер Дж. У. (1996). Молекулярный анализ генов gat из Escherichia coli и их роли в транспорте и метаболизме галактита. Дж.Бактериол. 178, 6790–6795. DOI: 10.1128 / jb.178.23.6790-6795.1996
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Новичков П.С., Лайкова О.Н., Новичкова Е.С., Гельфанд М.С., Аркин А.П., Дубчак И. и др. (2010). RegPrecise: база данных контролируемых геномных выводов о взаимодействиях регулятора транскрипции у прокариот. Nucleic Acids Res. 38, D111 – D118. DOI: 10.1093 / nar / gkp894
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Патель, М.С., Немерия, Н. С., Фьюри, В., Джордан, Ф. (2014). Комплексы пируватдегидрогеназы: функция и регуляция на основе структуры. J. Biol. Chem. 289, 16615–16623. DOI: 10.1074 / jbc.R114.563148
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Филлипс, Н. Дж., Джон, К. М., Рейндерс, Л. Г., Гибсон, Б. В., Апичелла, М. А., и Гриффисс, Дж. М. (1990). Структурные модели липоолигосахаридов клеточной поверхности Neisseria gonorrhoeae и Haemophilus influenzae . Biomed. Environ. Масс-спектрометрия. 19, 731–745. DOI: 10.1002 / bms.12001
Веб-сайты баз данных о видах дрожжей, использованных в этом исследовании, перечислены в конце таблицы 2.поиск взрыва проводился с использованием реализованных в нем инструментов.
2Сравнение путей биосинтеза НАД у дрожжей
S. cerevisiae 1 | C. glabrata 2 | K. lactis 2 | 2 2 | C. albicans 3 | Y. lipolytica 2 | Schiz.Pombe 4 | Другие ссылочные последовательности 5 | | ||||||||||
de novo Биосинтез NAD | ||||||||||||||||||
—Кинурениновый путь | ||||||||||||||||||
BNA-TrypRW2 — | — | DEHA0G12947g (364 / e-101) | orf19.583 (919 / 9.9e-94) | YALI0F26455g (304 / 6e-83) | — | |||||||||||||
CAGL0J05126g (645/0.0) | KLLA0F01617g (633 / 0.0) | DEHA0A04840g (471 / e-133) | orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) | YALI0E28787g (474 / e-134) | Bc /1.6e-110) | |||||||||||||
BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа | — | — | DEHA0C06743g (365 / e-101) | — orf19 / 5 107) | YALI0D09867g (358 / 5e-99) | — | ||||||||||||
BNA5 / YLR231C: кинурениназа | — | — | .394 (1248 / 1.4e-128)YALI0B22902g (416 / e-116) | — | ||||||||||||||
BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 | —DE | -90HA / 4e-63)orf19.3515 (616 / 1.3e-61) | YALI0B02852g (243 / 4e-65) | — | ||||||||||||||
BNA6 / YFR047Cibosylate | трансфосфораза — хинолинат | — | DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) | orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) | YALI0E07073g (419 / e-118) | — | ||||||||||||
— Путь аспартата | ||||||||||||||||||
— * — | — * — | — * — | *— * | — * | — * | — * | NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) | — | — | — | — | — | NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) | |||||
Спасение биосинтеза НАД | ||||||||||||||||||
, биосинтез НАД | ||||||||||||||||||
— сульфатиновая кислота | ||||||||||||||||||
PNC1 / YGL037C: никотинамидаза | CAGL0A01716g (279 / 7e-76) | KLLA0F22242g (219 / 1e-57) | DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) | PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) | YALI0A21153g (153 / 6e-38) | SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) | ||||||||||||
NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) | KLLA0D06655g (624 / e-179) | DEHA0G25201g (493 / e-140) | NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) | 432800 / YALG )SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) | ||||||||||||||
NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, | CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, | orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, | YALI0E25652g (455 / e-128, | SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, | ||||||||||||||
NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) | 503 / e-143) | 479 / e-136) | 1221 / 2.3e-129) | 472 / e-133) | 1045 / 1.8e-107) | |||||||||||||
QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза | CAGL0J10758g (1255/0.0) | KLLA0D13024g (1214 / 0,0) | DEHA0A01969g (1004 / 0,0) | orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) | YALI0A20108g (1042 / 0,0) | 2276- SPCC55 / 6.02 238) | ||||||||||||
— Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) | ||||||||||||||||||
— | — | — | — | — | — | никотинамидфосфорибозилтрансфераза)|||||||||||||
Транспорт никотиновой кислоты | ||||||||||||||||||
TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты | CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) | KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) | DEHA0E10494g (257 / 4e-69) | TNA1-64 / orf19.4 ) | YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) | SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58) |
S. cerevisiae 1 | C. glabrata 2 | K. lactis 2 | D. hansenii 2 | C. | Y. lipolytica 2 | Schiz.Pombe 4 | Другие ссылочные последовательности 5 | |||||||||||
de novo Биосинтез NAD | ||||||||||||||||||
—Кинурениновый путь | ||||||||||||||||||
BNA-TrypRW2 — | — | DEHA0G12947g (364 / e-101) | orf19.583 (919 / 9.9e-94) | YALI0F26455g (304 / 6e-83) | — | |||||||||||||
CAGL0J05126g (645/0.0) | KLLA0F01617g (633 / 0.0) | DEHA0A04840g (471 / e-133) | orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) | YALI0E28787g (474 / e-134) | Bc /1.6e-110) | |||||||||||||
BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа | — | — | DEHA0C06743g (365 / e-101) | — orf19 / 5 107) | YALI0D09867g (358 / 5e-99) | — | ||||||||||||
BNA5 / YLR231C: кинурениназа | — | — | .394 (1248 / 1.4e-128)YALI0B22902g (416 / e-116) | — | ||||||||||||||
BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 | —DE | -90HA / 4e-63)orf19.3515 (616 / 1.3e-61) | YALI0B02852g (243 / 4e-65) | — | ||||||||||||||
BNA6 / YFR047Cibosylate | трансфосфораза — хинолинат | — | DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) | orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) | YALI0E07073g (419 / e-118) | — | ||||||||||||
— Путь аспартата | ||||||||||||||||||
— * — | — * — | — * — | *— * | — * | — * | — * | NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) | — | — | — | — | — | NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) | |||||
Спасение биосинтеза НАД | ||||||||||||||||||
, биосинтез НАД | ||||||||||||||||||
— сульфатиновая кислота | ||||||||||||||||||
PNC1 / YGL037C: никотинамидаза | CAGL0A01716g (279 / 7e-76) | KLLA0F22242g (219 / 1e-57) | DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) | PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) | YALI0A21153g (153 / 6e-38) | SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) | ||||||||||||
NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) | KLLA0D06655g (624 / e-179) | DEHA0G25201g (493 / e-140) | NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) | 432800 / YALG )SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) | ||||||||||||||
NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, | CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, | orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, | YALI0E25652g (455 / e-128, | SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, | ||||||||||||||
NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) | 503 / e-143) | 479 / e-136) | 1221 / 2.3e-129) | 472 / e-133) | 1045 / 1.8e-107) | |||||||||||||
QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза | CAGL0J10758g (1255/0.0) | KLLA0D13024g (1214 / 0,0) | DEHA0A01969g (1004 / 0,0) | orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) | YALI0A20108g (1042 / 0,0) | 2276- SPCC55 / 6.02 238) | ||||||||||||
— Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) | ||||||||||||||||||
— | — | — | — | — | — | никотинамидфосфорибозилтрансфераза)|||||||||||||
Транспорт никотиновой кислоты | ||||||||||||||||||
TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты | CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) | KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) | DEHA0E10494g (257 / 4e-69) | TNA1-64 / orf19.4 ) | YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) | SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58) |
Сравнение путей биосинтеза НАД у дрожжей
S. cerevisiae 1 | C. glabrata 2 | K. lactis 2 | hansenii | C. albicans 3 | Y.lipolytica 2 | Schiz. Pombe 4 | Другие ссылочные последовательности 5 | |||||||||||
de novo Биосинтез NAD | ||||||||||||||||||
—Кинурениновый путь | ||||||||||||||||||
BNA-TrypRW2 — | — | DEHA0G12947g (364 / e-101) | orf19.583 (919 / 9.9e-94) | YALI0F26455g (304 / 6e-83) | — | |||||||||||||
CAGL0J05126g (645/0.0) | KLLA0F01617g (633 / 0.0) | DEHA0A04840g (471 / e-133) | orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) | YALI0E28787g (474 / e-134) | Bc /1.6e-110) | |||||||||||||
BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа | — | — | DEHA0C06743g (365 / e-101) | — orf19 / 5 107) | YALI0D09867g (358 / 5e-99) | — | ||||||||||||
BNA5 / YLR231C: кинурениназа | — | — | .394 (1248 / 1.4e-128)YALI0B22902g (416 / e-116) | — | ||||||||||||||
BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 | —DE | -90HA / 4e-63)orf19.3515 (616 / 1.3e-61) | YALI0B02852g (243 / 4e-65) | — | ||||||||||||||
BNA6 / YFR047Cibosylate | трансфосфораза — хинолинат | — | DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) | orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) | YALI0E07073g (419 / e-118) | — | ||||||||||||
— Путь аспартата | ||||||||||||||||||
— * — | — * — | — * — | *— * | — * | — * | — * | NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) | — | — | — | — | — | NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) | |||||
Спасение биосинтеза НАД | ||||||||||||||||||
, биосинтез НАД | ||||||||||||||||||
— сульфатиновая кислота | ||||||||||||||||||
PNC1 / YGL037C: никотинамидаза | CAGL0A01716g (279 / 7e-76) | KLLA0F22242g (219 / 1e-57) | DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) | PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) | YALI0A21153g (153 / 6e-38) | SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) | ||||||||||||
NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) | KLLA0D06655g (624 / e-179) | DEHA0G25201g (493 / e-140) | NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) | 432800 / YALG )SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) | ||||||||||||||
NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, | CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, | orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, | YALI0E25652g (455 / e-128, | SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, | ||||||||||||||
NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) | 503 / e-143) | 479 / e-136) | 1221 / 2.3e-129) | 472 / e-133) | 1045 / 1.8e-107) | |||||||||||||
QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза | CAGL0J10758g (1255/0.0) | KLLA0D13024g (1214 / 0,0) | DEHA0A01969g (1004 / 0,0) | orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) | YALI0A20108g (1042 / 0,0) | 2276- SPCC55 / 6.02 238) | ||||||||||||
— Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) | ||||||||||||||||||
— | — | — | — | — | — | никотинамидфосфорибозилтрансфераза)|||||||||||||
Транспорт никотиновой кислоты | ||||||||||||||||||
TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты | CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) | KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) | DEHA0E10494g (257 / 4e-69) | TNA1-64 / orf19.4 ) | YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) | SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58) |
S. cerevisiae 1 | C. glabrata 2 | K. lactis 2 | D. hansenii 2 | C. | Y. lipolytica 2 | Schiz.Pombe 4 | Другие ссылочные последовательности 5 | |||||||||||
de novo Биосинтез NAD | ||||||||||||||||||
—Кинурениновый путь | ||||||||||||||||||
BNA-TrypRW2 — | — | DEHA0G12947g (364 / e-101) | orf19.583 (919 / 9.9e-94) | YALI0F26455g (304 / 6e-83) | — | |||||||||||||
CAGL0J05126g (645/0.0) | KLLA0F01617g (633 / 0.0) | DEHA0A04840g (471 / e-133) | orf19.5809 (1205 / 4.9e-124) | YALI0E28787g (474 / e-134) | Bc /1.6e-110) | |||||||||||||
BNA4 / YBL098W: кинуренин-3-монооксигеназа | — | — | DEHA0C06743g (365 / e-101) | — orf19 / 5 107) | YALI0D09867g (358 / 5e-99) | — | ||||||||||||
BNA5 / YLR231C: кинурениназа | — | — | .394 (1248 / 1.4e-128)YALI0B22902g (416 / e-116) | — | ||||||||||||||
BNA1 / YJR025C: 3-гидроксиантраниловая кислота диоксигеназа 23282 | —DE | -90HA / 4e-63)orf19.3515 (616 / 1.3e-61) | YALI0B02852g (243 / 4e-65) | — | ||||||||||||||
BNA6 / YFR047Cibosylate | трансфосфораза — хинолинат | — | DEHA0F27995g (149 / 4e-37) коробка передач DEHA0F28006g (251 / 1e-67) | orf19.5054 (1008 / 3.7e-103) | YALI0E07073g (419 / e-118) | — | ||||||||||||
— Путь аспартата | ||||||||||||||||||
— * — | — * — | — * — | *— * | — * | — * | — * | NP_417069 ( Escherichia coli l-аспартат оксидаза) | — | — | — | — | — | NP_415271 ( Escherichia coli, хинолинатсинтаза) | |||||
Спасение биосинтеза НАД | ||||||||||||||||||
, биосинтез НАД | ||||||||||||||||||
— сульфатиновая кислота | ||||||||||||||||||
PNC1 / YGL037C: никотинамидаза | CAGL0A01716g (279 / 7e-76) | KLLA0F22242g (219 / 1e-57) | DEHA0C14564g (14 8 / 3e-36) | PNC1 / orf19.6684 (371 / 1.2e-35) | YALI0A21153g (153 / 6e-38) | SPBC365.20c (223 / 2.3e-20) | ||||||||||||
NPT1 / YOR209C: никотинатфосфорибоз1 9028-9028 CAGL0L02805g (634 / 0.0) | KLLA0D06655g (624 / e-179) | DEHA0G25201g (493 / e-140) | NPT1 / orf19.7176 (1281 / 4.3e-132) | 432800 / YALG )SPAC1486.06 (912 / 2.3e-93) | ||||||||||||||
NMA2 / YGR010W: мононуклеотид аденилилтрансфераза никотиновой кислоты, | CAGL0A01023g (14286 e-155 DEHA0C12639g (484 / e-137, | orf19.7499 (1202 / 6.9e-128, | YALI0E25652g (455 / e-128, | SPAC806.06c (1043 / 3.0e-107, | ||||||||||||||
NMA1 / YLR328W: никразеклеотиновая кислота 28 мононентофосфат 28) 547 / e-156) | 503 / e-143) | 479 / e-136) | 1221 / 2.3e-129) | 472 / e-133) | 1045 / 1.8e-107) | |||||||||||||
QNS1 / YHR074W: глутамин-зависимая NAD-синтетаза | CAGL0J10758g (1255/0.0) | KLLA0D13024g (1214 / 0,0) | DEHA0A01969g (1004 / 0,0) | orf19.1460 (2625 / 1,6e-274) | YALI0A20108g (1042 / 0,0) | 2276- SPCC55 / 6.02 238) | ||||||||||||
— Путь спасения через никотинамидмононуклеотид (NMN) | ||||||||||||||||||
— | — | — | — | — | — | никотинамидфосфорибозилтрансфераза)|||||||||||||
Транспорт никотиновой кислоты | ||||||||||||||||||
TNA1 / YGR260W: пермеаза плазматической мембраны с высоким сродством никотиновой кислоты | CAGL0F08371g (773/0.0) CAGL0F00209g (186 / 7e-48) | KLLA0A09449g (693 / 0,0) KLLA0C19019g (288 / 2e-78) | DEHA0E10494g (257 / 4e-69) | TNA1-64 / orf19.4 ) | YALI0E20471g (271 / 3e-73) YALI0F28193g (259 / 6e-70) YALI0C02783g (255 / 1e-68) YALI0E20273g (244 / 3e-65) YALI0F19536g (241 / 647e-6427/241 / 3e-6427) ) YALI0D12100g (237 / 3e-63) YALI0F05984g (234 / 2e-62) YALI0F28369g (229 / 7e-61) YALI0D10043g (229 / 9e-61) YALI0C08569g (223 / 5e-59) YALI0F0C922 (218 / 2e-57) YALI0A09383g (169 / 8e-43) YALI0A17666g (166 / 7e-42) | SPAC11D3.18c (786 / 5.1e-80) SPBC1683.12 (715 / 1.7e-72) SPAC1002.16c (684 / 3.3e-69) SPAC1039.04 (583 / 1.7e-58) |
Результаты
Гены, кодирующие ферменты в путях биосинтеза de novo НАД, отсутствуют в геномах K. lactis, C. glabrata и Schiz. Помбе . В дрожжах S. cerevisiae путь кинуренина является признанным путем для биосинтеза НАД de novo , а гены с BNA1 до BNA6 (которые кодируют все ферменты, катализирующие превращение триптофана в мононуклеотид никотиновой кислоты) были идентифицированы, за исключением BNA3 (Schott et al., 1971 г .; Ивамото и др. , 1995; Kucharczyk et al. , 1998; Panozzo et al. , 2002). Используя аминокислотные последовательности из S. cerevisiae , мы с помощью алгоритма blast провели поиск предполагаемых кодирующих последовательностей для ферментов кинуренинового пути в геномных последовательностях шести других видов дрожжей. Результаты представлены в Таблице 2. В D. hansenii, C. albicans и Y. lipolytica были обнаружены ортологи генов BNA1 – BNA6 , что позволяет предположить, что эти три дрожжа имеют кинурениновый путь, аналогичный что в S.cerevisiae . Однако в геномах C. glabrata, K. lactis или Schiz не было обнаружено генов, ортологичных BNA1, BNA2, BNA4, BNA5 и BNA6 . pombe , что указывает на то, что у этих дрожжей отсутствует весь кинурениновый путь. Возможно ли, что эти виды могли использовать путь аспартата для биосинтеза НАД, хотя до сих пор он был обнаружен только у прокариот и растений? Чтобы проверить эту возможность, в геномах был проведен поиск кодирующих последовательностей, соответствующих аминокислотным последовательностям E.coli l-аспартатоксидаза и хинолинатсинтаза. Но ни одного ортолога в геномах этих семи дрожжей обнаружить не удалось (таблица 2). Поиск был повторен с использованием аминокислотных последовательностей тех же ферментов из растения A. thaliana с тем же результатом (данные не показаны). Результаты показали, что C. glabrata, K. lactis и Schiz. pombe также не имеет пути аспартата, обнаруженного в бактериях и некоторых растениях. Это соответствует отсутствию ортолога BNA6 (в S.cerevisiae , этот ген кодирует хинолинатфосфорибозилтрансферазу, которая превращает хинолиновую кислоту в мононуклеотид никотиновой кислоты). Аспартатный и кинурениновый пути сходятся в хинолиновой кислоте. Чтобы дополнительно прояснить, есть ли какие-либо следы генов для синтеза NAD de novo у этих трех дрожжей, мы снова выполнили бластный поиск с использованием нуклеотидных последовательностей. Не было обнаружено значительных совпадений, за исключением BNA3 (данные не показаны). В заключение, биоинформатический анализ показал, что некоторые дрожжи, такие как C.glabrata, K. lactis и Schiz. pombe , вероятно, лишены каких-либо средств биосинтеза NAD de novo , поскольку отсутствуют как кинурениновый путь, так и путь аспартата.
Следует отметить два момента, касающихся отдельных генов кинуренинового пути. В то время как BNA1, BNA2, BNA4, BNA5 и BNA6 имеют ортологи в геномах D. hansenii, C. albicans и Y. lipolytica , все они отсутствуют в геномах K.lactis, C. glabrata и Schiz. Глазурь . BNA3 , однако, является исключением, поскольку он присутствует в каждом геноме, включая те, в которых явно отсутствуют гены кинуренинового пути (Таблица 2). Хотя предполагалось, что BNA3 кодирует арилформамидазу, катализирующую вторую стадию ( N -формил-1-кинуренин в l-кинуренин) пути кинуренина, его точная роль не установлена, в отличие от других пяти генов ( Panozzo et al., 2002). Наши сравнительные геномные данные предполагают, что этот ген может участвовать в другой функции. Во-вторых, две частично перекрывающиеся последовательности, показывающие значительное сходство с BNA6 , как на уровне белка, так и на уровне ДНК, были обнаружены в D. hansenii (Таблица 2). DEHA0F27995g может предсказать полипептид, похожий на N-концевую часть Bna6p и DEHA0F28006g на C-концевую часть. Эти две последовательности были аннотированы как псевдогены в базе данных генома, и их выведенные аминокислотные последовательности были исключены из реестра D.hansenii белков в базе. Присутствие этих двух открытых рамок считывания и тот факт, что D. hansenii может расти в отсутствие никотиновой кислоты (рис.2), строго подразумевает, что эти две последовательности могут действовать как гомолог BNA6 после вероятной ошибки сдвига рамки считывания. был исправлен.
Путь спасения NAD сохраняется во всех семи дрожжах
В дополнение к маршруту биосинтеза de novo , S. cerevisiae может использовать путь спасения (через Na и NaMN) для рециркуляции никотинамида, образующегося в различных реакциях с потреблением НАД.Используя этот путь, никотиновая кислота включается в синтез НАД под действием никотинатфосфорибозилтрансферазы, которая является высококонсервативной от прокариот до эукариот. Данные, представленные в таблице 2, показывают, что этот путь спасения также хорошо сохраняется среди видов дрожжей. В частности, гены никотинатфосфорибозилтрансферазы демонстрируют высокое сходство с NPT1 в S. cerevisiae (Panozzo et al. , 2002) на уровне аминокислотной последовательности. Сообщалось, что млекопитающие используют другой путь спасения (через NMN) для рециркуляции никотинамида посредством реакции, катализируемой никотинамидфосфорибозилтрансферазой (NAmPRTase) (Rongvaux et al., 2002, 2003). Однако наши биоинформатические исследования показали, что у дрожжей, исследованных в этой работе, нет гена, кодирующего предполагаемую NAmPRTase (Таблица 2).
De novo пути и путь спасения с использованием никотиновой кислоты сходятся в NaMN, поэтому они разделяют две стадии реакции от NaMN до NAD, катализируемые мононуклеотид аденилилтрансферазой никотиновой кислоты и глутамин-зависимой NAD синтетазой соответственно. Как показано в таблице 2, гены этих двух ферментов высоко консервативны у всех семи дрожжей.
KlNPT1 является важным геном в K. lactisПриведенные выше результаты показали, что K. lactis, C. glabrata и Schiz. pombe может не осуществлять de novo биосинтез NAD, в то время как они обладают путем спасения NAD (через Na и NaMN). Если это так, то спасательный путь был бы единственным путем, которым эти дрожжи генерируют НАД. Чтобы проверить эту точку зрения, мы удалили ген KlNPT1 , который, как предполагается, кодирует никотинатфосфорибозилтрансферазу, ключевой фермент, превращающий никотиновую кислоту в NaMN в пути спасения.Делецию KlNPT1 проводили в диплоидном штамме СК11 K. lactis . Полученный гетерозиготный диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 спорулировали, и 20 асков иссекали до полной глюкозной среды. Тетрадная диссекция показала образец сегрегации несущественного гена: 18 аски дали четыре жизнеспособные споры, а два аска дали три жизнеспособные споры [(a) на фиг. 3]. Этот результат был неожиданным. Однако мы заметили, что некоторые колонии были намного меньше, и что сегрегация спор в 18 аски представляла типичную менделевскую генетическую ситуацию: две нормальные колонии vs.две меньшие колонии. Все 40 меньших колоний были устойчивыми к антибиотику G418, в то время как 38 нормальных колоний были чувствительны [(b) на фиг. 3]. Клетки, устойчивые к G418, росли плохо, и рост, казалось, прекращался через 2 дня. Это наблюдение напомнило нам, что мутанты Δ klnpt1 могут выживать за счет некоторых метаболитов, таких как НАД, диффундированный их соседями KlNPT1 , даже если разрушение будет летальным. Известно, что клетки могут жить при очень низкой концентрации НАД. Чтобы проверить эту гипотезу, устойчивые к G418 колонии реплицировали второй раз на планшете, содержащем G418.Никакие клетки больше не могли расти [(c) на рис. 3]. В то же время был проведен эксперимент по кормлению со всеми этими G418-устойчивыми колониями, и результаты показали, что их выживаемость зависела от присутствия клеток KlNPT1 [(d) на фиг. 3]. Следовательно, мы заключаем, что разрушение KlNPT1 является летальным, показывая, что путь спасения является единственным средством биосинтеза NAD у K. lactis .
3
Анализ тетрадной диссекции K.lactis гетерозиготный диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 . Аски препарировали и выращивали на полной среде (а), а затем реплицировали на чашку, содержащую 200 мкг мл -1 антибиотика G418 (b). Вторую репликацию проводили с планшетом G418 (c). В то же время клетки каждой устойчивой к G418 колонии суспендировали в физиологическом растворе (0,15 М NaCl) и наносили на полную среду для эксперимента по кормлению, в котором диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 использовался в качестве держателя KlNPT1 . штамм (d).Все планшеты инкубировали при 28 ° C в течение 3-4 дней, а затем сфотографировали.
3
Анализ тетрадной диссекции гетерозиготного диплоида K. lactis Δ klnpt1 / KlNPT1 . Аски препарировали и выращивали на полной среде (а), а затем реплицировали на чашку, содержащую 200 мкг мл -1 антибиотика G418 (b). Вторую репликацию проводили с планшетом G418 (c). В то же время клетки из каждой устойчивой к G418 колонии суспендировали в физиологическом растворе (0.15 M NaCl) и наносили на полную среду для эксперимента по кормлению, в котором диплоид Δ klnpt1 / KlNPT1 использовали в качестве удерживающего штамма KlNPT1 (d). Все планшеты инкубировали при 28 ° C в течение 3-4 дней, а затем сфотографировали.
Обсуждение
Путем анализа данных геномной последовательности мы обнаружили, что три вида, нуждающихся в ниацине ( K. lactis, C. glabrata и Schiz. Pombe ), лишены как кинуренинового пути, так и пути аспартата.Присутствуют только гены пути спасения. Фактически, все исследованные виды дрожжей, по-видимому, обладают генами этого пути (никотинамидаза, никотинатфосфорибозилтрансфераза). Таким образом, для ниацин-отрицательных видов этот путь абсолютно необходим для биосинтеза НАД. Это было экспериментально подтверждено тем фактом, что мутант K. lactis , удаленный из NPT1 , был неспособен к росту даже в присутствии никотиновой кислоты. Насколько нам известно, все другие ранее исследованные организмы, от низших прокариот до млекопитающих или зеленых растений, имеют либо кинурениновый путь, либо аспартатный путь, либо оба пути для синтеза НАД de novo .Следовательно, хотя ниацин обычно считается витамином (B 3 ), он не является витамином в строгом смысле этого слова, потому что никотинатная составляющая НАД также может быть синтезирована из триптофана или аспарагиновой кислоты в этих организмах. Однако наша работа показала, что ниацин действительно является витамином для некоторых дрожжей, таких как K. lactis, C. glabrata и Schiz. Глазурь .
Согласно имеющимся таксономическим данным (Barnett et al. , 1990), существует всего около 35 видов дрожжей, нуждающихся в ниацине.Такие виды чрезмерно представлены в отдельных родах. Например, все виды, близкие к K. lactis , являются ниацин-отрицательными ( K. marxianus, K. aestuarii, K. africanus, K. wickerhamii и т. Д.). Hanseniaspora видов также часто нуждаются в ниацине для роста. Мы можем предположить, что все эти виды утратили пути синтеза НАД, производные от аминокислот, и сделали путь спасения достаточно эффективным, чтобы обеспечить альтернативу. Возможно, что этот способ приобретения NAD мог предшествовать развитию кинуренинового пути у эукариот.
Было показано, что путь спасения НАД с использованием никотиновой кислоты необходим для анаэробного роста дрожжей S. cerevisiae (Panozzo et al. , 2002). Поэтому стоит изучить связь между анаэробиозом и наличием пути спасения. Однако, поскольку путь спасения сохраняется у разных видов дрожжей, независимо от их способности расти в отсутствие кислорода (таблица 2), мы исследовали их способность переносить никотиновую кислоту.Хотя основным путем абсорбции никотиновой кислоты считается процесс пассивной диффузии (Henderson, 1983), TNA1 , был идентифицирован ген высокоаффинного переносчика никотиновой кислоты (Klebl et al. , 2000; Llorente И Dujon, 2000). Поиск ортологов TNA1 показал, что гены для такого предполагаемого переносчика существуют в разных геномах дрожжей и что эта функция часто является совершенно избыточной (Таблица 2). Таким образом, наши данные не предполагают какой-либо прямой связи между различиями в путях биосинтеза НАД и способностью дрожжей к анаэробному росту.
Благодарности
Мы очень благодарны доктору Хироши Фукухара (Институт Кюри), доктору Моник Болотин-Фукухара (IGM, Орсе) и профессору Стивену Оливеру (Манчестер) за критическое прочтение рукописи. Мы благодарим доктора Хироши Фукухару и доктора Синь Цзе Чена (Юго-западный медицинский центр) за любезно предоставленные нам штаммы.
Эта работа была поддержана «Institut Fédératif de Recherche Génomes-IFR115-».
Список литературы
(
1990
)Дрожжи: характеристики и идентификация
.Издательство Кембриджского университета
, Кембридж, Нью-Йорк.(
2001
)Биосинтез никотинамидадениндинуклеотидов в бактериях
.Vitam Horm
61
:103
—119
.(
2004
)Новая жизнь долгожителя: сигнальные функции NAD (P)
.Trends Biochem Sci
29
:111
—118
.и другие. (
2004
)Эволюция генома дрожжей
.Природа
430
:35
—44
.(
1996
)Новые векторы для комбинаторных делеций в хромосомах дрожжей и для клонирования с восстановлением разрывов с использованием рекомбинации «маркеров расщепления»
.Дрожжи
12
:1439
—1457
.и другие. (
1996
)Жизнь с 6000 генами
.Наука
274
:546
—563
, 547.(
2004
)Регуляция кальциевой передачи сигналов вторым мессенджером циклической аденозиндифосфорибозы (cADPR)
.Curr Mol Med
4
:239
—248
.(
2003
)Генетика и специфика процесса старения
.Наука
299
:1351
—1354
.(
1983
)Ниацин
.Annu Rev Nutr
3
:289
—307
.и другие. (
2003
)Низкомолекулярные активаторы сиртуинов увеличивают продолжительность жизни Saccharomyces cerevisiae
.Природа
425
:191
—196
.(
1995
)Триптофан-2,3-диоксигеназа в Saccharomyces cerevisiae
.Can J Microbiol
41
:19
—26
.и другие. (
2004
)Диплоидная последовательность генома Candida albicans
.Proc Natl Acad Sci USA
101
:7329
—7334
.(
2004
)Молекулярная биология пиридиновых нуклеотидов и биосинтез никотина
.Передняя панель Biosci
9
:1577
—1586
.(
2006
)Ранние этапы биосинтеза НАД у арабидопсиса начинаются с аспартата и происходят в пластиде
.Plant Physiol
141
:851
—857
.(
2000
)Транскрипция дрожжевого гена TNA1 регулируется не только никотинатом, но также п-аминобензоатом
.FEBS Lett
481
:86
—87
.(
1998
)Дрожжевой ген YJR025c кодирует диоксигеназу 3-гидроксиантраниловой кислоты и участвует в биосинтезе никотиновой кислоты
.FEBS Lett
424
:127
—130
.(
2003
)Биосинтез НАД: идентификация пути от триптофана до хинолината у бактерий
.Chem Biol
10
:1195
—1204
.(
2000
)Требование NAD и SIR2 для увеличения продолжительности жизни путем ограничения калорийности у Saccharomyces cerevisiae
.Наука
289
:2126
—2128
.(
2000
)Регуляция транскрипции семейства генов Saccharomyces cerevisiae DAL5 и идентификация высокоаффинной пермеазы никотиновой кислоты TNA1 (YGR260w)
.FEBS Lett
475
:237
—241
.(
2002
)Аэробный и анаэробный метаболизм НАД + в Saccharomyces cerevisiae
.FEBS Lett
517
:97
—102
.(
2002
)Фактор увеличения колоний пре-В-клеток, экспрессия которого повышается в активированных лимфоцитах, представляет собой никотинамидфосфорибозилтрансферазу, цитозольный фермент, участвующий в биосинтезе NAD
.Eur J Immunol
32
:3225
—3234
.(
2003
)Реконструкция метаболизма НАД эукариот
.Bioessays
25
:683
—690
.(
2001
)Регулирование часов и связывания ДНК NPAS2 окислительно-восстановительным состоянием кофакторов NAD
.Наука
293
:510
—514
.(
1971
)Регулирующая функция l-кинуренин-3-гидроксилазы (EC 1.14.1.2) для биосинтеза пиридиновых нуклеотидов в анаэробно и аэробно выращенных Saccharomyces cerevisiae
.Hoppe Seylers Z Physiol Chem
352
:1654
—1658
.(
1991
)Начало работы с дрожжами
.Методы Enzymol
194
:3
—21
.и другие. (
2002
)Последовательность генома Schizosaccharomyces pombe
.Природа
415
:871
—880
.(
2002
)Регулирование функции корепрессора ядерным NADH
.Наука
295
:1895
—1897
.© 2007 Федерация европейских микробиологических обществ. Издано Blackwell Publishing Ltd.Все права защищены
границ | Экспрессия гена, опосредованная ниацином, и роль NiaR как репрессора транскрипции niaX, nadC и pnuC в Streptococcus pneumoniae
Введение
Бактерии могут запускать транскрипционные и фенотипические программы для синхронизации адаптивного ответа в ответ на колебания окружающей среды или стрессы (Edwards et al., 2013). Это зависит не только от количества факторов вирулентности, которыми он обладает, но и от правильного использования питательных веществ, доступных в нишах человека (Phillips et al., 1990; Титгемейер и Хиллен, 2002). Для выживания и успешного роста бактериям требуется ряд важных витаминов и кофакторов. Streptococcus pneumoniae , главный грамположительный патоген человека и носоглоточный колонизатор, сталкивается с различными факторами окружающей среды и должен соответствующим образом настраивать экспрессию своего гена (Bogaert et al., 2004; Kadioglu et al., 2008).
Ниацин (никотиновая кислота), встречающийся в природе комплекс витаминов B, является предшественником коферментов НАД и НАДФ и играет важную роль в переносе электронов во время метаболических процессов (Wei et al., 2014). Ниацин давно используется для лечения нарушений липидного обмена и сердечно-сосудистых заболеваний (Wei et al., 2014). Он может регулировать активность микробных двухкомпонентных систем и впоследствии модулировать гены и фенотипы, которые контролируются этими регуляторными белками (McPheat et al., 1983). В частности, сообщалось, что ниацин подавляет экспрессию многих генов, включая факторы вирулентности в Bordetella pertussis , такие как токсин коклюша, токсин аденилатциклазы и нитчатый гемагглютинин (Schneider and Parker, 1982; McPheat et al., 1983; Коттер и ДиРита, 2000; Каммингс и др., 2006). Кроме того, двухкомпонентная система BvgA / BvgS, которая, как известно, играет роль в регуляции вирулентности и колонизации, становится неактивной у B. pertussis , когда в среде присутствует ниацин (Miller et al., 1989). Точно так же система Escherichia coli EvgA / EvgS, которая придает множественную лекарственную устойчивость и кислотостойкость, регулируется ниацином (Masuda and Church, 2002, 2003; Eguchi et al., 2003; Nishino et al., 2003).Как система BvgA / BvgS из B. pertussis , так и система EvgA / EvgS из E. coli являются частью семейства белков, которые используют многоступенчатый фосфорный ретранслятор для запуска своих ответных путей.
Было высказано предположение, что в S. pneumoniae ниацин проникает в клетку через NiaX и превращается в никотинат (никотиновая кислота) -мононуклеотид под действием PncB (Johnson et al., 2015). Затем никотинатмононуклеотид превращается в адениндинуклеотид никотиновой кислоты с помощью NadD, после чего NadE превращает адениндинуклеотид никотиновой кислоты в адениндинуклеотид никотиновой кислоты (NAD) (Johnson et al., 2015). Другой важный фермент — глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (GAP) — это высококонсервативный и многофункциональный белок со значительной активностью в нескольких основных клеточных путях (Sirover, 2011). Обычно дегидрогеназные реакции метаболических путей считаются основными источниками НАДФН. Тем не менее важность трансгидрогеназ, глюкозодегидрогеназ и нефосфорилирующих глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназ (GAPN) становится очевидной, что позволяет предположить, что традиционная точка зрения является чрезмерно упрощенной (Sauer U.et al., 2004; Мацубара и др., 2011; Bräsen et al., 2014). Поскольку НАД является жизненно важным кофактором, используемым всеми живыми организмами, все виды бактерий используют пути восстановления НАД + до НАДН (Jurtshuk, 1996). NAD + также используется бактериями в качестве субстрата для дегидрогеназ, участвующих в расщеплении альдегидов и спиртов (Nobelmann, Lengeler, 1996; Kotrbova-Kozak et al., 2007; Luong et al., 2015). Кроме того, некоторые клеточные процессы в клетках бактерий и млекопитающих также используют НАД, например лигирование и восстановление ДНК, окислительно-восстановительный цикл в пути пируватдегидрогеназы и синтез ацетил-КоА для цикла трикарбоновых кислот (Ishino et al., 1986; Сато и Линдал, 1992; Wilkinson et al., 2001; Халкиадаки и Гуаренте, 2012 г .; Chiarugi et al., 2012; Patel et al., 2014).
YrxA (NiaR) оказался чувствительным к ниацину репрессором синтеза NAD de novo в Bacillus subtilis и регуляции транскрипции биосинтеза NAD у бактерий, имеющих ортологи B. subtilis yrxA был определен с использованием сравнительного геномного подхода. и исследования экспрессии (Родионов и др., 2008a). Члены семейства NiaR обычно консервативны в группе Bacillus / Clostridium и в неродственных линиях Fusobacteria и Thermotogales (Rodionov et al., 2008а). Реглон NiaR не ограничивается регуляцией транскрипции nadABC , но у некоторых видов он также охватывает спасение ниацина (гены pncAB ) и содержит нехарактеризованные мембранные белки, предположительно участвующие в транспорте ниацина (Родионов и др., 2008a). Более того, члены семейства NiaP (участвующие в поглощении ниацина) консервативны не только у бактерий, но и у многоклеточных эукариот, включая человека, что предполагает предполагаемое участие NiaP в утилизации ниацина этими организмами (Родионов и др., 2008а).
Это исследование объясняет транскриптомный ответ S. pneumoniae D39 на ниацин и регуляцию генов niaX, pnuC и nadC . Мы установили, что регулятор транскрипции NiaR действует как репрессор транскрипции для генов niaX, pnuC и nadC , участвующих в захвате и утилизации ниацина. Предполагаемый сайт оператора (5′-TACWRGTGTMTWKACASYTRWAW-3 ′, где R = A / G, K = G / T, S = G / C, Y = T / C, W = A / T и M = A / C) NiaR в промоторных областях niaX, pnuC и nadC предсказывается и впоследствии подтверждается мутацией сайтов-операторов NiaR в соответствующих промоторах.
Материалы и методы
Бактериальные штаммы и условия роста
Бактериальные штаммы и плазмиды, использованные в этом исследовании, перечислены в таблице 1. S. pneumonia e D39 выращивали, как описано ранее (Kloosterman et al., 2006; Afzal et al., 2014). Для анализов β-галактозидазы производные S. pneumoniae D39 выращивали в среде определенного химического состава (CDM) (Neves et al., 2002) с 10 мМ ниацином или без него. CDM был приготовлен без ниацина. Для отбора антибиотиков в среду добавляли следующие концентрации антибиотиков: 150 мкг / мл спектиномицина и 2.5 мкг / мл тетрациклина для S. pneumoniae и 100 мкг / мл ампициллина для E. coli . Все бактериальные штаммы, использованные в этом исследовании, хранили в 10% (об. / Об.) Глицерине при -80 ° C. Для ПЦР-амплификации в качестве матрицы использовали хромосомную ДНК S. pneumoniae D39 (Lanie et al., 2007). Праймеры, использованные в этом исследовании, основаны на последовательности генома S. pneumoniae D39 и перечислены в таблице 2.
Таблица 1. Список штаммов и плазмид, использованных в данном исследовании .
Таблица 2. Список праймеров, использованных в этом исследовании .
Строительство
niaR MutantМутант niaR (MA1300) был сконструирован в S. pneumoniae D39 путем аллельной замены кассетой устойчивости к спектиномицину. Пары праймеров niaR-1 / niaR-2 и niaR-3 / niaR-4 использовали для создания ПЦР-фрагментов левой и правой фланкирующих областей niaR с использованием ДНК-полимеразы Phusion ® High-Fidelity.Продукты ПЦР левого и правого фланкирующих участков niaR содержат сайтов AscI и NotI соответственно. Маркер устойчивости к спектиномицину, который был амплифицирован праймерами SpecR / SpecF из pORI38, также содержит сайтов AscI и NotI на своих концах. Затем путем рестрикции и лигирования левую и правую фланкирующие области niaR были слиты с геном устойчивости к спектиномицину. Полученные продукты лигирования трансформировали в S.pneumoniae D39 дикого типа, и отбор мутанта проводили по соответствующей концентрации спектиномицина. Делецию niaR дополнительно подтверждали с помощью ПЦР с использованием пары праймеров NiaR-Conf-1 / NiaR-Conf-2 и секвенирования ДНК.
Конструирование промотора
слияния lacZ и их использование в анализах β-галактозидазыХромосомные транскрипционные слияния lacZ с промоторами niaX, pnuC и nadC были сконструированы в pPP2 (Halfmann et al., 2007) с парами праймеров, указанными в таблице 2, что дает pMA1301-03 соответственно. Эти конструкции были дополнительно введены в D39 дикого типа и D39 Δ niaR (MA1300), в результате чего были получены штаммы MA1301-03 и MA1304-06, соответственно. Следующие lacZ -слияния P niaX , P pnuC и P nadC с мутациями в сайте NiaR были сделаны в pPP2 (Halfmann et al., 2007) с использованием пар праймеров, указанных в таблице 2: P niaX-M (мутация в сайте niaR ), P pnuC-M (мутация в сайте niaR ), P nadC-R1 (мутация в сайте niaR 1) и P nadC-R2 (мутация в niaR сайте 2), что приводит к плазмидам pMA1304-07 соответственно.Эти конструкции были введены в штамм S. pneumoniae D39 дикого типа, в результате чего были получены штаммы MA1307-1310, соответственно. Аналогичным образом, хромосомные транскрипционные слияния lacZ с промоторами fba, rex, gapN, pncB, gap, adhE и adhB2 были сконструированы в pPP2 (Halfmann et al., 2007) с парами праймеров, указанными в таблице 2, в результате в pMA1308-14 соответственно. Эти конструкции затем вводили в D39 дикого типа, получая штаммы MA1311-17, соответственно.Все плазмидные конструкции дополнительно проверяли на наличие правильной вставки с помощью ПЦР и секвенирования ДНК.
Анализыβ-галактозидазы выполняли, как описано ранее (Israelsen et al., 1995; Halfmann et al., 2007), с использованием клеток, которые были собраны в фазе среднего экспоненциального роста и выращены в CDM (Neves et al., 2002) с или без ниацина, как указано в разделе результатов.
Анализ микрочипов
Анализ микроматрицы выполняли, как описано ранее (Afzal et al., 2015; Shafeeq et al., 2015). Для анализа ДНК-микрочипов S. pneumoniae в присутствии ниацина транскриптом S. pneumoniae D39 дикого типа, выращенного в повторностях в CDM с 10 мМ ниацина, сравнивали с транскриптомом, выращенным в CDM с 0 мМ ниацина и собирали. на их соответствующих фазах среднего экспоненциального роста.
Для анализа ДНК микрочипов D39 Δ niaR транскриптом S. pneumoniae D39 Δ niaR сравнивали с S.pneumoniae D39 дикого типа выращивали в повторностях в полной CDM и собирали на соответствующих фазах среднего экспоненциального роста. Полный CDM содержит 8 мкМ ниацина. Процедуры анализа ДНК-микрочипов выполнялись, как описано ранее (Afzal et al., 2015; Shafeeq et al., 2015). Для идентификации дифференциально экспрессируемых генов применяли байесовский p <0,001 и пороговое значение кратного изменения> 1,5. Данные микрочипов были представлены в GEO (Gene Expression Omnibus) под номерами доступа GSE
и GSE.Результаты
Регулирование ниацин-зависимых генов в
S. pneumoniae D39Сравнение микрочипов S. pneumoniae D39, выращенных в CDM с 0 мМ, с тем же штаммом, выращенным в CDM с 10 мМ ниацином, было выполнено для изучения влияния ниацина на транскриптом S. pneumoniae D39 дикого типа. CDM был приготовлен без ниацина. Ряд генов / оперонов дифференциально экспрессировался в тестируемых нами условиях (таблица 3). Конкретный кластер генов ( spd-0093-0095 ) был значительно активирован в отсутствие ниацина.Этот кластер генов кодирует три гипотетических белка, которые являются предполагаемыми мембранными белками. Другой кластер генов ( spd-1798-1802 ) был значительно активирован в отсутствие ниацина. Этот кластер генов состоит из регулятора реакции связывания ДНК (кодируется spd-1798 ), сенсорной гистидинкиназы (кодируется spd-1799 ), двух гипотетических белков (кодируется spd-1800 и spd- 1802 ) и транспортер ABC (кодируется spd-1801 ).Некоторые гены, которые, по-видимому, являются частью кластера генов, также были подавлены в наших тестируемых условиях ( spd-0113-15 и spd-0122-24 ). Все эти гены кодируют гипотетические белки, и роль этих генов требует дальнейшего изучения.
Таблица 3. Резюме сравнения транскриптомов S. pneumoniae D39 дикого типа, выращенного в CDM с 0 мМ ниацина, для выращивания в CDM с 10 мМ ниацина .
Предполагаемые гены пути биосинтеза ниацина были значительно активированы в отсутствие ниацина ( fba, rex, gapN, niaX, pncB — nadE, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 ). fba кодирует фруктозо-бисфосфатальдолазу, тогда как rex кодирует окислительно-восстановительный регулятор транскрипции. Аналогично, gapN кодирует глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназу, которая участвует в образовании НАДФН из НАДН. pncB кодирует никотинатфосфорибозилтрансферазу, которая превращает никотинат в никотинатный D-рибонуклеотид, и наоборот, , тогда как nadE кодирует синтетазу NAD + , которая преобразует коды деамино-NAD 9273 + + NAD 9273 + NAD + для алкогольдегидрогеназы. gap кодирует другую глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназу, а adhE кодирует железосодержащую алкогольдегидрогеназу, тогда как adhB2 кодирует цинксодержащую алкогольдегидрогеназу. NiaX (кодируемый niaX ) представляет собой субстрат-специфический компонент, предсказанный транспортером ECF ниацина, тогда как PnuC (кодируемый pnuC ) является транспортером рибозилникотинамида. NadC (кодируемый nadC ) представляет собой никотинат-нуклеотидпирофосфорилазу, и было предложено преобразовать хинолинат, образованный из аланина, аспартата и глутамата, а также метаболизм триптофана в никотинат-D-рибонуклеотид (Kanehisa et al., 2014).
Ниацин-зависимая экспрессия
fba, rex, gapN, niaX, pncB, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2Наши данные о ниацин-зависимом микрочипе, упомянутые выше, показали роль ниацина в регуляции fba, rex, gapN, niaX, pncB, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 . Чтобы подтвердить результаты наших микроматриц и продолжить изучение влияния ниацина на экспрессию fba, rex, gapN, niaX, pncB, pnuC, gap, spd-1824, nadC, adhE и adhB2 , мы выполнили β-галактозидазу. тесты с промотором lacZ — слияниями этих генов, сконструированными в S.pneumoniae D39 дикого типа. Наши данные о β-галактозидазе показали, что экспрессия P fba-lacZ , P rex — lacZ , P gapN — lacZ , P niaX — lacZ , P
0000 — pnc lacZ , P pnuC — lacZ , P разрыв — lacZ , P nadC — lacZ , P adhE — lacZ и P lacZ , а P lacZ , а P lacZ , а P lacZ значительно увеличился в отсутствие ниацина в среде (рис. 1).Эти данные дополнительно подтверждают наши данные микрочипа, описанные выше, и предполагают роль ниацина в регуляции этих генов.Рисунок 1. Уровни экспрессии (в единицах Миллера) P niaX-lacZ , P pnuC-lacZ , P nadC-lacZ , P fba4 Z, rex-lacZ , P pncB-lacZ , P gap-lacZ , P adhE-lacZ , P adhB3000 P
N000, adhB2-N — lacZ в CDM с 0 и 10 мМ ниацина в S.pneumoniae D39 дикого типа . Стандартные отклонения трех независимых экспериментов указаны в столбцах. Статистическую значимость различий в уровнях экспрессии определяли с помощью однофакторного дисперсионного анализа (NS, недостоверно, ** P <0,001 и *** P <0,0001).Микроматричный анализ D39 Δ
niaRГены ниацина в основном регулируются транскрипционным регулятором NiaR у различных бактерий (Новичков и др., 2010).У Firmicutes и Thermotogales регулятор транскрипции NiaR регулирует биосинтез NAD и утилизацию ниацина (Rodionov et al., 2008a). NiaR был впервые изучен на B. subtilis как реагирующий на ниацин репрессор транскрипции, который связывается со своими ДНК-мишенями в присутствии ниацина (Rossolillo et al., 2005). NiaR принадлежит к уникальному семейству белков, которое обладает N-концевым доменом связывания ДНК HTH (Helix-Turn-Helix) (PF08279) и C-концевым эффекторным связывающим доменом, называемым доменом 3H (PF02829). S. pneumoniae также обладает регулятором транскрипции NiaR, который может участвовать в регуляции описанных выше генов, регулируемых ниацином. Поэтому мы решили продолжить изучение роли NiaR в регуляции этих генов.
Был сконструирован делеционный мутант гена niaR , и было проведено сравнение микрочипов S. pneumoniae D39 Δ niaR с D39 дикого типа, выращенных в полной CDM, для исследования роли NiaR в S.pneumoniae D39. Полный CDM содержит 8 мкМ ниацина. В таблице 4 суммированы изменения транскриптома, вызванные делецией niaR в S. pneumoniae D39. Экспрессия niaR подавлялась примерно в 3 раза, что подтверждает делецию niaR в D39 Δ niaR . Экспрессия nadC, niaX и pnuC была значительно повышена в D39 Δ niaR , что указывает на роль NiaR в качестве репрессора транскрипции niaX, nadC и pnuC в S.pneumoniae D39. Также была повышена экспрессия spd-1824 и spd-1827 (кодирующих гипотетические белки). Spd — 1827 находится рядом с nadC ( spd-1826 ), но транскрибируется в противоположном направлении.
Таблица 4. Резюме сравнения транскриптомов S. pneumoniae D39 Δ niaR по сравнению с диким типом D39, выращенным в полной CDM .
Роль NiaR как репрессора транскрипции для
niaX, nadC и pnuCДля дальнейшего изучения роли NiaR в регуляции niaX, nadC и pnuC мы трансформировали lacZ -слияния промоторных областей niaX, nadC и pnuC в D39 . niaR и выполнили анализы β-галактозидазы в полной CDM (рис. 2). Результаты анализов β-галактозидазы показали, что активность всех этих промоторов значительно увеличилась в D39 Δ niaR по сравнению с D39 дикого типа, подтверждая роль NiaR в качестве репрессора транскрипции niaX, nadC и . pnuC .
Рисунок 2. Уровни экспрессии (в единицах Миллера) P niaX-lacZ , P pnuC-lacZ и P nadC — lacZ в комплекте S. pneumoniae D39 дикого типа и D39 Δ niaR . Стандартные отклонения трех независимых экспериментов указаны в столбцах. Статистическую значимость различий в уровнях экспрессии определяли с помощью однофакторного дисперсионного анализа (NS, не статистически значимо, ** P <0.001 и *** P <0,0001).
Прогнозирование и подтверждение сайта NiaR в P
niaX , P nadC и P pnuCПромоторные области всех генов с усиленной регуляцией, включая spd_1824 и spd_1827 , были проанализированы с помощью программного обеспечения Genome2D (Baerends et al., 2004) и поиска с помощью пробоотборника MEME-мотива (Bailey and Elkan, 1994). Палиндромоподобная последовательность длиной 22 п.н. была обнаружена в промоторных областях niaX, nadC и pnuC (рис. 3).Эта последовательность ДНК может служить сайтом оператора NiaR в S. pneumoniae . P niaX из различных стрептококков также анализировали на наличие сайта NaiR. Сайт NiaR, присутствующий в промоторной области niaX различных стрептококков, показан на фиг.4. Была построена матрица весов, основанная на этих предполагаемых сайтах NiaR (5′-TACWRGTGTMTWKACASYTRWAW -3 ‘) (фиг.4).
Рисунок 3. Организация генов, регулируемых NiaR, в S.pneumoniae D39 . Предполагаемые последовательности операторов NiaR имеют прямоугольную форму, а сайты инициации трансляции выделены курсивом, тогда как структуры леденцов представляют собой предполагаемые терминаторы транскрипции. См текст для дополнительной информации.
Рисунок 4. Идентификация сайта оператора NiaR. (A) Весовая матрица идентифицированного сайта оператора NiaR в промоторных областях niaX, nadC и pnuC . (B) Положение сайта оператора NiaR в промоторной области niaX, nadC и pnuC у различных стрептококков.Сайты предполагаемых операторов NiaR выделены жирным шрифтом и подчеркнуты. SP, S. pneumoniae ; SI, Streptococcus mitis ; SA, Streptococcus agalactiae ; SD, Streptococcus dysgalactiae ; SE, Streptococcus equi; SG, Streptococcus gallolyticus ; SN, Streptococcus gordonii ; SM, Streptococcus mutans ; SO, Streptococcus pyogenes ; SS, Streptococcus sanguinis ; SU, Streptococcus suis ; СТ, Стрептококки термофилы ; и SB, Streptococcus uberis .
Предсказанный сайт оператора NiaR, присутствующий в промоторных областях niaX, nadC и pnuC , был дополнительно подтвержден экспериментом с промоторной мутацией. С этой целью мы сделали транскрипционные lacZ -слияния P niaX , P pnuC и P nadC , где консервативные основания в предполагаемых сайтах NiaR были мутированы в P niaX (5′- TACTAGT GT ATATGC A GTTAAA-3 ‘- 5’- TACTAGT AC ATATGC C GTTAAA -3′), P pnuC (5′- TTTTACT GT AAAGAC A ‘GTTG ′ — TTTTACT AC AAAGAC G GTTGAC -3 ′), P nadC-R1 (5′- TACAATT GT CTTGAC A ATTGTA -3 ′ до 5′- TACAATT AC CTT AC ATTGTA -3 ′) и P nadC-R2 (5′- GACAATT GT ATTGAC A CTTGTT -3 ′ до 5′- GACAATT AC ATTGAC C CTTGTT -3 ′).Анализы β-галактозидазы проводили на клетках, выращенных в полной CDM. Полный CDM содержит 8 мкМ ниацина. Экспрессия P niaX и P pnuC с мутантными консервативными основаниями операторских сайтов NiaR значительно увеличилась в S. pneumoniae D39 дикого типа, подтверждая, что предсказанные сайты NiaR присутствуют в промоторных областях niaX и pnuC активны и неповреждены в S. pneumoniae (рис. 5). Два предполагаемых операторских сайта для NiaR присутствуют в P nadC (R1 и R2).Мы мутировали оба сайта по отдельности и провели анализ β-галактозидазы. Мы могли наблюдать только дерепрессию (вызванную NiaR) активности P nadC , когда сайт оператора NiaR 2 (R2) был мутирован, и не наблюдали никаких изменений в активности P nadC из-за мутации в сайте оператора NiaR 1. (R1) (Рисунок 5). Эти данные предполагают, что сайт оператора 2 (R2) является функциональным сайтом оператора в P nadC .
Рисунок 5. Уровни экспрессии (в единицах Миллера) P niaX-lacZ , P pnuC-lacZ и P nadC-lacZ с мутированными и немутантными сайтами операторов NiaR в С.pneumoniae D39 дикого типа, выращенная в полном CDM . Стандартные отклонения трех независимых экспериментов указаны в столбцах. Статистическую значимость различий в уровнях экспрессии определяли с помощью однофакторного дисперсионного анализа (NS, недостоверно, ** P <0,001 и *** P <0,0001).
Обсуждение
НАД — важный кофактор, используемый всеми живыми организмами. Синтез НАД — это строго регулируемый внутриклеточный процесс у бактерий (Huang et al., 2009). Бактерии приобретают НАД двумя основными путями: через синтез de novo и через спасательный путь. Некоторые бактерии не обладают способностью de novo синтезировать НАД и должны использовать спасательный путь для импорта ниацина или никотинамид рибозида через импортеры субстрата NiaX и PnuC соответственно. Путь de novo синтезирует НАД из аспарагиновой кислоты, тогда как путь спасения приносит промежуточные звенья на многие ступени ниже по ходу пути синтеза НАД de novo (Родионов и др., 2008b). NiaX и PnuC являются двумя основными импортерами в пути спасения NAD, где NiaX отвечает за поглощение ниацина, а PnuC транспортирует никотинамид рибозид (Herbert et al., 2003; Sauer E. et al., 2004; Rodionov et al., 2008a). , 2009). Наше текущее исследование демонстрирует транскриптомный ответ S. pneumoniae на ниацин и показывает, что ряд генов, включая pnuC, pncB и nadC , дифференциально экспрессируются в тестируемых условиях. Мы также демонстрируем, что регулятор транскрипции NiaR действует как репрессор транскрипции niaX, pnuC и nadC в присутствии ниацина.
Внеклеточный белок, способный модифицировать никотинамидмононуклеотид до импортируемой формы, по-видимому, помогает NiaX и PnuC импортировать никотинамидмононуклеотид, или может быть другая система импорта в S. pneumoniae (Johnson et al., 2015). Существует значительная вариабельность между гомологами PnuC (Jaehme et al., 2014) и гомологами PnuC из Haemophilus influenzae и Salmonella typhimurium не импортируют никотинамидмононуклеотид, но могут преобразовывать его в импортируемую форму для PnuC (никотинамид) через NadN или AphA соответственно (Kemmer et al., 2001; Grose et al., 2005). Все белки PnuC из H. influenzae, S. typhimurium и S. pneumoniae обладают мотивом связывания никотинамидмононуклеотида. Тем не менее, гомологи PnuC из многих других организмов лишены консенсусных связывающих остатков (Kemmer et al., 2001; Sauer E. et al., 2004; Grose et al., 2005). Эти наблюдения показывают, что различные группы импортеров субстрата-спасателя НАД (обозначенные как PnuC) импортируют никотинамид-рибозид и / или никотинамидмононуклеотид, и что NiaX импортирует ниацин и / или никотинамидмононуклеотид в качестве предпочтительных субстратов.Более того, аминокислоты в Salmonella PnuC, ограничивающие импорт никотинамидмононуклеотида, не законсервированы в пневмококках, что позволяет предположить, что пневмококковый PnuC может допускать этот субстрат вместе с никотинамид рибозидом. Хотя и PnuC, и NiaX в S. pneumoniae , возможно, приобрели способность импортировать никотинамидмононуклеотид, дополнительный импортер (который еще не охарактеризован) также может присутствовать (Johnson et al., 2015). Роль PnuC в патогенезе пневмококков была изучена, и PnuC может быть потенциальной жизнеспособной терапевтической мишенью для малых молекул, чтобы остановить прогрессирование заболевания у хозяина (Johnson et al., 2015). Предлагаемый путь НАД в S. pneumoniae утверждает, что ниацин и никотинамид проникают в клетки через NiaX, а PnuC транспортирует никотинамид-рибозид внутрь клетки, тогда как переносчик никотинамидмононуклеотида неизвестен (Johnson et al., 2015). spd-1411 кодирует никотинамидазу (PncA), которая превращает никотинамид в ниацин, который далее превращается в никотинатмононуклеотид фосфорибозилтрансферазой никотиновой кислоты (PncB) (Johnson et al., 2015). Затем никотинатный мононуклеотид превращается в NAD с помощью NadD и NadE. Более того, NadD (никотинат / никотинамиднуклеотид-аденилилтрансфераза) превращает никотинамид-рибозид и никотинамидмононуклеотид в NAD (Johnson et al., 2015). Увеличение количества никотинамид-рибозидов объясняется несколькими полезными функциями хозяина, включая защиту от митохондриальной миопатии (Khan et al., 2014), потерю слуха (Brown et al., 2014) и ожирение (Cantó et al., 2012). Эти функции могут быть не связаны с увеличением синтеза НАД (Frederick et al., 2015), но может быть связано с общей биодоступностью. В то время как никотинамид рибозид необходим для патогена и хозяина, к счастью, пневмококковый PnuC и его гомолог у других бактерий не имеют гомологии последовательности с какими-либо белками в животном мире. Следовательно, PnuC может быть потенциальной терапевтической мишенью для видов бактерий, экранирующих этот путь, без значимости для млекопитающих, как было эффективно показано с H. influenzae (Sauer E. et al., 2004).
ортологов NiaR были обнаружены у 30 из 45 видов из группы Bacillus / Clostridium (Firmicutes), в дополнение к расходящимся группам Fusobacteria и Thermotogales и для другой группы Bacillus /, Clostrida . был предложен сайт связывания (Родионов и др., 2008а). Существует два разных типа ДНК-связывающих сайтов NiaR, то есть оператор типа I, обнаруженный у Firmicutes и Fusobacteria, и тип II у Thermotogales. Чувствительный к ниацину фактор транскрипции NiaR (известный как YrxA в B. subtilis ) был впервые обнаружен как чувствительный к никотиновой кислоте репрессор оперона биосинтеза de novo NAD ( nadABC ) в B. subtilis (Rossolillo). и др., 2005). Регуляция NiaR генов спасения ниацина pncB (в Lactobacillus plantarum ), pncA (в Streptococcus pyogenes, Streptococcus equi и Clostridium tetani ) и / или salv00porter
С.pneumoniae и Streptococcus mutans ) (Родионов и др., 2008а) встречается реже. Более того, регулон NiaR содержит мембранные белки, которые предположительно играют роль в поглощении ниацина. Наиболее многочисленное семейство NiaP обнаружено у десяти видов, содержащих NiaR (Bacilli, Lactobacilli и Thermotogales), в дополнение к нескольким видам, у которых нет регулятора NiaR (Родионов и др., 2008a). Среди стрептококков и клостридий NiaX обнаружен в двенадцати геномах, а NiaY обнаружен в пяти геномах (бациллы и клостридии).Несколько линий геномных данных подтверждают предполагаемое участие этих семейств генов в поглощении ниацина, включая предсказанную ко-регуляцию с биосинтезом NAD и генами спасения ниацина, а также совместное присутствие с генами спасения ниацина pncB — pncA (Родионов и др. ., 2008а). Наше исследование демонстрирует, что niaX, pnuC и nadC являются генами, которые имеют предполагаемый операторный сайт NiaR в своих промоторных областях и репрессируются NiaR в присутствии ниацина.Мы дополнительно подтвердили сайты операторов NiaR в промоторных областях niaX, pnuC и nadC с помощью исследований мутагенеза. Есть и другие гены, которые дифференциально экспрессируются в наших тестируемых условиях ( fba, rex, gapN, pncB — nadE, gap, spd-1824, spd-1827, adhE и adhB2 ). Изменение экспрессии этих генов предполагает, что эти гены могут играть роль в транспорте и биосинтезе ниацина или они могут быть активированы из-за некоторого косвенного действия генов ниацина.Эти гены не имеют предполагаемого сайта-оператора NiaR в их промоторных областях, что позволяет предположить роль другого регулятора транскрипции в регуляции fba, rex, gapN, pncB — nadE, gap, spd-1824, spd-1827, adhE . , и adhB2 . Поэтому мы предполагаем, что изучение режима регуляции вышеупомянутых генов пролило бы свет на эту возможность.Авторские взносы
Существенный вклад в концепцию или дизайн работы; или сбор, анализ или интерпретация данных для работы: MA, SS и OK.Составление проекта работы или ее критический пересмотр на предмет важного интеллектуального содержания: MA, SS и OK. Окончательное утверждение публикуемой версии: MA, SS и OK. Согласие нести ответственность за все аспекты работы для обеспечения того, чтобы вопросы, связанные с точностью или целостностью любой части работы, были надлежащим образом исследованы и решены: MA, SS и OK.
Заявление о конфликте интересов
Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.
Благодарности
MA поддерживается Государственным колледжем Университета, Фейсалабад, Пакистан, в рамках программы повышения квалификации профессорско-преподавательского состава HEC в Пакистане.
Список литературы
Афзал М., Манзур И. и Койперс О. П. (2015). Быстрый и надежный конвейер для анализа бактериального транскриптома: тематическое исследование: серин-зависимая регуляция генов в Streptococcus pneumoniae . J. Vis. Exp. 98: e52649. DOI: 10.3791 / 52649
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Афзал, М., Шафик, С., Койперс, О. П. (2014). LacR является репрессором lacABCD , а LacT является активатором lacTFEG , составляющим кластер генов lac в Streptococcus pneumoniae . Заявл. Environ. Microbiol. 80, 5349–5358. DOI: 10.1128 / aem.01370-14
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Баэрэндс, Р. Дж. С., Смитс, В. К., де Йонг, А., Хамоэн, Л. В., Кок, Дж., И Койперс, О. П. (2004). Genome2D: инструмент визуализации для быстрого анализа данных бактериального транскриптома. Genome Biol. 5: R37. DOI: 10.1186 / GB-2004-5-5-r37
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Бейли Т. Л. и Элкан К. (1994). Подбор модели смеси путем максимизации ожидания для обнаружения мотивов в биополимерах. Proc. Int. Конф. Intell. Syst. Мол. Биол. Биол. 2, 28–36.
PubMed Аннотация
Богерт, Д., Де Гроот, Г. Р., и Херманс, П. В. (2004). Streptococcus pneumoniae колонизация: ключ к пневмококковой инфекции. Lancet Infect. Дис. 4, 144–154. DOI: 10.1016 / S1473-3099 (04) 00938-7
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Bräsen, C., Esser, D., Rauch, B., and Siebers, B. (2014). Углеводный обмен у архей: современные сведения о необычных ферментах и путях их регуляции. Microbiol. Мол. Биол. Ред. 78, 89–175. DOI: 10.1128 / MMBR.00041-13
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Браун, К.D., Maqsood, S., Huang, J.-Y., Pan, Y., Harkcom, W., Li, W., et al. (2014). Активация SIRT3 предшественником никотинамида рибозида NAD + защищает от потери слуха, вызванной шумом. Cell Metab. 20, 1059–1068. DOI: 10.1016 / j.cmet.2014.11.003
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Cantó, C., Houtkooper, R.H., Pirinen, E., Youn, D.Y., Oosterveer, M.H., Cen, Y., et al. (2012). Никотинамид рибозид, предшественник НАД (+), усиливает окислительный метаболизм и защищает от ожирения, вызванного диетой с высоким содержанием жиров. Cell Metab. 15, 838–847. DOI: 10.1016 / j.cmet.2012.04.022
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Каммингс К. А., Бутсма Х. Дж., Релман Д. А. и Миллер Дж. Ф. (2006). Видовой и штаммоспецифический контроль сложного гибкого регулона с помощью Bordetella BvgAS. J. Bacteriol. 188, 1775–1785. DOI: 10.1128 / JB.188.5.1775-1785.2006
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Эдвардс, Р. Л., Брайан, А., Жюль, М., Харада, К., Бухризер, К., и Суонсон, М. С. (2013). Никотиновая кислота модулирует экспрессию гена Legionella pneumophila и индуцирует признаки вирулентности. Заражение. Иммун. 81, 945–955. DOI: 10.1128 / IAI.00999-12
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Эгути Ю., Осима Т., Мори Х., Аоно Р., Ямамото К., Исихама А. и др. (2003). Транскрипционная регуляция генов оттока лекарств с помощью EvgAS, двухкомпонентной системы в Escherichia coli . Микробиология 149, 2819–2828. DOI: 10.1099 / mic.0.26460-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Фредерик Д. В., Дэвис Дж. Г., Давила А., Агарвал Б., Мичан С., Пухович М. А. и др. (2015). Повышения синтеза НАД в мышцах с помощью никотинамидфосфорибозилтрансферазы недостаточно для стимуляции окислительного метаболизма. J. Biol. Chem. 290, 1546–1558. DOI: 10.1074 / jbc.M114.579565
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Гроуз, Дж.Х., Бергторссон, У., Сюй, Ю., Стернекерт, Дж., Ходавердян, Б., и Рот, Дж. Р. (2005). Для ассимиляции никотинамидмононуклеотида требуется периплазматическая фосфатаза AphA в Salmonella enterica . J. Bacteriol. 187, 4521–4530. DOI: 10.1128 / JB.187.13.4521-4530.2005
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Халфманн А., Хакенбек Р. и Брукнер Р. (2007). Новая интегративная репортерная плазмида для Streptococcus pneumoniae . FEMS Microbiol. Lett. 268, 217–224. DOI: 10.1111 / j.1574-6968.2006.00584.x
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Герберт, М., Зауэр, Э., Сметурст, Г., Крайсс, А., Хильперт, А.-К., и Рейдл, Дж. (2003). Мутанты по захвату никотинамид-рибозила в Haemophilus influenzae . Заражение. Иммун. 71, 5398–5401. DOI: 10.1128 / IAI.71.9.5398-5401.2003
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Хуанг, Н., De Ingeniis, J., Galeazzi, L., Mancini, C., Korostelev, Y. D., Rakhmaninova, A. B., et al. (2009). Структура и функция АДФ-рибозозависимого регулятора транскрипции метаболизма НАД. Строение 17, 939–951. DOI: 10.1016 / j.str.2009.05.012
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ишино, Ю., Синагава, Х., Макино, К., Цунасава, С., Сакияма, Ф., и Наката, А. (1986). Нуклеотидная последовательность гена lig и первичная структура ДНК-лигазы Escherichia coli . Мол. Genet Genet. 204, 1–7. DOI: 10.1007 / BF00330179
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Израэльсен, Х., Мадсен, С. М., Вранг, А., Хансен, Э. Б., и Йохансен, Э. (1995). Клонирование и частичная характеристика регулируемых промоторов из Lactococcus lactis, интегрирующих Tn917-lacZ, с новым вектором промоторного зонда pAK80. Заявл. Environ. Microbiol. 61, 2540–2547.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Джеме, М., Гуськов А., Слотбум Д. Дж. (2014). Кристаллическая структура транспортера витамина B3 PnuC, полноразмерного гомолога SWEET. Нат. Struct. Мол. Биол. 21, 1013–1015. DOI: 10.1038 / nsmb.2909
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Джонсон, М. Д. Л., Эчлин, Х., Дао, Т. Х., и Рош, Дж. У. (2015). Характеристика путей спасения НАД и их роль в вирулентности у Streptococcus pneumoniae . Микробиология 161, 2127–2136.DOI: 10.1099 / микрофон. 0.000164
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Юртчук П. (1996). «Бактериальный метаболизм», в Медицинская микробиология , ред. С. Барон (Галвестон, Техас: Медицинский филиал Техасского университета в Галвестоне).
Google Scholar
Кадиоглу А., Вейзер Дж. Н., Патон Дж. К. и Эндрю П. В. (2008). Роль факторов вирулентности Streptococcus pneumoniae в респираторной колонизации и болезни хозяина. Нат. Rev. Microbiol. 6, 288–301. DOI: 10.1038 / nrmicro1871
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Канехиса М., Гото С., Сато Ю., Кавасима М., Фурумичи М. и Танабэ М. (2014). Данные, информация, знания и принципы: назад к метаболизму в KEGG. Nucleic Acids Res. 42, D199 – D205. DOI: 10.1093 / nar / gkt1076
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Кеммер, Г., Рейли, Т. Дж., Шмидт-Браунс, Дж., Злотник, Г. В., Грин, Б. А., Фиске, М. Дж. И др. (2001). NadN и e (P4) необходимы для использования NAD и никотинамидмононуклеотида, но не никотинамид рибозида в Haemophilus influenzae . J. Bacteriol. 183, 3974–3981. DOI: 10.1128 / JB.183.13.3974-3981.2001
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Хан, Н. А., Ауранен, М., Паэтау, И., Пиринен, Э., Евро, Л., Форсстрём, С., и др. (2014). Эффективное лечение митохондриальной миопатии никотинамид рибозидом, витамином B3. EMBO Mol. Med. 6, 721–731. DOI: 10.1002 / emmm.201403943
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Клоостерман, Т. Г., Бийлсма, Дж. Дж. Э., Кок, Дж., И Койперс, О. П. (2006). Чтобы угостить соседей: расширение молекулярного набора инструментов для Streptococcus pneumoniae . Микробиология 152, 351–359. DOI: 10.1099 / mic.0.28521-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Котрбова-Козак, А., Котрба, П., Инуи, М., Сайдок, Дж., И Юкава, Х. (2007). Транскрипционно регулируемый ген adhA кодирует алкогольдегидрогеназу, необходимую для утилизации этанола и н-пропанола у Corynebacterium glutamicum R. Appl. Microbiol. Biotechnol. 76, 1347–1356. DOI: 10.1007 / s00253-007-1094-6
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Lanie, J. A., Ng, W. L., Kazmierczak, K. M., Andrzejewski, T. M., Davidsen, T. M., Wayne, K. J., et al. (2007). Последовательность генома вирулентного штамма D39 серотипа 2 Эйвери из Streptococcus pneumoniae и сравнение с таковой неинкапсулированного лабораторного штамма R6. J. Bacteriol. 189, 38–51. DOI: 10.1128 / JB.01148-06
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Луонг, Т. Т., Ким, Э.-Х., Бак, Дж. П., Нгуен, К. Т., Чой, С., Брилес, Д. Е. и др. (2015). Этанол-индуцированная алкогольдегидрогеназа E (AdhE) усиливает пневмолизин у Streptococcus pneumoniae . Заражение. Иммун. 83, 108–119. DOI: 10.1128 / IAI.02434-14
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Масуда, Н., и Черч, Г. М. (2002). Экспрессия гена Escherichia coli зависит от уровня регулятора ответа EvgA. J. Bacteriol. 184, 6225–6234. DOI: 10.1128 / JB.184.22.6225-6234.2002
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Мацубара К., Йокудзи Ю., Атоми Х. и Иманака Т. (2011). Биохимическая и генетическая характеристика трех метаболических путей у Thermococcus kodakarensis, связывающих глицеральдегид-3-фосфат и 3-фосфоглицерат. Мол. Microbiol. 81, 1300–1312. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2011.07762.x
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
McPheat, W. L., Wardlaw, A. C., and Novotny, P. (1983). Модуляция Bordetella pertussis никотиновой кислотой. Заражение. Иммун. 41, 516–522.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Миллер, Дж. Ф., Рой, К. Р. и Фалькоу, С. (1989). Анализ регуляции гена вирулентности Bordetella pertussis с использованием транскрипционных слияний в Escherichia coli . J. Bacteriol. 171, 6345–6348. DOI: 10.1128 / jb.171.11.6345-6348.1989
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Невес А. Р., Вентура Р., Мансур Н., Ширман К., Гассон М. Дж., Мэйкок К. и др. (2002). Контролируется ли гликолитический поток в Lactococcus lactis в первую очередь окислительно-восстановительным зарядом? Кинетика пулов НАД (+) и НАДН определена in vivo методом 13С ЯМР. J. Biol. Chem. 277, 28088–28098. DOI: 10.1074 / jbc.M202573200
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Нишино, К., Инадзуми, Ю., Ямагути, А. (2003). Глобальный анализ регулируемых EvgA генов двухкомпонентной регуляторной системы у Escherichia coli . J. Bacteriol. 185, 2667–2672. DOI: 10.1128 / JB.185.8.2667-2672.2003
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Нобельманн Б. и Ленгелер Дж. У. (1996). Молекулярный анализ генов gat из Escherichia coli и их роли в транспорте и метаболизме галактита. Дж.Бактериол. 178, 6790–6795. DOI: 10.1128 / jb.178.23.6790-6795.1996
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Новичков П.С., Лайкова О.Н., Новичкова Е.С., Гельфанд М.С., Аркин А.П., Дубчак И. и др. (2010). RegPrecise: база данных контролируемых геномных выводов о взаимодействиях регулятора транскрипции у прокариот. Nucleic Acids Res. 38, D111 – D118. DOI: 10.1093 / nar / gkp894
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Патель, М.С., Немерия, Н. С., Фьюри, В., Джордан, Ф. (2014). Комплексы пируватдегидрогеназы: функция и регуляция на основе структуры. J. Biol. Chem. 289, 16615–16623. DOI: 10.1074 / jbc.R114.563148
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Филлипс, Н. Дж., Джон, К. М., Рейндерс, Л. Г., Гибсон, Б. В., Апичелла, М. А., и Гриффисс, Дж. М. (1990). Структурные модели липоолигосахаридов клеточной поверхности Neisseria gonorrhoeae и Haemophilus influenzae . Biomed. Environ. Масс-спектрометрия. 19, 731–745. DOI: 10.1002 / bms.12001
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Родионов Д.А., Де Инженис, Дж., Манчини, К., Чимадамор, Ф., Чжан, Х., Остерман, А. Л. и др. (2008b). Транскрипционная регуляция метаболизма НАД в бактериях: семейство NrtR регуляторов, связанных с Nudix. Nucleic Acids Res. 36, 2047–2059. DOI: 10.1093 / nar / gkn047
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Родионов, Д.A., Hebbeln, P., Eudes, A., ter Beek, J., Rodionova, I.A., Erkens, G. B., et al. (2009). Новый класс модульных транспортеров витаминов у прокариот. J. Bacteriol. 191, 42–51. DOI: 10.1128 / JB.01208-08
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Родионов Д.А., Ли X., Родионова И.А., Янг, К., Сорчи, Л., Дервин, Э. и др. (2008a). Транскрипционная регуляция метаболизма НАД у бактерий: геномная реконструкция регулона NiaR (YrxA). Nucleic Acids Res. 36, 2032–2046. DOI: 10.1093 / nar / gkn046
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Россолилло, П., Маринони, И., Галли, Э., Колозимо, А., и Альбертини, А. М. (2005). YrxA является регулятором транскрипции, который репрессирует de novo биосинтез NAD в Bacillus subtilis . J. Bacteriol. 187, 7155–7160. DOI: 10.1128 / JB.187.20.7155-7160.2005
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Зауэр, Э., Мерданович, М., Мортимер, А. П., Брингманн, Г., и Рейдл, Дж. (2004). PnuC и использование аналога никотинамид рибозида 3-аминопиридина в Haemophilus influenzae . Антимикробный. Агенты Chemother. 48, 4532–4541. DOI: 10.1128 / AAC.48.12.4532-4541.2004
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Зауэр У., Канонако Ф., Хери С., Перрено А. и Фишер Э. (2004). Растворимые и связанные с мембраной трансгидрогеназы UdhA и PntAB выполняют различные функции в метаболизме НАДФН Escherichia coli . J. Biol. Chem. 279, 6613–6619. DOI: 10.1074 / jbc.M311657200
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Шнайдер Д. Р. и Паркер К. Д. (1982). Влияние пиридинов на фенотипические свойства Bordetella pertussis . Заражение. Иммун. 38, 548–553.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Шафик, С., Афзал, М., Энрикес-Нормарк, Б., и Койперс, О. П. (2015). Транскрипционное профилирование регулируемых UlaR генов в Streptococcus pneumoniae . Genomics Data 4, 57–59. DOI: 10.1016 / j.gdata.2015.02.004
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Сировер, М.А. (2011). О функциональном разнообразии глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы: биохимические механизмы и регуляторный контроль. Biochim. Биофиз. Acta 1810, 741–751. DOI: 10.1016 / j.bbagen.2011.05.010
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Вэй, З., Фу, Ю., Чжоу, Э., Тянь, Ю., Yao, M., Li, Y., et al. (2014). Влияние ниацина на интернализацию Staphylococcus aureus в эпителиальные клетки молочной железы крупного рогатого скота путем модуляции активации NF-κB. Microb. Патог. 71–72, 62–67. DOI: 10.1016 / j.micpath.2014.03.005
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Влияние высоких концентраций никотиновой кислоты и никотинамида на рост некоторых стрептококков и пневмококков на JSTOR
AbstractРост пневмококков, гемолитических стрептококков и стрептококков из групп Enterococcus и viridans в различной степени задерживался, а в некоторых случаях полностью подавлялся в присутствии от 5000 до 20000 мкг на мл никотиновой кислоты или никотинамида в среде с мясным настоем пептон-глюкозы. .Энтерококки и стрептококки viridans несколько меньше подвержены влиянию избыточного количества витамина, чем гемолитические стрептококки и плевмококки. При pH 6,5 высокие концентрации никотиновой кислоты были более ингибирующими, чем при pH 7,5, но при этих уровнях pH не было большой разницы в действии никотинамида.
Journal InformationОснованный в 1904 году, The Journal of Infectious Diseases является ведущим изданием в Западном полушарии для оригинальных исследований патогенеза, диагностики и лечения инфекционных заболеваний, микробов, вызывающих их, и нарушений иммунных механизмов хозяина.Статьи в JID включают результаты исследований в области микробиологии, иммунологии, эпидемиологии и смежных дисциплин. Опубликовано для Общества инфекционных болезней Америки.
Информация об издателеOxford University Press — это отделение Оксфордского университета. Издание во всем мире способствует достижению цели университета в области исследований, стипендий и образования. OUP — крупнейшая в мире университетская пресса с самым широким глобальным присутствием. В настоящее время он издает более 6000 новых публикаций в год, имеет офисы примерно в пятидесяти странах и насчитывает более 5500 сотрудников по всему миру.Он стал известен миллионам людей благодаря разнообразной издательской программе, которая включает научные работы по всем академическим дисциплинам, библии, музыку, школьные и университетские учебники, книги по бизнесу, словари и справочники, а также академические журналы.
Рынок никотиновой кислоты | Глобальный отраслевой отчет, 2027 г.
Рынок никотиновой кислоты: незаменимый витамин
- Никотиновая кислота также известна как ниацин, витамин B3 и никотинамид.Это важно для роста и синтеза гормонов. Эта кислота является питательным веществом, которое поддерживает организм, превращая пищу в глюкозу. Затем глюкоза используется для производства энергии в организме.
- Никотиновая кислота также помогает в нормальном функционировании нервной системы и снижает утомляемость. Он широко присутствует в мясе, рыбе, цельных злаках, дрожжах, горохе, бобах, орехах, фруктах и овощах.
- Ткани, присутствующие в нашем организме, превращают абсорбированный ниацин в кофермент никотинамидадениндинуклеотид (НАД).НАД в первую очередь участвует в катаболических реакциях для передачи потенциальной энергии углеводов, жиров и белков аденозинтрифосфату (АТФ).
Что-то сдерживает рост вашей компании на рынке никотиновой кислоты? Запросите брошюру с отчетом здесь
Ключевые драйверы рынка никотиновой кислоты
- Увеличение потребления мяса — ключевой драйвер мирового рынка никотиновой кислоты. Рост мирового потребления мяса на душу населения и повышение осведомленности о потреблении белка в ежедневном рационе увеличили потребление мяса.Никотиновая кислота добавляется в корм для свиней и кур. Ожидается, что это, в свою очередь, будет способствовать развитию мирового рынка никотиновой кислоты в течение прогнозируемого периода.
- Никотиновая кислота используется для лечения диабета 1 типа. Он повышает уровень ЛПВП и используется при лечении пеллагры. Спрос на витаминные добавки растет в связи с повышением осведомленности потребителей о своем здоровье. Это движет мировым рынком никотиновой кислоты.
- Увеличение располагаемого дохода людей во всем мире привело к изменениям в образе жизни.Это, в свою очередь, увеличило потребление нездоровой пищи. Увеличение потребления нездоровой пищи привело к дисбалансу уровня холестерина в организме. Это, в свою очередь, может повысить спрос на лекарства, тем самым стимулируя рынок никотиновой кислоты.
Отсутствие осведомленности о преимуществах рынка никотиновой кислоты для создания препятствий на рынке
- Рынок никотиновой кислоты консолидирован. Никотиновая кислота в очень небольших количествах используется в производстве лекарств, косметики и т. Д.
- На рынке доминируют несколько производителей со всего мира. Низкая осведомленность о преимуществах никотиновой кислоты препятствует глобальному рынку никотиновой кислоты.
Сегментация рынка никотиновой кислоты
- В зависимости от отрасли, в которой работают конечные пользователи, глобальный рынок никотиновой кислоты можно разделить на промышленный рынок, кормовые добавки, фармацевтические препараты, косметику, продукты питания и напитки. Никотиновая кислота используется для подготовки металлических поверхностей при производстве цинковых и кадмиевых отбеливателей.Он также используется в качестве осветляющей добавки в металлических ваннах, не содержащих цианидов, для гальванического цинка и других металлов.
- Никотиновая кислота используется в качестве пищевой добавки для улучшения цвета фарша. Он вступает в реакцию с гемоглобином и миоглобином, присутствующими в мясе, с образованием ярко окрашенного комплекса.
- Никотиновая кислота используется в составе кремов для кожи, лосьонов для волос и других продуктов личной гигиены в косметической промышленности. Кроме того, кислота защищает кожу от солнечных лучей. Рост производства премиальных брендов косметических средств по уходу за кожей стимулировал рост рынка косметики.
- Потребители во всем мире постоянно стремятся обновлять и расширять свои знания о продуктах по уходу за кожей. Они активно занимаются продажами люксовых и премиальных брендов в Интернете. Эти факторы привели к увеличению продаж брендов средств по уходу за кожей премиум-класса, что повысило спрос на косметику во всем мире. Никотиновая кислота в форме никотинамида используется для устранения дисбаланса, создаваемого коферментами никотинамида, присутствующими в коже, с возрастом. Ожидается, что это, в свою очередь, станет движущей силой рынка в ближайшем будущем.
- Кроме того, никотиновая кислота в форме ниацинамида помогает регулировать биосинтез кератиноцитов, которые используются для производства кератина. Кератин — это тип белка, который защищает эпителиальные клетки от повреждений или стресса, а также используется для роста волос. Кроме того, изменения в образе жизни привели к увеличению выпадения волос, что, в свою очередь, может увеличить спрос на никотиновую кислоту в ближайшем будущем. Это, в свою очередь, движет мировым рынком никотиновой кислоты.
Застряли в конкурентной борьбе с другими брендами? Запросите индивидуальный отчет о конкуренции на рынке никотиновой кислоты здесь
Ожидается, что Азиатско-Тихоокеанский регион займет основную долю мирового рынка никотиновой кислоты
- С точки зрения региона глобальный рынок никотиновой кислоты можно разделить на Азиатско-Тихоокеанский регион, Европу, Северную Америку, Ближний Восток и Африку и Латинскую Америку. Ожидается, что Азиатско-Тихоокеанский регион будет составлять основную долю мирового рынка в течение прогнозируемого периода.В Китае и Индии есть большое количество потребителей курицы. Добавки никотиновой кислоты даются цыплятам и свиньям для удовлетворения основных потребностей роста их организма. Это, в свою очередь, по прогнозам, приведет к увеличению спроса на никотиновую кислоту в ближайшем будущем.
- По прогнозам, в связи с растущим влиянием западной культуры увеличение располагаемого дохода, беспокойный образ жизни и высокая численность молодежи будут стимулировать спрос на никотиновую кислоту в ближайшем будущем
- Ожидается, что увеличение численности населения и покупательной способности населения Азиатско-Тихоокеанского региона приведет к увеличению спроса на мясо в регионе.Ожидается, что это, в свою очередь, приведет к увеличению спроса на никотиновую кислоту в ближайшем будущем.
- Ожидается, что рост использования никотиновой кислоты в производстве лекарств для профилактики и лечения пеллагры, которая является заболеванием, вызванным более низким уровнем никотиновой кислоты в организме, будет стимулировать рынок к концу прогнозного периода.
Ключевые участники рынка
Производители никотиновой кислоты в основном занимаются исследованиями и разработками, стратегическими альянсами, а также слияниями и поглощениями для увеличения доли рынка.Основными игроками, действующими на мировом рынке никотиновой кислоты, являются:
- TCI Chemicals (India) Pvt. ООО
- Lonza Group Ltd
- Jubilant Life Sciences
- Koninklijke DSM N.V.
- Resonance Specialties Limited
- Vertellus Holdings LLC
- Zhejiang Lanbo Biotechnology Co., Ltd.
- Lasons India Pvt. ООО
Мировой рынок никотиновой кислоты: объем исследования
Мировой рынок никотиновой кислоты по конечному потреблению
- Промышленное
- Кормовые добавки
- Фармацевтические препараты
- Косметика
- Еда и напитки
Это исследование TMR представляет собой всеобъемлющую структуру динамики рынка.В основном он включает критическую оценку пути потребителей или клиентов, текущих и новых направлений деятельности, а также стратегическую основу, позволяющую руководителям по управлению бизнесом принимать эффективные решения.
Нашей ключевой основой является 4-квадрантная структура EIRS, которая предлагает подробную визуализацию четырех элементов:
- Клиент E Карты опыта
- I наблюдения и инструменты, основанные на исследованиях на основе данных
- Actionable R соответствует всем бизнес-приоритетам
- S трагические рамки для ускорения пути роста
В исследовании предпринята попытка оценить текущие и будущие перспективы роста, неиспользованные возможности, факторы, определяющие их потенциал доходов, а также структуру спроса и потребления на мировом рынке, разбив его на региональную оценку.
Комплексно охватываются следующие региональные сегменты:
- Северная Америка
- Азиатско-Тихоокеанский регион
- Европа
- Латинская Америка
- Ближний Восток и Африка
Структура квадранта EIRS в отчете суммирует наш широкий спектр основанных на данных исследований и рекомендаций для CXO, чтобы помочь им принимать более обоснованные решения для своего бизнеса и оставаться лидерами.
Ниже приведен снимок этих квадрантов.
1. Карта впечатлений клиентов
Исследование предлагает всестороннюю оценку различных путешествий клиентов, имеющих отношение к рынку и его сегментам. Он предлагает различные впечатления клиентов о продуктах и использовании услуг. Анализ позволяет более внимательно изучить их болевые точки и опасения в различных точках контакта с клиентами. Решения для консультаций и бизнес-аналитики помогут заинтересованным сторонам, включая CXO, определить карты клиентского опыта, соответствующие их потребностям.Это поможет им нацелиться на повышение взаимодействия клиентов с их брендами.
2. Анализ и инструменты
Различные идеи в исследовании основаны на тщательно продуманных циклах первичных и вторичных исследований, с которыми аналитики участвуют в ходе исследования. Аналитики и эксперты-консультанты TMR применяют общеотраслевые инструменты количественного анализа клиентов и методологии прогнозирования рынка для получения результатов, что делает их надежными.В исследовании предлагаются не только оценки и прогнозы, но и лаконичная оценка этих цифр в динамике рынка. Эти идеи объединяют основанные на данных исследовательские рамки с качественными консультациями для владельцев бизнеса, CXO, политиков и инвесторов. Эти идеи также помогут их клиентам преодолеть свои страхи.
3. Практические результаты
Выводы, представленные в этом исследовании TMR, являются незаменимым руководством для выполнения всех бизнес-приоритетов, в том числе критически важных.Результаты при внедрении показали ощутимые преимущества для заинтересованных сторон и предприятий отрасли в повышении их производительности. Результаты адаптируются к индивидуальной стратегической структуре. Исследование также иллюстрирует некоторые из недавних тематических исследований по решению различных проблем компаниями, с которыми они столкнулись на пути к консолидации.
4. Стратегические рамки
Исследование дает предприятиям и всем, кто интересуется рынком, возможность сформировать широкие стратегические рамки.Это стало более важным, чем когда-либо, учитывая нынешнюю неопределенность из-за COVID-19. В исследовании обсуждаются консультации по преодолению различных подобных прошлых сбоев и предвидятся новые, чтобы повысить готовность. Эти рамки помогают предприятиям планировать свои стратегические согласования для восстановления после таких разрушительных тенденций. Кроме того, аналитики TMR помогут вам разобраться в сложном сценарии и обеспечить отказоустойчивость в неопределенные времена.
Отчет проливает свет на различные аспекты и дает ответы на актуальные вопросы рынка.Вот некоторые из важных:
1. Какие варианты инвестиций могут быть наилучшими при освоении новых продуктов и услуг?
2. К каким ценностным предложениям следует стремиться предприятиям при финансировании новых исследований и разработок?
3. Какие нормативные акты будут наиболее полезны для заинтересованных сторон в расширении их сети цепочки поставок?
4. В каких регионах в ближайшем будущем может наблюдаться рост спроса в определенных сегментах?
5.Какие из лучших стратегий оптимизации затрат с поставщиками, с которыми некоторые хорошо зарекомендовавшие себя игроки добились успеха?
6. Какие ключевые перспективы использует топ-менеджер, чтобы вывести бизнес на новую траекторию роста?
7. Какие правительственные постановления могут поставить под сомнение статус ключевых региональных рынков?
8. Как новые политические и экономические сценарии повлияют на возможности в ключевых областях роста?
9.Каковы некоторые из возможностей получения прибыли в различных сегментах?
10. Что будет препятствием для входа на рынок новых игроков?
Обладая обширным опытом в создании исключительных рыночных отчетов, Transparency Market Research стала одной из надежных компаний по исследованию рынка среди большого числа заинтересованных сторон и CXO.Каждый отчет Transparency Market Research подвергается тщательной исследовательской деятельности во всех аспектах. Исследователи из TMR внимательно следят за рынком и извлекают полезные точки, способствующие росту. Эти моменты помогают заинтересованным сторонам соответствующим образом разрабатывать свои бизнес-планы.
исследователей TMR проводят исчерпывающие качественные и количественные исследования. Это исследование предполагает использование мнений экспертов рынка, сосредоточение внимания на последних разработках и других.Этот метод исследования отличает TMR от других фирм, занимающихся исследованиями рынка.
Вот как Transparency Market Research помогает заинтересованным сторонам и CXO с помощью отчетов:
Внедрение и оценка стратегического сотрудничества: Исследователи TMR анализируют недавние стратегические действия, такие как слияния, поглощения, партнерства, сотрудничество и совместные предприятия. Вся информация собрана и включена в отчет.
Идеальные оценки размера рынка: В отчете анализируются демографические характеристики, потенциал роста и возможности рынка в течение прогнозируемого периода. Этот фактор приводит к оценке размера рынка, а также дает представление о том, как рынок восстановит рост в течение периода оценки.
Инвестиционное исследование: В отчете основное внимание уделяется текущим и предстоящим инвестиционным возможностям на конкретном рынке.Эти события информируют заинтересованные стороны о текущем инвестиционном сценарии на рынке.
Примечание: Несмотря на то, что были приняты меры для поддержания наивысшего уровня точности отчетов TMR, недавним изменениям, связанным с рынком / поставщиком, может потребоваться время, чтобы отразить их в анализе.
Ниацин — чемпион «Холестериновых войн» может также повысить уровень гормона роста
Автор Ward Dean, MD
Исследование, проведенное в архиве Archives of Internal Medicine (Guyton, et al, 2000), подтверждает мою давнюю веру в превосходство ниацина (витамина B3) как гиполипидемического средства.Запатентованную версию ниацина с ограниченным высвобождением (Ниаспан) сравнивали с фармацевтическим препаратом гемфиброзил (Лопид). В исследовании приняли участие 399 мужчин и женщин в возрасте от 21 до 75 лет, у всех был низкий уровень ЛПВП (липопротеинов высокой плотности — «хороший холестерин») менее 40 мг / л.
Другими критериями включения в это исследование были уровень триглицеридов менее 400 мг / л и ЛПНП (липопротеины низкой плотности — «плохой холестерин») менее 260 мг / л. Ниацин вводили один раз в день перед сном.Дозировка ниацина начиналась с 375 мг / день, затем постепенно увеличивалась в ходе исследования и поддерживалась на уровне 2000 мг каждую ночь в течение 8 недель. Продолжительность исследования составила 16 недель. Субъекты принимали аспирин по мере необходимости, чтобы предотвратить покраснение. Гемфиброзил 600 мг вводили два раза в день в течение всех 16 недель.
Ниацин повысил уровень ЛПВП более чем на 25% по сравнению с увеличением на 13,3% за счет гемфиброзила. Гемфиброзил на самом деле повысил уровень ЛПНП («плохой» холестерин, помните?), В то время как ниацин немного снизил эту фракцию.Гемфиброзил снижает уровень триглицеридов на 40% по сравнению с 30% снижением от ниацина. Таким образом, ниацин привел к общему улучшению липидного профиля, которое превышало индуцированное гемфиброзилом (рис. 1).
Однако ниацин благоприятно изменил и несколько других факторов риска сердечно-сосудистых заболеваний. Уровни аполипопротеина (а) были значительно (20%) снижены ниацином, но не изменялись гемфиброзилом. Оба вещества снижали уровень аполипопротеина (b) в сыворотке на одинаковую величину.Фибриноген, третий фактор риска, снижался при приеме ниацина, но повышался на 6–9% при приеме гемфиброзила. Авторы пришли к выводу: «Ниаспан, 2 000 мг, оказывал значительно лучший эффект на уровень фибриногена, чем гемфиброзил».
Эти результаты подтверждают многие предыдущие исследования использования ниацина в качестве нутриента, снижающего уровень липидов. Например, в проекте Coronary Drug Project, в который были включены мужчины, перенесшие инфаркт миокарда, употребление ниацина привело к сокращению числа повторных сердечных приступов без смертельного исхода на 26% за шестилетний период и к снижению общей смертности на 11% через 15 лет. лет наблюдения (Canner, et al, 1986) (рис.2).
Ниацин стимулирует гормон ростаПревознося преимущества ниацина, один часто упускаемый из виду «побочный эффект» заключается в том, что ниацин является мощным высвобождающим гормоном роста гормона (Quabbe, et al, 1983) (рис. 3). Куаббе и его коллеги вводили людям 500 мг ниацина внутривенно и отметили резкое повышение уровня гормона роста. На втором этапе исследования они одновременно вводили вливание жирных кислот. Обратите внимание, что жир полностью подавлял рост гормона роста.Практический урок этого исследования заключается в том, что любой, кто использует ниацин в качестве стимулятора гормона роста, должен принимать его натощак (глюкоза и инсулин также подавляют гормон роста, а также жирные кислоты).
Побочные эффекты и противопоказания к применению высоких доз ниацинаНиацин в высоких дозах очень безопасен. Его наиболее частый «побочный эффект» — безобидное покраснение кожи, сопровождающееся зудом. Этот эффект обычно проходит через несколько дней или недель использования.Прием аспирина за 30 минут до приема ниацина также помогает уменьшить этот эффект. Другой способ минимизировать покраснение — начать с низких доз (50–100 мг) и постепенно увеличивать дозу по мере переносимости. Наконец, также можно использовать гексаникотинат инозита (IHN) — еще одну не смывающую форму ниацина. IHN, хотя и немного дороже, чем ниацин, эффективен в несколько меньших дозах, тем самым оставаясь рентабельным. Другой побочный эффект — это возможность повышения активности печеночных ферментов или токсичности для печени.Токсичность для печени встречается редко и чаще всего возникает при применении препаратов с замедленным высвобождением.
Любому, кто собирается начать терапию ниацином в высоких дозах, вероятно, следует проверить печеночные ферменты в течение нескольких месяцев после достижения терапевтических уровней (1500–3000 мг). Единственное абсолютное противопоказание к терапии ниацином — инсулинозависимый диабет. Ниацин усугубляет проблемы с сахаром в крови у инсулинозависимых диабетиков, еще больше усугубляя их липидные проблемы, обычно вызывая резкое повышение уровня триглицеридов.В качестве альтернативы я рекомендую ниацинамид (также содержащийся в Optimum D) в дозах до трех граммов в день для инсулинозависимых диабетиков. Хотя ниацинамид обычно не влияет на уровень липидов у людей, не страдающих диабетом, из-за его эффекта стабилизации глюкозы у диабетиков он имеет тенденцию нормализовать уровень липидов в крови, особенно триглицеридов.
ЗаключениеНиацин снова становится недорогим и высокоэффективным средством для снижения уровня холестерина, повышения уровня ЛПВП и снижения уровня ЛПНП и триглицеридов.Кроме того, он обладает дополнительными преимуществами в виде снижения уровня аполипопротеинов А и В, фибриногена и повышения уровня гормона роста. Мунтони (1974) заявил, что «липостатические» вещества являются предпочтительными агентами для замедления старения, и ниацин вполне может быть лучшим веществом в этом классе (Dilman and Dean, 1992).
Список литературы
Каннер П.Л., Берге К.Г., Венгер Н.К. и др. Пятнадцатилетняя смертность пациентов проекта Coronary Drug Project: долгосрочная польза от приема ниацина. Дж. Ам Колл Кардиол, 1986, 8: 1245-1255.
Дилман В. и Дин В. Нейроэндокринная теория старения и дегенеративных заболеваний, 1992, Центр био-геронтологии, Пенсакола.
Гайтон, Джон Р., Блейзинг, Майкл А., Хагар, Джеймс и др. Ниацин с пролонгированным высвобождением по сравнению с гемфиброзилом для лечения низкого уровня холестерина липопротеинов высокой плотности. Arch Intern Med, 2000, 160: 1177-1184.
Горовиц, Н. Связь ниацина с долголетием после инфаркта миокарда. Medical Tribune, 1985, 26: 12, стр. 1, 17.
Мунтони, С.Ингибирование окисления жирных кислот бигуанидами: значение для метаболической физиопатологии. Adv Lipid Res, 1974, 12: 311-377.
Quabbe, H.J., Ramek, W., and Luyckx, A.S. Концентрация гормона роста, кортизола и глюкагона во время депрессии свободных жирных кислот в плазме. Различные эффекты никотиновой кислоты и производного аденозина. J. Clin Endocr Metab, 1983, 57: 410-414.
Отчет об анализе рынка никотиновой кислоты (витамина B3) за 2021 год: текущие тенденции в отрасли, статистика, доля и размер, ожидаемый среднегодовой темп роста, данные ведущих игроков и анализ будущего развития и перспектив до 2027 года
Отдел новостей MarketWatch не участвовал в создании этого контента.
16 апреля 2021 г. (Expresswire) — «В окончательный отчет будет добавлен анализ воздействия COVID-19 на эту отрасль».
Исследовательский отчет « Рынок никотиновой кислоты (витамин B3) » был составлен таким образом, чтобы охватить ключевую динамику рынка в этой отрасли, охватывая исторические, текущие и прогнозируемые данные, текущие рыночные тенденции и будущие рыночные возможности. . В отчете освещаются недавние разработки, в том числе грядущие технологии, партнерства, сделки, слияния и поглощения, которые помогут читателям лучше понять отрасль, тем самым помогая им сформулировать стратегические инвестиционные планы.Отчет также охватывает денежно-кредитные и валютные колебания, импортно-экспортную торговлю и состояние мирового рынка в простой манере.
Получить образец отчета в формате PDF — https://www.industryresearch.biz/enquiry/request-sample/17807131
Объем обзора рынка никотиновой кислоты (витамина B3):
Анализ рынка и аналитические данные : Мировой рынок никотиновой кислоты (витамина B3)
Ожидается, что мировой рынок никотиновой кислоты (витамина B3) будет расти значительными темпами в течение прогнозируемого периода с 2022 по 2027 год.В 2021 году рынок будет расти стабильными темпами, и с ростом числа стратегий, используемых ключевыми игроками, ожидается, что рынок вырастет в течение прогнозируемого периода.
В отчете об исследовании изучается рыночная доля никотиновой кислоты (витамина B3) с использованием различных методологий и анализов, чтобы предоставить точную и всестороннюю информацию о рынке. Для более четкого понимания он разделен на несколько частей, охватывающих различные аспекты рынка. Этот отчет направлен на то, чтобы направить людей к более глубокому и ясному знанию рынка.В отчете указаны различные ключевые производители на рынке. Это помогает читателю понять стратегии и взаимодействия, которые игроки сосредотачивают на борьбе с конкуренцией на рынке.
Основными участниками рынка никотиновой кислоты (витамина B3) являются:
● Aarti Drugs
● Brother Enterprises Holding
● DSM
● Jubilant Life Science
● Lanbo Biotechnology
● Lasons
● Lonza
● Nantong Уксусная кислота, химикат
● Red Sun Group
● Resonance Specialities
● Tianjin Zhongrui Pharmaceutical
● Vanetta
● Vertellus
Чтобы понять, как влияние Covid-19 освещается в этом отчете — https: // www.industryresearch.biz/enquiry/request-covid19/17807131
Мировой рынок никотиновой кислоты (витамина B3): движущие силы и сдерживающие факторы
В исследовательский отчет включен анализ различных факторов, способствующих росту рынка. Он представляет собой тенденции, ограничения и движущие силы, которые трансформируют рынок в положительную или отрицательную сторону. В этом разделе также представлены различные сегменты и приложения, которые потенциально могут повлиять на рынок в будущем.Подробная информация основана на текущих тенденциях и исторических событиях. В этом разделе также представлен анализ объема производства на мировом рынке и по каждому типу за период с 2016 по 2027 год.
Тщательная оценка ограничений, включенных в отчет, показывает контраст с движущими силами и дает возможность для стратегического планирования. Факторы, которые омрачают рост рынка никотиновой кислоты (витамина B3), имеют решающее значение, поскольку их можно понять как создание различных способов использования прибыльных возможностей, которые присутствуют на постоянно растущем рынке.Кроме того, были проанализированы мнения экспертов рынка, чтобы лучше понять рынок.
Запросите этот отчет перед покупкой — https://www.industryresearch.biz/enquiry/pre-order-enquiry/17807131
В этом отчете на основе типа продукта отображается производство, выручка, цена , рыночная доля и темпы роста каждого типа, в основном разделенные на:
● Ниацин снижает уровень холестерина
● Прочие
На основе конечных пользователей / приложений в этом отчете основное внимание уделяется состоянию и перспективам основных приложения / конечные пользователи, потребление (продажи), доля рынка и темпы роста для каждого приложения, в том числе:
● Кормовые добавки
● Продукты питания и напитки
● Фармацевтика
● Промышленное производство
● Daily Chemicals
Никотиновая кислота (Витамин B3) Рыночная конкурентная среда предоставляет подробную информацию и данные по игрокам.Отчет предлагает всесторонний анализ и точную статистику доходов игрока за период 2016-2021 гг. Он также предлагает подробный анализ, подкрепленный надежной статистикой по выручке (на глобальном и региональном уровне) игроков за период 2016-2021 гг. Подробная информация включает описание компании, основной бизнес, общий доход и продажи компании, выручку от никотиновой кислоты (витамина B3), дату выхода на рынок никотиновой кислоты (витамин B3), выпуск продукта на основе никотиновой кислоты (витамина B3), последние разработки и др.
Получите образец отчета о рынке никотиновой кислоты (витамина B3) за 2021-2027 годы
Некоторые из ключевых вопросов, на которые даны ответы в этом отчете:
● Что является глобальным ( Северная Америка, Европа, Азиатско-Тихоокеанский регион, Южная Америка, Ближний Восток и Африка ) стоимость продаж, стоимость производства, стоимость потребления, импорт и экспорт никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Кто являются основными мировыми производителями никотиновой кислоты (витамина B3)? Какова их операционная ситуация (мощность, производство, продажи, цена, себестоимость, валовая прибыль и выручка)? ● С какими возможностями и угрозами на рынке никотиновой кислоты (витамина B3) сталкиваются поставщики в мировой индустрии никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Какое приложение / конечный пользователь или тип продукта могут иметь перспективы для постепенного роста? Какова рыночная доля каждого типа и приложения? ● Какой целенаправленный подход и какие ограничения сдерживают рынок никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Каковы различные каналы продаж, маркетинга и распространения в мировой индустрии? ● Каковы исходные материалы и оборудование для производства никотиновой кислоты (витамина B3), а также процесс производства никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Какие основные рыночные тенденции влияют на рост рынка никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Экономическое влияние на индустрию никотиновой кислоты (витамина B3) и тенденции развития индустрии никотиновой кислоты (витамина B3).● Каковы рыночные возможности, рыночный риск и обзор рынка никотиновой кислоты (витамина B3)? ● Каковы основные движущие силы, ограничения, возможности и проблемы на рынке никотиновой кислоты (витамина B3) и как они, как ожидается, повлияют на рынок? ● Каков размер рынка никотиновой кислоты (витамина B3) на региональном и национальном уровне?Приобрести этот отчет (цена 4000 долларов США за однопользовательскую лицензию) — https://www.industryresearch.biz/purchase/17807131
Годы, рассматриваемые для этого отчета:
Исторические годы: 2016- 2020
Базовый год: 2020
Расчетный год: 2021
Период прогноза рынка никотиновой кислоты (витамина B3): 2021-2027
Таблицы и цифры помогают анализировать глобальную никотиновую кислоту (витамин B3) рыночных тенденций, это исследование предоставляет ключевую статистику о состоянии отрасли и является ценным источником рекомендаций и указаний для компаний и частных лиц, заинтересованных в рынке.
Некоторые моменты из TOC:
1 Обзор рынка никотиновой кислоты (витамина B3)
1.1 Никотиновая кислота (витамин B3) Объем продукта
1.2 Никотиновая кислота (витамин B3) Сегмент по типу
1.2.1 Глобальная никотиновая кислота (Витамин B3) Продажи по типу (2016, 2021 и 2027)
1.2.2 Тип 1
1.2.3 Тип 2
1.3 Никотиновая кислота (витамин B3) Сегмент по применению
1.3.1 Глобальное сравнение продаж никотиновой кислоты (витамина B3) по заявкам (2016 и 2021 и 2027 годы)
1.3.2 Приложение 1
1.3.3 Приложение 2
1.4 Оценки и прогнозы рынка никотиновой кислоты (витамина B3) (2016-2027)
1.4.1 Мировой размер рынка никотиновой кислоты (витамина B3) в темпах роста стоимости (2016-2027)
1.4 .2 Объем мирового рынка никотиновой кислоты (витамина B3) в объемном темпе роста (2016-2027)
1.4.3 Глобальные тенденции цен на никотиновую кислоту (витамин B3) (2016-2027)
2 Оценка никотиновой кислоты (витамина B3) и Прогнозы по регионам
2.1 Объем мирового рынка никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам: 2016 VS 2021 VS 2027
2.2 Ретроспективный сценарий глобального рынка никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам (2016-2021)
2.2.1 Доля мирового рынка никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам (2016-2021)
2.2.2 Глобальная никотиновая кислота (витамин B3) Доля рынка выручки по регионам (2016-2021)
2.3 Оценки и прогнозы мирового рынка никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам (2022-2027)
2.3.1 Оценки и прогнозы мировых продаж никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам (2022- 2027)
2.3.2 Глобальный прогноз доходов от никотиновой кислоты (витамина B3) по регионам (2022-2027)
2.4 Географический анализ рынка: факты и цифры рынка
2.4.1 Оценка и прогнозы по никотиновой кислоте (витамин B3) в Северной Америке (2016-2027)
2.4.2 Оценка и прогнозы по никотиновой кислоте (витамин B3) в Европе (2016-2027)
2,4 .3 Оценки и прогнозы по никотиновой кислоте (витамин B3), Китай (2016-2027 гг.)
2.4.4 Оценка и прогнозы по никотиновой кислоте (витамин B3), Япония (2016-2027 гг.)
2.4.5 Оценка содержания никотиновой кислоты (витамин B3) в Юго-Восточной Азии и Прогнозы (2016-2027)
2.4.6 Оценка и прогнозы никотиновой кислоты (витамина B3) в Индии (2016-2027)
3 Глобальная конкуренция по никотиновой кислоте (витамин B3) по игрокам
3.1 Мировые лидеры продаж никотиновой кислоты (витамина B3) по продажам (2016-2021)
3.2 Крупнейшие мировые игроки рынка никотиновой кислоты (витамина B3) по выручке (2016-2021 гг.) Кислота (витамин B3) по состоянию на 2020 год)
3.4 Глобальная средняя цена никотиновой кислоты (витамина B3) по компаниям (2016-2021)
3.5 Производственные площадки производителей никотиновой кислоты (витамина B3), обслуживаемая территория, тип продукта
3.6 Слияния и поглощения производителей, планы расширения
4 Глобальная никотиновая кислота (Витамин B3) Размер рынка по типу
5 Мировой размер рынка никотиновой кислоты (витамин B3) по приложениям
6 Факты и цифры рынка никотиновой кислоты (витамина B3) в Северной Америке
7 Факты и цифры рынка никотиновой кислоты (витамина B3) в Европе
8 Цифры и факты о рынке никотиновой кислоты (витамина B3) в Китае
…………………………………………
12 Профили компаний и ключевые показатели в бизнесе никотиновой кислоты (витамина B3)
12.1 Профиль компании 1
12.1.1 Профиль компании 1 Информация о корпорации
12.1.2 Профиль компании 1 Обзор бизнеса
12.1.3 Профиль компании 1 Никотиновая кислота (витамин B3) Продажи, выручка и валовая прибыль (2016-2021)
12.1. 4 Профиль компании 1 Предлагаемые продукты с никотиновой кислотой (витамином B3)
12.1.5 Профили компании 1 Последние разработки
12.2 Профили компании 2
12.2.1 Профили компании 2 Информация о корпорации
12.2.2 Профили компании 2 Обзор бизнеса
12.2.3 Профили компании 2 Продажи, выручка и валовая прибыль от никотиновой кислоты (витамина B3) (2016-2021)
12.2.4 Профили компании 2 Предлагаемые продукты с никотиновой кислотой (витамином B3)
12.2.5 Профили компании 2 Последние разработки
12.3 Компания Профили 3
12.3.1 Профили компании 3 Информация о корпорации
12.3.2 Профили компании 3 Обзор бизнеса
12.3.3 Профили компании 3 Продажи, выручка и валовая прибыль никотиновой кислоты (витамина B3) (2016-2021)
12.3.4 Компания Профили 3 Предлагаемые продукты с никотиновой кислотой (витамином B3)
12.3.5 Профиль компании 3 Последние разработки
………………………… ..
13 Анализ производственных затрат на никотиновую кислоту (витамин B3)
14 Каналы сбыта, дистрибьюторы и клиенты
15 Динамика рынка
16 Результаты исследований и выводы
Продолжить ………………
Подробная информация о ТОС глобального рынка никотиновой кислоты (витамина B3) @ https://www.industryresearch.biz/TOC/17807131
О нас:
Рынок быстро меняется с продолжающимся расширением отрасли.Развитие технологий предоставило сегодняшним предприятиям многогранные преимущества, приводящие к ежедневным экономическим сдвигам. Таким образом, для компании очень важно понимать закономерности рыночных движений, чтобы лучше разрабатывать стратегию. Эффективная стратегия предлагает компаниям преимущество в планировании и преимущество перед конкурентами. Отраслевые исследования — это надежный источник отчетов о состоянии рынка, которые помогут вам понять, в чем нуждается ваш бизнес.
Контактная информация:
Имя : Mr.Ajay More
Эл. Почта : [email protected]
Организация : Industry Research Biz
Телефон: США +1424 253 0807 / UK +44 203239 8187
Наши другие отчеты:
Объем мирового рынка оборудования для испытаний резины, доля в 2021 году: исследования с использованием бизнес-анализа, растущий среднегодовой темп роста, развитие, тенденции, стратегия роста, отраслевые тенденции и прогноз до 2024 года
Закрытие рынка электромобилей и ДВС и прогноз доли на 2021-2027 годы Участники, рост, тенденции и методология исследования, а также анализ региональной сегментации с влиянием Covid-19
Обзор мирового рынка упаковщиков для меда 2021: ведущие производители в отрасли, размер, доля, тенденции в технологиях, планы развития, бизнес-статистика, региональный анализ и прогноз роста до 2025 года
Последний отчет об исследовании мирового рынка умягчителей воды, подготовленный ведущими игроками на 2021 год — статус разработки, среднегодовой темп роста 4.8%, Новые технологии, влияние Covid-19, факторы экономического роста, прогноз до 2027 г.
Размер рынка поручней для унитазов на 2021 г .: бизнес-анализ по ведущим производителям, новейшие технологии, состояние спроса, оценка доли, обзор регионального роста и прогноз до 2025 г.
Пресс-релиз, распространенный Express Wire
Чтобы просмотреть исходную версию Express Wire, посетите Отчет об анализе рынка никотиновой кислоты (витамина B3) за 2021 год: текущие тенденции в отрасли, статистика, доля и размер, ожидаемый среднегодовой темп роста, данные и анализ ведущих игроков перспектив развития и перспектив до 2027 г.
COMTEX_384545978 / 2598 / 2021-04-16T06: 34: 52
Есть ли проблемы с этим пресс-релизом? Свяжитесь с поставщиком исходного кода Comtex по адресу editorial @ comtex.com. Вы также можете связаться со службой поддержки клиентов MarketWatch через наш Центр поддержки клиентов.